| Id Trinity | TRINITY_DN52195_c0_g1_i9 |
|---|---|
| Name Transcript | Ll_transcript_430319 |
| Sequence | AAAGTCTCAAGGTATGATATCTTAAAGGGATCAATTCTTTAAAGCTTTTATTATAAGGTAAAGATTCTTGAATACTTTTATATCTTTGAGATGTTGTCTC ATTCATAAGGTAGTTAGAAACATAAGCAATGTGGTTGTTGGTTTTAATTTTGTTAAAATTTGATTAATTAAGAAGAATGAATAATCAAAGAACCATTTTC TTAATAAAAAATTCCTTAAAGGTGACATACAAGTGGGATTAAGAATCCATTTGATACTAAGTAGTCAATAACAATGGGATCATGTGTTTTTTCGGATTGC ATCTAACCAAAATGCATCATTGGGATGGAATTCTTGATAGCATCTTAGCTCACCATCTCATTAGGATCTTGTGTGATCATCTTTCATGTCCTTCAATCGA AAAACTACCCTCACCAATCTAAGTTTTCAACTTGTATAACATTCTTTCAAGTCCTCCTTGTCTCATCCCATTTTAGCTATGACATCATCTTAAAATCATT CAAAACTACCATGGCTATCTCCATCTCAATTATGTTGTTATTGGATTTGGGTTTTATGTCATTGATTTTTGAGCTCTATCGAATTTTAGTTGTGTATAAG ATATATTTTGTATTTTTTATATTTGAGCTTTTTTTGTATCTCAAGACTTGATATCCCATTTTTGGGGGGGCAATCACTCCACTTCATTATTTGGGACGAA GGCATTATTGAAATATGTAAACCATAATTTTCTAGTTGTAAAACTGGGTTGTTTAAAACATGTTTGGTTTCAAAACATTGGTTGAAGAACTAACAAGTCT TCATTTATTTTTTTTTGTTAAAACTCAATTTAGCAAATGCTAATCACAATACACATTGATTAGTTTTATCTTATGTATTAACTAAACTAATTTTTCTTTT TTTAGAAGAAAAGGAAACTTGAGCATTACATGGACGAAGGTAAATCTACTTGTACTTTTGAACTTTTCAACAAGGAGAAATACAATAACAAAGTTGCTAA AAATCATAAAAAAGGTGAGTCCTCTTCCCTCTCATGCTTAGGGAAGTCCAATGAAAAATGTAGTTTTCAAGGATGGCAAGGACATGTTGCTTTCCTTGTT TCAAATGACATAGTAGAACATTGCAATAGTTGTTGGCAAGATTGTTCTCACTCTAATGAGTCTTCACAAGAAATAAAAGGTAAAGTTTTTCATGCTACAG AGGATGATGAAGATTGTACATTATGTTGCGAAGATTATTCTCAACTAAGTGACTTTGATGAGTCTATACCAAGCCCTATCAAACAAGGCAACTTGAAAGG CCACTTTGAACCTTTTGAGGATAGGAGTAGTGATACGACTATGATATCAATTAAGGAGAAACAAAATGTAGAATTGTCTGAAGAATTGAAATCATTGATC AATAAAGATTTTGATGACGCCAGTAGTAGGAACTCGTGTTCATTAAGGTTGGGTAAGGGGTATTTGAAAATTGGCCACCAACTCCCTTTTTGTGGTAATC AATGCCCACAACTAGTTATTCCTGTTGGACCTAGGTTCCAAGCTGAAATTCCACAGCTTGAAAACCTAACCAACATAAGGCAACATCATTCTAATGATAA TTTAAAATGGGTTTGCAATGAAGTTTGGCCAATGCCTACTATTGTGGAAACTGATACAAAAGGTGTAGGGAATGGTAGGCCTGAGGCATGCTCATGTGAC TTTCCCGGATCAATCGATTGTGTTCAACTACACATAAGTGAAGCAAGAGAACGCTTAAAATTAGAGATTGGTACAACTTTCTTTAGTTGGAAGTTTGATG AGATGGGGGAAGATGTTTCAAAGTCATGGACAATGAAAGAACAAAAAAAGTTCGAATCTTTGACACGAACTTCACTATCAAATGATATGGATTTTTGGAA GGTTGCAATGGAGAACTTCCCAACCAAATCTATGAAGAGTTTGATAAATTACTATTATAATGTATGCATCCCTAGACGACTGAGCCGAGAGACAAGAGCT TCCTTTGTTCCAATTGATAGTGATGATGATAAACTTATGGATGAAGATGATTATTCAACTACAACCATGCAAATAGTTCCAATTTGCAAATTGCCTAAAT CAAGGAAGACAAACTCCCCCTTTAACTACTTCTAAGAAGTAAGAAACTTTGGTTAGTTATGTATGATATTCAAGTTAGTAGAATTATAAAATCTCTCTTG TTTTTTAAGGAATATCACCTTAATTAAACTCTTTGACTTAATGATACATTTTCTTTGACATGGAGGATGAAAGAGGAGACTATCTTGCTCATCCACCTTC ATCTTTATGTTTTTTCTATTCTATATTTATCATTATTAAGGATTCTAGACATGTTTTTGCAAAATCCCATCTCCTTTGAGTATGATGTTACTTGATTGTG ATGATATTTTTAGCATGGCTTGGGTTATTCTATGATCTATTATATTTGTTGAGTATTATGATTCATATTTTTTATGTTTGATTACTATTCAAATGATTTT TTGACTCATTTTTATATTTGGAAAATGTGGAATATGAAGTTTGCTTCTTGCAATTGATGTCATCGAATTTCATGACTTTGCTTTTTTAAATTGGCCTAAG GAACTATATTTGTTAATTAGTTTTGTGTAAGATTTGTTCAATGGAATTTAGACCATAACCAAGCTTAGGAGTTTGATCCCCAAGGAAGTTTGCATTATGA TAATAATAATGTTTATGTTGATTTCAAGGATATGTAACCTATGAAGTACCTAAAATCATATCTTCTAACACTTTTATTTCTTAGGGTTATTTCATGCCAT ATCATTCTTTAGTCAACTATAAGGATTATTTAAATCAACATCATCTTCTTTTACACAAATCCTTTAAGGATACCAACAAAGTGTTGATCTTGTGGTATAA GATGTCGATGGATCTTTATGTATCCTAGCATGTGAAGTATAAATTCTTGTTTAACACAATGCCATTTTTGATGGCCTAGATAAATAAGATGTTTAGTAGG ATAAACGTTGGATATGATATGAACATGGTAGGCTTTTATTGCATGTATTGTTTTTGCACACACCATATATTAACAATATTATATAAATTATATGCAAACG TAAGATTAGCCTTATAACAAAAAATTACATATGACATGTACTTTTATATTTTTGACTTAGTGTTAATGATGAGGGTGGAAGTGATGAGGCTATGGTGGTG TAGTGGGTGGTAGTGACAATATTGCTAAGGAAATAATGGTATGATGCAATAATAGTCGAATGGTGATGACAATAATGGTGGTGGTGATAGTAATATTGAG ATGAGGTTATGATGTGGAGGCAATAATCTATGGTATCATATTAGAGGTGACAATGGCAATGGTGTAGGCTAGGGTGATGATTATATTAATATAGCGGTGA CTATGATAATGATGGTATTTATGATGGTAGCATTATTGGTGGGGGTGATGGTTTAAATATTGATTTCAAAATTACAAAGTTTAAATATGTTTAATTAAAT AAAATTTATATTTCACAAGTAACATCTATATGATTATACATTTTGAAATGGTCTTGTCATGTTGAATACTTCTCATTAAATGTAAGTTATAGAGAGTCAT TTACACATGTTTTTTTCATATGTTTATGCAATCTATTTTTCACAATTTTTATAGTTGAAAAAAATCATTTCTATAGTTGTAGTGCTAATTTTAAAAGAAG ATTAATTAATAGATAAACAATGTGTCTTTGACTTTCAATTAACTCATCATGAAGATTATTTATTCATTTCAAAGAAGTAAATTTAACACTGTTATGCATA TCAATGATATATGTTTTAAGTTGATTATCAAACATCCTCAAATCAGTTGAACAAAAAAATCAAGTGGATAAAACTTTGCAAATTAAATTAATTGTCATAT CAAAACTAGACTCATACAAGACATAAAGAAATAGTCGAGTATTTGTCTCGGATATCTATGATCATGAAGTTCCTTGAGTTGCATATTCATAATATTATAA AACAGTTCAACATAATAATGATTATTTGTTTTTTCACAAGGCATGTCATGTTATTTTTAAAAAAATAAATTTTGGACATGTACAATTATAAATGAGAGTG TAATATCTATTTATTGTTTAAATATTTAAAGTCACTATATAATTTTCCATTCAAAATAATAGATATTTTTTTTTTCAAAAAATTCCAAGGGCACACCCTC CAAACTACATAAGAGTGAGGATGATGGTGATGGCATTAGTGGCGGCGAGAATGATGGTGATGGCATTAGTGGCGGCGGCGAGAATGATGGTGATGGCATT AGTGGCGGCGAGAATGATGGTTATATAAGTGAGGGTTGTGACCAATGTTATTAAAAC BLAST |
| Tissue | pods |
| Gene name | LI_gene_190803; |
| Additional information | details; |
| PAB | abscising pods |
| PNAB | non-abscising pods |
| PS1 | seeds stages 1-3 |
| PS2 | seeds stages 4-6 |
| PS3 | seeds stages 7-8 |
| PW1 | pods wall stages 1-3 |
| PW2 | pods wall stages 4-6 |
| PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_430319
| Blastp | AT-rich interactive domain-containing protein 2 from Arabidopsis with 35.36% of identity |
|---|---|
| Blastx | AT-rich interactive domain-containing protein 2 from Arabidopsis with 34.3% of identity |
| Eggnog | NA(ENOG410YHCT) |
| Kegg | Link to kegg annotations (AT4G11400) |
| CantataDB | - |
| Mirbase | - |
| Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019431281.1) |
| Pfam | - |
| Rfam | - |
| GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |