Ll_transcript_431410

• Id Trinity: TRINITY_DN52157_c0_g1_i15
• Name Transcript: Ll_transcript_431410
• Sequence: CACACTTTTTCTCACACCCTTTTTTCTCTATTTTTTTTGCCAAGGTACACGCTACACTCCTTTCATTCTTTTCTCAATTAGATCTGTGTTATTTTTTTTA TTGTACGACCTCATCTCAATTTCCTTGATCGGTAAGCTGAATCTCTTTTCTGAACTGGGTTTTCACAAAGTTCTTTCCTTTTTTCAATTTTCACTCTTCC TTGAATCTGTTTATATTTCCTACGAATTTATACCTTTTATGTAATTGTTGTTCGTATATGATTCGATCCTTAACATATCTGTGCAAAGTTTTTGTCTTTT GGTCCTATGATTTGGAAATCTGTGGACTTTTTTGTTCAGATTTAAAAAAATTTATACCATGGTCTTAATCCTTATTATGTCACAGTATCACAAATAAGCA TACTTAAAAAAATTCAATATCTGTTTTTTAAGTTCTTAATTGTTGATTAGGATATGTAGTTATCGTGTTTGATTCTTTTATGTGAAATGAATCAAAACAC TTAGATGATATAGAAGCTTTGTTGCATATATATGTGGTGATTGACCACGTTAATATTTATAAGTTGTTGTGCTGTTACATGTTATGTTTCATGTTATTCT GGTGTAGTTTATATTTAATGCTGCAATTACTCATTTGGAATTATAACTTTTCATTGCTGGTATGATATGATTTTTATGTTTTTCTCTTTTTCTGTTATTT AATCACATATAAACTGGCTTTGAATTGTTTTGTCACAATTTATGTATTTATTTTTAGAATTAAGAAGATGTATACACTGAAGCAGTGTTTTTTGTGTACT CTGCAATTTGGTATAAAATCGCCATTGTTGAGATTTATTGTCATGTGTCTCTTGTCTGTTCTGATTTGATTTCAATCTAGTAATGCAAGTTCATGTTTTT CTGTTTCCAATATATTTAGATCTATTTATTTGCGTGTGATATTGTACGTGCGTACGTGATTGGTGGGATCTTGTAGTTAAATCACAGTTAGCTCGTGCTC CACTATCCTAGTATTGTAGATACTCTTGATATTAGTAATGCCCTTGATTTACAGCAAGCTGTTATGACATTGGGTCCTTGATTTCTTCAGGAAAGTCATC ATGGTTGAGCAGGTTCAGCACCCTACAATCATGGAGAAGGTTGCCAGCCAGCTCCATCGCCGCTCCAGTGTTTCTTCTGATGTTCAAAATTATGATGCAG CTTTCCGCAGGCCTGCTGTGTATCAAAGGCGGTCGTTTGGGAACTACTCAAATGCTGCATTGCAGTATCCACTGATGCCATCATGCGGAGCTACAAGTGA TTTGTCTTCTGTCGCAACAGCCTCCCCTGTGTTTGTTGCGGCTCCTGCAGAGAAAGGCCACTTTCTTATTGACTTTCTCATGGGTGGAGTTTCAGCTGCT GTGTCCAAAACTGCTGCTGCTCCCATCGAACGAGTTAAACTTTTGATCCAGAACCAGGATGAGATGATCAAGGCTGGTAGACTTTCTGAGCCATATAAGG GTATTGGTGATTGTTTTAAGAGAACAACCGCAGAGGAGGGTGTGGTTGCCCTATGGAGGGGTAACACCGCCAATGTCATTCGTTATTTCCCTACTCAGGC TTTGAACTTTGCGTTTAAGGACTACTTCAAGAGGCTTTTCAACTTCAAGAAGGATAGGGATGGTTACTGGAAATGGTTTGCCGGCAACTTGGCCTCAGGA GGTGCTGCTGGTGCTTCATCCCTTTTCTTTGTGTACTCCCTTGACTATGCTCGTACTCGTTTGGCCAATGATTCAAAGGCTGCAAAGAAGGGTGGAGAAA GGCAATTCAATGGTCTTGTGGATGTCTACAAGAAGACATTAGCATCTGATGGTATTGCTGGTCTTTACCGTGGTTTCAACATTTCCTGTGTTGGAATCAT TGTGTACCGTGGTCTCTACTTTGGAATGTATGATTCCTTGAAGCCAGTTCTTCTGACCGGATCTTTGCAGGATAGCTTTTTCGCTAGCTTTGGTCTTGGA TGGCTCATCACCAATGGTGCTGGTCTTGCATCATATCCAATTGACACTGTTAGAAGAAGAATGATGATGACCTCCGGTGAAGCTGTGAAGTACAAGAGCT CCTTGGATGCATTTGCCCAAATCCTCAAGAACGAGGGTGCCAAGTCCTTGTTTAAGGGAGCTGGTGCTAACATCCTCCGTGCTGTTGCTGGTGCTGGTGT GCTCGCCGGTTATGACAAGTTGCAGGTGATCGTGTTCGGCAAGAAGTACGGATCCGGTGGTGCTTAAGTTTTCAGCACCTGAAATATTCTAGTTTTAGAT GTTGATGAAAATCATTGAGTCTTGAGAAATGATTAATTGCTACGGCAAATTTTTTTCAATAATTTTACTCGATGGGATTTGGTCCCAGAAACGTTATAGT TTTGGATCAGAATTTGATATTTTAAGCATGATTTATTTGAGTGGCTGGCAAAGCCATGGTTAGTCATTTGGAATTCTATTTTGTTTGATTTGAGTTTTCA AAAGATCTTCTCTATTCTGTATTACACATGTTCTACACTTATCTTTTGTTTCTAGAATAAAATGGATATGCGCCTTTTGTTGTGTTGAAGAAATACGTGG AAAATGATATATTCTCCTGTTAATTCTCCTACATATAATAAAGTGATATGTTGATTTGTTTACAAATGGCATGTGTTATTTTCTTGTAGTTAAGAGATCA CGGTAGGAGGAGGATATAACATTTTTTACTTCTAGCTTGATTGGTTTCATGCG
• Tissue: pods
• Gene name: LI_gene_190521;
• Additional information: details;

Expression of Ll_transcript_431410

FPKM

• PAB: 33.1
• PNAB: 69.8
• PS1: 29.7
• PS2: 27
• PS3: 34.9
• PW1: 54.7
• PW2: 54.6
• PW3: 43.3

Labels

• PAB: abscising pods
• PNAB: non-abscising pods
• PS1: seeds stages 1-3
• PS2: seeds stages 4-6
• PS3: seeds stages 7-8
• PW1: pods wall stages 1-3
• PW2: pods wall stages 4-6
• PW3: pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_431410

• Blastp: ADP,ATP carrier protein 1, mitochondrial from Gossypium with 84.65% of identity
• Blastx: ADP,ATP carrier protein 1, mitochondrial from Gossypium with 84.65% of identity
• Eggnog: -
• Kegg: -
• CantataDB: -
• Mirbase: egu-MIR172e (MI0020571)
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019453426.1)
• Pfam: Mitochondrial carrier protein (PF00153.26)
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;