Id Trinity | TRINITY_DN52223_c2_g1_i2 |
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Name Transcript | Ll_transcript_304973 |
Sequence | CACGAACCCAAATATGGATTCCTTCCTTATTCAAACAGACGAGAGCATACCTTGATAGTACAAAAAATACACAAGAAAAATAGTGGGGATGGGAGAGAGG TGAGGAGAATGTGAACCGCGAAACATCAATGAGATGATGAAGGCAGACACTACCTACGAACCTCTCCCTATGATTATCATGGAACCCAACACGTGTAGGG CATCGTTGTTTCTTTGTTTTACCACTCTGAGGGAAACAAACGGGAAAAGACCCCAACACTGTTAACCCATTAATAAGAGGGAGGTTTAGGGTTTAGAGAC CCACGTGCTGATTCCAATCCACATCCCCAAGTTAACACAGAACTTCACAAGTTCATATATAAACAAACAAAAAGGTAGTAACTTTTTCTGTGTGGGACTA TTTAAATGGTCACTTCTATTACATTTCCAGTGTCTAATAATTCTCCAAATCTCTCTTGATTGCGTCGTTGTCAGACATGGATTTTGGATTTTTGCATTGG ATCTGGATGAATCGTTCTCATTCTAGTTCGGTAACAGCGAGAAAACGATTTCACGTGCGGGGAATCGTTTAACATGAAATCAAATAACAGAGGAGAAGAT TCTAATGGTATTGCATTTGCAACTGCTAGAGCCTGTATTTTTGGCCTAGCTGACATCTGCTGCGCTGCTTCTTCGGTGGCACCAAAATCTGATGTGATTA GGGGAATTAGCTCTGCAGTTTTTCAGAATGTGTTAACCTTTTTTATGGCTTTGTTTGAGGGGAAGGATGTTATGCAGTTGGTTGACAAGAATTTCCTGAA TATGCAAGATTCCATCAAGGTCTTCTCAGAGTTGAAGCAAAAAGTTTTAGATGAAGATGAATGTTTATTGACTAAACTGACCAGATCCTGTGCATTGTGT 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GATCACAAAAGGGTATTTTTCCCCATCATTTATTTCTGAATGAAGATGGTATTATGGTCTTTCTCAACTGATCACATAATCTTATGGCAGACTTGATTTG CCTGTTTGTGGATTACTACTAAAACTTCAAAAAGCAACCAAATTACTTCACAAAAGTTAATCTAACATTGTTGCAGATTCCTCTTTATATGTTTGCTTTA AGTTTTTGCTGAAGGCATGAGATATCAGTTTTTAACCACCTACTAAAACAAAACCCTCTCATGTTGATCTATATTTTTTAAACTTGCTTTGGAGTTAGAA TTTGTGTTTTATGCTGTGACATCCCTTGTAATATTGACTGAATGTCCTTCAACCAGTTTCAGGATTTCATATCATACTTAAAGCAGAGGGATTGTGCTGG AGTTATTAAAATCCCAGCTGCAAAATCCATATGGGCAAGGCTGCTATTTATACTCCCCCATTCTCTTGAAACATGTTCATTGCTTTCTATTGCACCTGAT CCATCCGATTGCCTCATCGCGTTGGTTCTGCCCAAAGATACAAGCTTTGAGTGGATGTGATTGTTGTATCCCTTACATTTTAGAGCAGAGCTTAGACGTA GTCGGTGTATTTTGATTATCTAAGCCATATTTTTGTATATACACAATGTGAAATGGGGATGTGAAGAAATATGCAATTATGGAGATTATCATACTGGTGA GACGGGTGAGAGTAATGATATAGTGTGTACAACGGTTCACTTTGGAATTTTAGCACTTGAAAGAAAGGTAGAGTCAAAACTTGCATATTTTTCTTATATA ACTTTTTTCGATCGGCTCTTTAATAAACAAAAAAATGAAGTGGTTGACACTTGACAGAGC BLAST |
Tissue | pods |
Gene name | LI_gene_191035; |
Additional information | details; |
PAB | abscising pods |
PNAB | non-abscising pods |
PS1 | seeds stages 1-3 |
PS2 | seeds stages 4-6 |
PS3 | seeds stages 7-8 |
PW1 | pods wall stages 1-3 |
PW2 | pods wall stages 4-6 |
PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_304973
Blastp | - |
---|---|
Blastx | - |
Eggnog | - |
Kegg | - |
CantataDB | Link to cantataDB annotations (CNT0001807) |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019436955.1) |
Pfam | RNA recognition motif. (a.k.a. RRM, RBD, or RNP domain) (PF00076.21) |
Rfam | - |
GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |