Ll_transcript_431397

• Id Trinity: TRINITY_DN52157_c0_g1_i5
• Name Transcript: Ll_transcript_431397
• Sequence: CACACTTTTTCTCACACCCTTTTTTCTCTATTTTTTTTGCCAAGGTACACGCTACACTCCTTTCATTCTTTTCTCAATTAGATCTGTGTTATTTTTTTTA TTGTACGACCTCATCTCAATTTCCTTGATCGGTAAGCTGAATCTCTTTTCTGAACTGGGTTTTCACAAAGTTCTTTCCTTTTTTCAATTTTCACTCTTCC TTGAATCTGTTTATATTTCCTACGAATTTATACCTTTTATGTAATTGTTGTTCGTATATGATTCGATCCTTAACATATCTGTGCAAAGTTTTTGTCTTTT GGTCCTATGATTTGGAAATCTGTGGACTTTTTTGTTCAGATTTAAAAAAATTTATACCATGGTCTTAATCCTTATTATGTCACAGTATCACAAATAAGCA TACTTAAAAAAATTCAATATCTGTTTTTTAAGTTCTTAATTGTTGATTAGGATATGTAGTTATCGTGTTTGATTCTTTTATGTGAAATGAATCAAAACAC TTAGATGATATAGAAGCTTTGTTGCATATATATGTGGTGATTGACCACGTTAATATTTATAAGTTGTTGTGCTGTTACATGTTATGTTTCATGTTATTCT GGTGTAGTTTATATTTAATGCTGCAATTACTCATTTGGAATTATAACTTTTCATTGCTGGTATGATATGATTTTTATGTTTTTCTCTTTTTCTGTTATTT AATCACATATAAACTGGCTTTGAATTGTTTTGTCACAATTTATGTATTTATTTTTAGAATTAAGAAGATGTATACACTGAAGCAGTGTTTTTTGTGTACT CTGCAATTTGGTATAAAATCGCCATTGTTGAGATTTATTGTCATGTGTCTCTTGTCTGTTCTGATTTGATTTCAATCTAGTAATGCAAGTTCATGTTTTT CTGTTTCCAATATATTTAGATCTATTTATTTGCGTGTGATATTGTACGTGCGTACGTGATTGGTGGGATCTTGTAGTTAAATCACAGTTAGCTCGTGCTC CACTATCCTAGTATTGTAGATACTCTTGATATTAGTAATGCCCTTGATTTACAGCAAGCTGTTATGACATTGGGTCCTTGATTTCTTCAGGAAAGTCATC ATGGTTGAGCAGGTTCAGCACCCTACAATCATGGAGAAGGTTGCCAGCCAGCTCCATCGCCGCTCCAGTGTTTCTTCTGATGTTCAAAATTATGATGCAG CTTTCCGCAGGCCTGCTGTGTATCAAAGGCGGTCGTTTGGGAACTACTCAAATGCTGCATTGCAGTATCCACTGATGCCATCATGCGGAGCTACAAGTGA TTTGTCTTCTGTCGCAACAGCCTCCCCTGTGTTTGCTGCTGCTCCTGCAGAGAAAGGACACTTTCTTATTGACTTTCTCATGGGTGGAGTTTCAGCTGCT GTGTCCAAAACTGCTGCTGCTCCCATTGAACGTGTTAAACTTTTGATCCAGAACCAGGATGAGATGATCAAAACTGGTAGACTTTCTGAGCCCTACAAGG GTATTGGCGATTGTTTTAAGCGAACCACGGCAGATGAGGGTGTGGTTGCCCTATGGAGGGGTAACACCGCCAATGTCATTCGTTATTTCCCTACTCAGGC TTTGAACTTTGCATTTAAGGACTACTTCAAGAGGCTTTTCAACTTCAAGAAGGATAGGGATGGTTACTGGAAATGGTTTGCCGGAAACTTGGCCTCAGGA GGTGCTGCTGGTGCCTCATCCCTTTTATTTGTGTACTCCCTCGACTATGCTCGTACTCGTCTCGCTAATGATGCAAAGGCTGCAAAGAAGGGTGGAGAAA GACAATTCAATGGTCTTGTCGATGTCTACAAGAAGACATTGGCAACTGATGGTGTTGCTGGTCTTTACCGTGGTTTCAATATTTCATGTGTTGGAATCAT TGTGTATCGTGGTCTCTACTTCGGAATGTATGATTCTCTGAAGCCAGTTCTTTTGACTGGTAATTTGCAGGATAGCTTTTTCGCTAGCTTTGGTCTTGGA TGGCTCATCACCAATGGTGCTGGTCTTGCATCATACCCAATTGACACTGTTAGAAGAAGAATGATGATGACCTCTGGTGAAGCTGTTAAGTACAAGAGCT CTTTGGATGCATTTAATCAAATCCTCAAGAACGAGGGCGCCAAGTCCTTGTTTAAGGGAGCTGGTGCTAACATCCTCCGTGCTGTTGCTGGTGCTGGTGT GCTTGCCGGTTATGACAAGTTGCAGGTGATCGTGTTCGGAAAGAAGTACGGTTCCGGTGGCGCATAAGTTTTCAGCAACTGAGTTATTCTAGTTTTAGAT GTTGATGAAAATCATTGAGTTGCAAGAAAAGACTAATTGCTGCAGCAAATTTTGTTCAATAATTTTACTCTATGGGATATAGTCCCAGACCCTTTAATCT TGGATCAGAATTTGGTATTTTAAGCATATGATTTATTTGAGTGGTTGACAAAGCAACTGCTAGTCACTTTGAATTCCATTTTGTTTGATTTGAATTTTCT TAAGATCTTCTATATTCTATATGATATACTGTATGTTTTTCTACAGTTAATCTTGCTTCTAGAATAAAATGCTTATTTGAATTCAAA
• Tissue: pods
• Gene name: LI_gene_190521;
• Additional information: details;

Expression of Ll_transcript_431397

FPKM

• PAB: 9.2
• PNAB: 31.6
• PS1: 14.3
• PS2: 13.3
• PS3: 20.4
• PW1: 24.7
• PW2: 20
• PW3: 11.9

Labels

• PAB: abscising pods
• PNAB: non-abscising pods
• PS1: seeds stages 1-3
• PS2: seeds stages 4-6
• PS3: seeds stages 7-8
• PW1: pods wall stages 1-3
• PW2: pods wall stages 4-6
• PW3: pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_431397

• Blastp: ADP,ATP carrier protein 1, mitochondrial from Gossypium with 84.4% of identity
• Blastx: ADP,ATP carrier protein 1, mitochondrial from Gossypium with 83.12% of identity
• Eggnog: -
• Kegg: -
• CantataDB: -
• Mirbase: egu-MIR172e (MI0020571)
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019449581.1)
• Pfam: Mitochondrial carrier protein (PF00153.26)
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;