| Id Trinity | TRINITY_DN52136_c0_g2_i10 |
|---|---|
| Name Transcript | Ll_transcript_431947 |
| Sequence | CTTAAAGGAAAATAAAACATGTAGTCAAATTGGATAGGTGATATTAAATCATAAAAATATATAGAAATGAAATTGGCAAGAATAAGGAGGAGGAGGGATA TATAACGTGTGTGATGAGTCTATTATTGATTGTCCCCTTCTCGGTGTGAAGTTAAAATCCCTCTTTTCCTCTCACAACAACTGAACCCAGGTTTGAGGCC TGGTTCAAGCACCACCATCACCCGAAATTCTAATCTCACGTGCCCCTCTTACCCATTGTGGCCTGCTGATTCTCTGTTCAGATGTCCAATAATCCGCAAT TTCCGGGCCTACAGCCCCTTCGGCCTCCCATAGGTGGTTCTGGGGATCCTCAACGCAATTTTGCTCCACCCATGCATATTCAATACCGACATGTTGTTCC TACTCAGCAGTCACAACAGTTCATTCCCATGCCTTCTCAACATTACCAACCTACTGGCCATGGAGTTCCCATGATTAACGTTGGAATGCCTCCTCAAAAT CCAAACCCCCAATTTTCTCAGCCAATTCAACAGTTGCCTCCAAGGCATAGTCAGCCAATGCCACTCCCACCACAGGCAATTCCATTGCCAGCTGCTAGGC CAAATCTGCATATGTTGTCAGAACCAAAAATGGCTCAGGCTGATTCTCAAGCTCCAAATGGCTACACACCAGGTTTAGGTGGCTCGGGAACGCCACTCTC TTCATCATATACGTTTGCACCATCCTCTTATGGTCAGATGCAAACTAATTTTGTTTCTACCGGCCAATACCAATCTGTTCCTCACACTGGTTCTTCTCAG AGCATTACCTCTGGCACATTTATTCAGAGCAACGGCGAACAACCTTCAGTTACAAATGCCATGGCTTCAGCAACCAATCTCCAGCCTCCCCCTGCTATGA ATGATTCCACAGATTGGATCGAGCATACATCTGCAACTGGGAGAAGATTTTACTATAATAAGAAGACCAAACTATCTAGCTGGGAGAAGCCTTACGAATT GATGACACTAGTTGAGGTGAGTCATGCAATTGATTTTCCATTCATGTTATGTAATGAGTTGTTAGTCATACGACTGGATCTTATATTTTTTATTTTAGTT TTGGTGAATGCTGTTACACGTGCATCTCTTTTGGTCTTATTCAATATTAAATGGGGTCAACATATTCAAGTTTAATTGTTATATGCTTTTTATTTGACCA TGTCTGGTGAAAATATGCCGCTCTGTTAGCTCACTCATTACTGAACGGGTTTTCTCTCAGGCAGCAACCATCAATCTTGACTTTTACCTCTTATTGTAAG GTCAGTGTTGTGATAATTGTCGGTTGGACTGTCTGATATCAGTTTTTTTGTTTTCTTTGGATGCTGCAGTATAAGAATTTTGTATTGCATGTATTTGAAT TTTTAAATCTTGAATAAATATTATGCTCTATACATCATAAGGAACATCAGAAGTAAAACATTTTTTTACTATTTTGTGATTTCTTTCTTATGGTCGCTCA CATGCCTTGTATAGAAAGGTTATGTTTATTTGTTAAGGTTAGCTTATAAAAGAGAGTAGTCTTCCACTTTCTCTTCCTCTATCCCCTTCAAGTGTGTACA CATATTTGCGTTTCTCTTTAATATGATTTGAGAGTAGGTGATTGCTGACTAAAGAAGATATGTCCTGTGTCCTATTCTTTTCTAATCATGGTGCCAGACA AATGCTAAGGAGATTTCTTTTGACACACATAGGCTAATTTAATTTATTATACTCAAAGATAAGCATCAAAGTAGATAAGTTTCGGTAAATATTTTGTGCC TATGAATGTTTGTTTTTTGCTAGTGTCATTCCATGCTCTCAAAGTTGATGATTTTTTAATTTCTTTAGGACTTGATATATTTCATTTTTACTTTAACCAA GTCTACATGTGTGACTTCCTTAGTGTTAAGATGCTTACAGGTACATGTTGTGCTCCTCTTTTGAGAGGTAGGATATGCTGTGGGGTGTAACTGCCTGCTA CCCTACTATATCGCTTGAATGTTAGTAAATTTCATCATTGTATTTTGTCTTGATTGTTAGTTCCTTGTCTGAAAATCCCGTCTTTATTTATCCAAAGTGT GATCGCCAGTCATCACTTGCTTCTAAACCTTGGTGCAATTTTAATTCTATAATCTATTACACTATCAGTTTCGTATGTCTTGATTATTTAAGAGAGCTGT TAATGTCTTTGAGTAAAATAGTCCATCCAAAGGAATACTTGCAAATATCCTTTGATTGAAATAAATGCAATATTTAGAATATAGGTATTGATTTTTTTTG TACTGCTCTGGCTTAGACTTTCGAGCTTGGGTTTCTGCTGTGGAAATCAGTCAGTTTGTTTTCTATTTCTGATTTTAGGATCTTATGAATAACTGCTGTA AATGATTGTTATAAAAGAACTTCATAGTTGCATCTATTTATTAACTTGGTACAAGTTAAGGTATAATTACATGGCCATGGTTCAGAACTTTGTGTCCAGT ATCTATGAATTATTTAGCTTCCTGTCAACACAATATACTTTGTTGGGAGGATTATAAGTAGCAAGATGAGCTTGGTGATGCCAGTAAAATGGTTTAGTGC ATTCTGATTTTCTATTAATTTATTGGTAGGAGTAGAATTAATAATATGGCAATGTGGAAGATGACTCAACTACAACCGGTACTACAACTTCAAAGTTTCT CCTAAATTAGACATTTTCCATACAAGAATAATGTTTACAAGTTCTTATAAAAAAAGAATAATGTTTAAAAGCTATAATTTATGCAATATATGATCTCTAA AATTTCTGTATCATAGATAACCAGTTTCCTTAAATATTTGATGGATTTTCACTGGGTTCTGGAGTCATAGGGAGTTCAAGTTCATAAAATATCACTGAAC AGTTTTTTGCCTCAGAGGTATGAAAATGTAAGAAGATTTATGTGGGTTAGTTTTCTCAGTGCTTGATGTGAGTTCAGTTGTCGTGATTGACCCTTTACTT AGACCTTTTATTTCCTGGATTTTCTGTTCTGTCTTTCATATACTTTGGGATATTTGAATTTCCAATTTCTATTATGAGATAGCTACCATTCTCCATATAG CTGTCATTTTTCTATTGGAAGGAAACCTCTAATGAGAAATTATCCACTTTTTTGCGTTCTTGTCATTTTGCTAGAGGGTGGATGCATCAACAAACTGGAA GCAGTATTCTAGTCCAGATGGAAGAAAGTATTACTACAACAAAGTTACCAAGGAATCCAAGTGGTTAATTCCCGAGGAACTGAAGTTGGCTCGTGCGCAA GTTGAAAAGGCTGCTGTGAATGGAACGTATCCTGAAGCTATACTGATTCCTCATTCTCAACCATCTGCATGTCCTCAAGTTGTTGAAGCAACACCTGGTG CAGATATTTCATCTTTAACTGCTCCAGGAGATCCAACAAGTCCTGTTTCTGTTGCTCCTGTTGGTACTGCATTTACAAATAATCTTCAACCTGAGATTAC TTCAGGATCACCTGCCTTTCCTTCCGTGGTCCCTCAAACTGGAACAAAGGTGGAAGAAGTTGAGGCACCTGAAAATACTGTCAAACCATCAGATGCTGGT GTGGGAAGGGATGGAGCTTCTGTTACCGATATTAATACTGCTAAAACACTGATGGATGGTGCCAACAATATTTCAGTTCAGTATACTCAAGGTTCTGCGG ATGGAGTTCCAGCAGAAGATAAAGAAGATGGTAAAACTGATTCATCAAGAGAGAAAACTGATGATGTGGCTTCAGAAACAAAAGCAGTTGAGCCTGAGCC TTTAGTTTATGTGAATAAGATGGGGGCTAAAGACGCATTCAAAGCACTACTGGAGTCTGTAAATGTTGGATCTGACTGGACTTGGGATCGGACTATGCGA GTAATAATTAATGACAAAAGGTACGGCGCCTTGAGAACACTTGGAGAAAGGAAGCAAGCTTTCAATGAGTACTTAAATCAGAGGAAAAAACAGGAAGTGG AAGAAAAGCGTATGAAACAAAAGAAAGCTCGGGAAGATTTTAAGAAAATGTTAGAAGAATCCACAGAGTTGACTTCATCCACTAGATGGAGCAAAGCTGT GCCTATATTTGAAAATGACGAACGTTTCAAGGCTGTTGAGCGTGACAGAGACCGCAGGGATATGTATGATAGCTTCATGGAGGACCTTGGTAACAAGGAA CGAGCAAGGGCACAGGTGGAACGAAAGCAGAATTTGATGGAATTCAGGATGTTTTTGGAATCTTGTGACTTTATAAAGGCAAGCACACAATGGCGAAAAG TTCAAGACCGCTTAGAGGCTGATGAAAGATGTTCCCGTCTTCAGAAAATTGATCGCTTGGAAATATTCCAAGACTGTTTACATGATTTAGCGAAGGAAGA AGAAGAGCAGAAAAAGATACAAAAGGAAGAATTGAGAAAGACGGAACGTAAAAACCGTGATGAATTTCGCAAATTGATGGAAGAACATGTTGCTGCAGGC ATTCTTACAGCAAAAACTAACTGGCGCGATTATCATTCAAAGGTCAAGGATTTACCTGCTTATATAGCAGCAGCATCCAATACCTCAGGTTCGATTCCAA AAGATTTGTTTGAAGATGTTGTTGAAGAGCTAGAGAAACAATATAATGAAGAGAAGAGTCGAATAAAAGATGCAGTGAAGTTGGCAAAGATCACTTTGTC ATCAACCTGGAATTTAGAGGCCTTCAAATCAGCTTTATCAAAAGATATTAGCTCTCCGCCTATATCTGAGATTAACTTAAAGGTAGGTACATCAGCAGCA TGTATTTATTTATCTTTTGTTTCTATGCTTTCCAATATTTATCTTTTGTTTCCCCATGTTATTTTGGGCATTCTATATAAAATAATGGTTATAACTTATA ACCAATATGCTGATCTGCACCTCTTTATACTAATACCTTGACTGCTACTAAAGACCAAAAGGTTGTTAGTAAATATATCATTACTTATTACTTAACCCAA AGTAAGAAACCTCAGTGGTCATCATGATGCCAGTGGCTGATTCATGGTTTTGAAAACAATAGGTTGAGGGGATAGTTCAAAGTTTAACAATTCAACTGTG GTTGAACTATGGCCGAACCAGAGTTTACACACACCTACACACCGATCAAATATATAACATTATTAAAGATAAACATAAAGATATCATTGTTTATTGATGA TAAAGGGGATGTAGAAAGTTTGAACCCAATTCTTACATTGATGAATACAAGTTCAATTGAGATCCCTTGGGAATTGTACATTTATGTATTGATAAGACCA TTCTTTGTTTCCTGAAGGTTGATCTCTACCCCGGATGAACCATATAGCAGAGAGAAACCATGAACCAGAATAGAAGAGTTTGCCACATCACTGAGTGAAT ATTTCGTAATAGCAGCCTTGTTAGACTCTACATAATTCTTGGTATATCCAGATAGTAAGTAGAAGCATAAATTGAAGAATTGTATAGCTACAAAAATAGT TATTAAATCGTTTAGGGTATATTCCTCCTAGAGTAGCTGCTAATAGCCTAATACGAATAATAGAAACTCAAAAGTTTGGAGAACACCTTTCAAATAAAAA ACAGGTTTGCATTTTGTATCCCATGGGTACCAACAAGCTACTATCTGTATGCCTAAGATTTGATCTGTTATTTGATTTGATTCTTCAATAAGTTCAACTC CCATATTGAGTTAGTTGTAAAGCAAGAAAGTATTGCTGTTGTGGTGCCCAGTGCTTCCTGGTCTGTATTGTAGTTATTATGCTACTTAATGCATGCAAAT TATAAGTCCCTTATCAGTCAGTGAGTGGAACATCCAAGCATACATGTAGAAACATTTTTGTTTGCCTATTGGGCCATCCCATTATGTGCCTCTCGTCCTA TCGCAAATCCCAACCTTTTGTTATATGTATCCTTCTTTTTTGCTTCTGGCCCTCTTTTTGGCTGCTGGGCTTTTTTTTTATAAAAAAGTTTGCCCTCCAA ATCTGTTAACCAGTTACACTATTATTCAACTGGCTGGTTTAGTCTCACATTTGGAACTACGGTTCCAATGGTCTAAATTTGCTTCATACTTGATAAATCA CATTGCTTTGTGTGCAGTTTCCTTTTGATATTTTGATACACCAACAATCTTATCTGCTCACTTTATTGTTGAAGCTGAACCGTAAATTTAGTTATTACTT GTTAAGCAAACAAGAGATAAATGAGCCATATAAAGGCATGGCTTGCTTTCGCTCCAGCAATTTGTGCCCACAAACACAATTGTGGATTAAATCTGTTTAG CACATTTATGTTTCTATTGGACATGGTAGATTATACCCTACCTTATTCCACTATGGAAGGTTGATTTGATTTACATTTTAAGCTTCTATACAAGCAAATA TCTAGGTCATAATTTCTTGGCATTTACCACCCACCCTCTCTTGAATCTTTGCTAATAGTATGAGATGCTAGTAGACTCAATAAAATGCTTTAATGGAATG ATCATAAACCGTATAAAATGCTTAAACTATTCACTTGGTGTCAAACTTCTTTGTCTTGGTCTTGGATGGAATTAGCTCAAATAAGAATGTTGTCAATCAA TATGCAAAATTTGACTTTTATGAATATACTTTGTTCACCATGGTCAGTGATTGTCCTCATCTTTCTTTTGAATCATTTTGGTGAGGTCTTAAATGATAAA GGTATTGTATCTGTTGATCAGATTGAGTTTTTCAGTATTAATTTTAATAGTTCTTCACTTAAAATATGTGCCTCCATGTCTGGTGTGATGCTGTGCTATC CGCAGCTAGTGTTTGATGAGCTACTGGAACGGGCAAGGGAGAAGGAGGAGAAGGAGGCTAAGAAGCGTAAACGGCATGCAGATGATTACTTTCATCTACT GTGTTCTACTAAGGACATTTCTGCATCTTCAAAGTGGGAGGACTATAAACCACTTATCGAAGATAGTCAAGAGTTCAGATCTATTGGAGATGAAAGCCTT TGCAAGGGATTATTTGAGGAGTACATTATACAACTGAAAGAAGAGACAAAAGAGAATGAGTGGAAACGGAAGGAGGAGAAGGCAAAGAAGGAGAAGGATA AGGAGGATAGAGAAAGAAGGAAAGGTAAGCAAAGAAGGGAAAAGGAGGGAGGGCGTGAAAGAGAGAAAGGCGAGGCACGTGTGAAGGATAAAGCAGACAG TGACAGTGCAGACAAAAGGTCTGAAGATGGTAGTAGAAAACAACGGAGACAGCAAAGTCCTGAGGATCTTTCTCATGAAAAGGAGAAAGAGAGGTCTAAG AAATCTCATGGGCACAGTAGCAGCCGCAAAAAATCAAGACGGCACGGTCATGAATCGGATGAAAGCAGGCACAAAAGACACAAGAGAGACCACCACAGTG ATTCTCACAGAGAAGGTGATTATGGAAATGTTGAAGATGGGGAGCATGGTGATAATGTGGTGGATAGATGGTAGTCATTTTAATTTATTTTGAACTCCTG CAGTTACCTTTTGTTTGACTCAATATATGAATTGTCCATCTTGGTGGGGATGTAAAACCATTTTTTGAGGACCAAGACAAAATTGTTCCTATCTCATAGG GATTAAAAATTATTTGTACACTTAAAATGGATACTTTTTACTTTGAGAAAAGAATGACATATATTTAATGTACTATTTTGAGGATTACCAAATATTTTTG GCATGGTAGAGCCATCAAAA BLAST |
| Tissue | pods |
| Gene name | LI_gene_190362; |
| Additional information | details; |
| PAB | abscising pods |
| PNAB | non-abscising pods |
| PS1 | seeds stages 1-3 |
| PS2 | seeds stages 4-6 |
| PS3 | seeds stages 7-8 |
| PW1 | pods wall stages 1-3 |
| PW2 | pods wall stages 4-6 |
| PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_431947
| Blastp | Pre-mRNA-processing protein 40A from Arabidopsis with 60.11% of identity |
|---|---|
| Blastx | Pre-mRNA-processing protein 40A from Arabidopsis with 52.5% of identity |
| Eggnog | PRP40 pre-mRNA processing factor 40 homolog(COG5104) |
| Kegg | Link to kegg annotations (AT1G44910) |
| CantataDB | - |
| Mirbase | - |
| Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019428120.1) |
| Pfam | FF domain (PF01846.18) |
| Rfam | - |
| GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |