Id Trinity | TRINITY_DN52138_c3_g2_i1 |
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Name Transcript | Ll_transcript_429087 |
Sequence | TTTTTATTGATTTTTGAATATTAATGTTAATATATTATATATGTATATCCAATTTCGCGCAATTTAATTAGTGAACCACCAGTTGAACCGTTACATCACT GTACCAGTACTCTATATATATACATTAAGTTATGAAGAAGTAAACATGTTATTCAACACCATCTTCATATTTGTGTATTTTGAGAAAGCATAGGAGGAAA ACTAAGAGAGAGAAAGAAAAACATGGATTGTTGTGTGTGCACAACTATGCCATTAATACTAAGGCCTCCTAGGAATACAATATGTGGGGCTTGTTATGAA GGAGCAAGGAACATGATCAATATGATGAACAATCTTGAAAGTGAGAAAGCAAAAGCAATCACTAATAATACAAATACTTCTCCATTTTCAAAGCGAAATA CGAGTAAGACACTTGATGATTGTATAAGATGGTGTTCAGAGTTCATAGAGATGTTTGATCAACAAAAAGAAGACTTGGCTTTTATGAGAGGCTTTGTTGT TGCATTTAAAGAACAAATTCACACTGATATATTGGTCAATCCAGGTAGCCATGGTCCACCCATACCTGCACATAAGTTCGTCTTGGTAAGTTATTTCAGT TTACTTTTATTATTTTTATAATTTTCCATCCTAAAATTTGAGGAAAACATTGATTTGGTCTTGAAATTAACACAATTAGTCAATTTATTCCTAAGAGAAA TGTCAATTTGGCTCTTTGCAAATTATTTGTCTAATATATCATGTTTTTGTAATTTATTTGTTCTTTTCTTAGTATATTAAGTAGGGGTTGAACATGATCT AACTCTATTCATTCACCTGATATGACCTGATCATGGTCGAATTTGATAGAGTCGGATCTCATCAGATCTAGAGTTAGGTTTGAGTTTAAAAATTAGATCT 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ATTGAAGTTGAGCTTGATGAAAAGGTTCCAAGATAAGAAATATGATGTGTTACCATGACTTATTTTAGTTGAGGTGTTTGTCCTATTTTTTGTTGTTTGC TTTTGAAGCCCAAAATCATGATATGAGAGAGTAAGCTTGCTATTTTTTTGGTTTCCCACACGTATTCTCGCACTGGAGGCAATCCTGTCCGAACCAGGTG CGAGAATATCTTTGGGAAACCAAAAAAATAAATAGAAAGCTTGCTATGAAGTAGTTTTAATGAGGACTGGAAAAAATTGATGTGTATCTTGAGCATCAAC AAATTATAATAGATTGTTGTAGTTAAGGTTCATTTTTGTTTCAATAATTCTCATGTGAAATTTGCTGTCATTGTGTAATAATACTTCATTCTTGTTATGG TGTCTGAAGATGAATAACTTCCATAAAACATTTCATCAAAGTGCATTGTGGGTTTTCAACTTTTCAATAAGATTTCAAATAAATGTTGCTCAATTTTGAT TATTA BLAST |
Tissue | pods |
Gene name | LI_gene_190380; |
Additional information | details; |
PAB | abscising pods |
PNAB | non-abscising pods |
PS1 | seeds stages 1-3 |
PS2 | seeds stages 4-6 |
PS3 | seeds stages 7-8 |
PW1 | pods wall stages 1-3 |
PW2 | pods wall stages 4-6 |
PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_429087
Blastp | BTB/POZ domain-containing protein At3g56230 from Arabidopsis with 49.62% of identity |
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Blastx | BTB/POZ domain-containing protein At3g56230 from Arabidopsis with 51.41% of identity |
Eggnog | meprin and TRAF homology domain-containing protein MATH domain-containing protein(ENOG410XQV8) |
Kegg | Link to kegg annotations (AT3G56230) |
CantataDB | - |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019416862.1) |
Pfam | BTB/POZ domain (PF00651.30) |
Rfam | - |
GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |