Id Trinity | TRINITY_DN52190_c3_g1_i2 |
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Name Transcript | Ll_transcript_431646 |
Sequence | ATTGAAGTTAAAATGAAATTGAAAAGCACGATCGTTAAAATCTATAAACGGAAACCCTAGTCTTATAAATACCCTCCAAACTCTTCTTCTTACTTCTCAA TTCTCATTTATCTATCACTCTCTCTCAAAACGCATCGTTTCGGGTTTTGATTTCTCATACCTTGATCAGAGATGGATCTTCCGAATCTCTCTCTTATACT CCAAGCTGCTCTTAGTCCAAATCCCGATCAACGCAAGGCAGCTGAACTTAGCTTGAATCAGTTCCAGTATGCACCTCAGCATCTGGTGAGGCTGTTGCAA ATCATTGTAGATAATAACTGTGACATGGGGTTGCGACAAGTAGCTAGTATCCATTTCAAGAACTTCATTGCAAAATATTGGTCTCCATATGAGTTTGATC CCCAGCAGAAGATCTCTCAGAGTGATAAAGACGTGGTGAGGGATCACATTCTTGTGTTTGTAACTCAAGTTCCTCCTTTGTTGAGGGTACAACTTGGCGA GTCCCTAAAAACAATTATACATTCTGATTACCCTGAGCAGTGGCCTCATCTTCTTGACTGGGTGAAGCATAACTTACAGGATCAACAAGTCTTTGGTGCA TTATTCGTGCTTCGGATTCTTTCGAGAAAATATGAGTTCAAGTCAGACGAGGAGAGGACACCGGTTTATCACATTGTTGAGGAGACATTCCCTCACCTTC TCAACATATTTAACAAGCTTGTCAAGATTGTTACTCCATCACTTGAAGTAGCAGATTTAATCAAGATTATCTGTAAAATATTCTGGTCCTCTATATATCT GGAGATTCCGAAGCAGCTGTTAGATCAAAATATTTTCAATGCATGGATGATGCTATTTTTTAATGAATTGGAGAGGTCTATCCCCTTGGAAGGTCAGCCT GTTGATCCCGAGCTTCGAAAATCATGGGGTTGGTGGAAGGTCAAGAAATGGACTATTCACATTCTAAATAGGCTCTACACTCGTTTTGGAGACTTGAAGC TGCAAAACCCTGAAAACAGAGTTTTTGCTCAAATGTTTCAGAAGCATTATGCTGGGAAGATTTTGGAGTGCCACTTACATTTGTTAAATGTTATTCGTGT TGGTGGCTATTTACCTGACAGGGTTATCAACCTGATTCTTCAATATCTAAGTAACAGTATTTCAAGGAATAGCATGTATGCTCTGCTGCAACCTCGACTT GATTTCCTTCTTTTTGAAATAGTTTTCCCCCTCATGTGCTTCAATGATAATGATCAAAAGCTTTGGGATGAAGATCCACATGAATATGTAAGGAAAGGAT ATGACATTATTGAAGATTTGTATAGCCCTAGGACTGCTGCCATGGATTTTGTGAGTGAGCTGGTTCGAAAACGCGGGAAGGAAAATCTTCAAAAGTTTAT TCAATTCATAGTTGAAATTTTCAGAAGGTATGATGAAGCTTCTTTGGAACACAAACCCTATAGGCAGAAAGATGGTGCCCTTCTTGCTATTGGGGCACTT TGTGACAAATTGAAGCAAACTGAGCCATATAAATCTGAACTTGAGCCTATGTTAGTGCAACATGTCTTTCCCGAGTTCAACAGCCATGTTGGCCACCTTA GGTCTAAGGCGGCATGGGTTGCAGGACAGTATGCCCACATCAACTTCTCAGATCAGAACAACTTCATGAAGGCATTGCACTGTGTTGTATCCAGAATCCA AGATTCTGAACTTCCTGTTCGTGTTGATTCTGTTTTTGCTTTGCGTTCTTTCATTGAAGCTTCCAAAGACTTGAATGATATCCGTCCTATCCTTCCTCAA CTCCTTGATGAGCTTTTCAAGCTTATGAATGAGGTTGAGAATGAGGACCTTGTATTTACTCTGGAGACTATCGTGGACAAGTTTGGGGAAGAGATGGCAC CTTATGCAATTGGGCTGTGCCAAAATTTGGCAGCTGCATTTTGGAGGTGTATGAATACTACAGAAGCTGATGATGAAGCTGATGATCCGGGTGCTCTGGC TGCAGTTGGTTGTTTACGTGCTATTAGCACAATCCTTGAATCAGTGAGCAGGCTTCCTCACCTTTTTATTGAAATTGAGCCAACTTTGCTTCCCATAATG CGGAAAATGCTAACAACTGATGGTCAAGAGGTTTTTGAAGAAGTGCTGGAGATTGTCTCATATATGACTTTTTTCTCTCCAACAATATCGTTGGATATGT GGAGTCTTTGGCCATTAGTGATGGAAGCTCTGGCAGATTGGGCAATCGATTTCTTTCCAAATATTTTGGTTCCTTTGGACAACTATATTTCTAGGGGAAC TGCTAATTTTCTTACTTGCAAAGAGCCTGATTATCAACAGAGTCTATGGAATATGATTTCATCTATTATGGCTGATAAAAATATGGGGGACAATGATATT ATTCCAGCACCAAAGCTTATTGAAGTTGTCTTCCAGAATTGCAGAGGACAGGTGGATCACTGGGTTGAGCCATATCTCAGAATAACAATTGAACGCTTGC ATCGAACTGAAAGATCATATTTGAAATGTCTTCTCCTGCAAGTGATTGCAGATGCTTTATACTACAATGCTCCACTGACTCTGAGCATATTGCAAAAATT AGGAGTTGCTGAGAATATTTTCAATCTTTGGTTCCATATGCTGCAAGAAGTCAAGAAGAGTGGTGTGCGTGCTAATTTTAAAAGGGAACATGGCAAGAAA GTTTGCTGCCTTGGTTTAACATCGTTATTGGCCCTTCCAGCTGATCAATTGCCAGTAGAGGCTTTAGGCCGGGTGTTCCGGGCCACTCTTGATCTTTTGG TTGCATACAAGGATCAAGTTGCAGAAAATGCAAAAGGGGAAGACGCAGAAGATGATGATGATATTGATGGTTTTCTAACTGATGATGACGAGGATGACGA TGGTTCTGACAAAGAAATGGGAGTCGATGCTGAGGATCATGATGAAGCTGATGCTAGTAAATTTAGAAAGTTGGCTGAACAGGTGTGTGGATATGACTGG GCCTACAAACCATTTACATGCTTATATTAATTGAATATAAGATAATGAATTGATCATTAATTGAATATAAGATAACGAATTGATCATTTTGCTTGCAATA AAGGAATTTTGTAGTATGTGTGTACGAGCTTTTTAATATACGAAATTCAAGCAGTTCACAATTAGCTGACTTCATTATCCGGCTCCTAGTTTTATTTGAT TATGAAAACCAGGGTATTTAATTAGGCCATTATTGTTTTGGATACTATTCATGTGTAGTGTAAATATTAAACTCTTGAAATATAAAATATTTTGTAACCT TTTAATCGTAACGATTTGAATATAAAATATTAATCTGCATGCCATTTTTAGTGTATTAATTTTTAGACCCAGTGAGATATTTTTGTGATTAGTGTTACAT CAGGTGCATATCGCAATTCAGTTTAAGTATGAAATAGAAAAACTTTCATCACTTTAACCAAAGAAGTATGTCATCTTCATGGTTCCTCTGCTGGCAATGC ACAGTGGTCGCATTTGTTTGGCTGTTTTCGGTTCAATTGACATCCATAAGTTGCTTATCCAATCCGGTAAGCCCATCCAGCTTGGCAGTTTTGTGGTTGA ACTGGCGAGTCTAGGTCAATGTTCCCTATTCTCTCTCATTGATTCAGTTTTACATTTTTTAATGAAAGTTTTGTTTTTCGTTCACTTGTAAAAATTTGTG TTAACATTAATACACTTATCATTTATTTATTTGTTTCCTTTATTTAAAACGCCATGAATCTTAAATTCTAATTGTCCTTTTGCGATGAACCCCATAGGCG AAATCGTTCAGGCCCGCTGATGAGTATGATGACGATGACGATGATGACGACTTCAGTGATGATGAAGAGGTGCAGACTCCCCTTGACGATGTGGATCCTT TTATTTTCTTTGTGGATACTATGCAAGTGTTGCAATCATCGGATCCATTAAGGTTTCAGAACCTCACCTCGACACTTGAGATCTCTTATCAAGCTATTGC TAATGGTGTTGCCCAGCATGCTGTGGTGAGAAGAGGGGAGATTGAAAAGGAAAAACTTGAGAAAGCTTCAGCTGCTGCAAATTCTTAAGCTTTTTGTTGT ACATTGTTGGCTATTTTTTTTAATTTTGTTCCTCAAGTTCTTGCCTTTATCCCTTATTGGCAAGGGAAGCAGAGGGTTGCTTATTTATTTGAGGCATTTG TTGGTTCATTGGTCCTATACAAGGTCTATGAGCTTTGAAGAGTTTACAGTTTTGAAGTACTGAGTTTAGTGGACTCAAGCTCCTACTGATGTTAGAAGAT GTTGGGTTCAGGAAACTATGGTCTTGTTCCTTTTTCCAACCATGGTTGTGAATTTGTTTTATTATTTGGTCTACATGTTATGTTTTTGAGTCAAGTTTCA TCTTTTCCAATTTATGGAAACCCTTTGATTTGTTCAGAAATGTCTTCAATGGTTGTATTATTGATGATTATGGTTCTTTGTAACCCTATTTTTGGCTATA ATATTTGGGAAGAGAATAGAGTCCGAATTTTGAACAAGAGTTTGGGTTATGCAAGAAAAAGATAAACAATCATTTTTATTCTTTATATGATATAATTTTG TGAGAGGAATAAGCTGAGGCTATTGTGGTCAATGTCATTTTCTTGTAATTTGTTTTTAATGCTTTAGAAGCTTTAATATAGAGCTACTAAATTCTTA BLAST |
Tissue | pods |
Gene name | LI_gene_190761; |
Additional information | details; |
PAB | abscising pods |
PNAB | non-abscising pods |
PS1 | seeds stages 1-3 |
PS2 | seeds stages 4-6 |
PS3 | seeds stages 7-8 |
PW1 | pods wall stages 1-3 |
PW2 | pods wall stages 4-6 |
PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_431646
Blastp | Importin beta-like SAD2 from Arabidopsis with 74.34% of identity |
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Blastx | Importin beta-like SAD2 from Arabidopsis with 74.34% of identity |
Eggnog | Importin(COG5656) |
Kegg | Link to kegg annotations (AT2G31660) |
CantataDB | - |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019419652.1) |
Pfam | Importin-beta N-terminal domain (PF03810.18) |
Rfam | - |
GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |