Ll_transcript_304779

• Id Trinity: TRINITY_DN52226_c8_g2_i3
• Name Transcript: Ll_transcript_304779
• Sequence: CACTGAGATACCTAATCAACCAAACACTAATTTGTATTTCTATATATGTATATATCTATCTATATATATATAAGATAGTCCCGCATGCAGTTTGCTACGA CCAATTCTCTTATATATCACTCAGACTCAGTGTCATTGTGACCATAAAAGGCAATAATATTAGTGCAGAACAAAATGAGAAACACTCTTATTGCTTCATC ACATGCACTTTTTCTGGCTTTCCTCCTTGCAACCCTTTTTTTGTGGACCATTCCTGAAATTGCTCTTGCAACTTCAAACCATGGAAGCGTTACAAGGCAC TACAACTTTGATATAAGGCTGAAAAATGTTACGAGGCTGTGCCAAACAAAGAGCATACTTACCGTGAATGGGAAGTTCCCGGGGCCTCGAGTTGTTGCTA GAGAAGGAGACAGATTAATTGTTAGGGTGGTTAATCATGTTCCAAACAATATAAGCATCCACTGGCATGGAGTGAGACAACTTCAAAGTGGATGGTCTGA TGGGCCATCTTACATAACTCAATGCCCCATTCAAACCAACCAAAGCTATGTGTACAACTTCACCATTGTTGGGCAAAGAGGAACTCTGTTTTGGCATGCA CACTTCTCATGGTTAAGAGCCACTTTGTATGGACCCTTAATCCTCCTCCCTAGGCATAATGAATCTTATCCATTTCTCAAACCTTACAAGGAAGTCCCCA TCCTTTTTGGTGAATGGTGGAAGGTGGATCCAGAGGCTGTTATTGCAGAAGCCCTTCAGACAGGGGGTGGCCCAAATGTCTCTGATGCCTACACCATTAA TGGACTTCCTGGGCCCCTCTACAATTGCTCCAATAACGGTACTCAGCATGGTGAACTCTTCATTATTTTTGCCTGATAATTTGACTAGTGGGTATAAATT TTTTAAATTATGGGATATTAAAATTTAATCCCAACGTGGACCATTGATCCTTTCACATTAGGATTTTCATACCATTTTACCTGGAAAATATTGATCTATT ATTTAGCATATCAATATTATGAAACTCGGTATTAAAGTGAAAAAAAATCATATATTAGGCTTTACCAATTAAACTATATGAACCGGAAAATATCATATAT AATTAATAATTATTTATAAATATACAATTAGATTGAAGTAACATATTCAAATTTTTTTGGTTTAAAGTGTTTTATCCCCTCATTCAATTAAGATTGCAAA CTAAAATTGTTTTCAAGTTCAGTTGGACGCTCAGTCCGATCCACGTAAAATTACAGCATATCATTTCTAAAAGAAACATCTTTTGATCAATGGTTAGTAA GTATAAATGTGAAGAAAAAAATAAAGAATATAGTTATTTTTTCACTAACCAATGATGTTAAAGTTTTAGTTAAGAACGTGAACTGTTTGATTTTAGTTTT TTTCTGTACATGTTTGATTTTAGTTATTGGGTAAATGAATCTTTTAATTATTAATTCATACCCCATAAAAGTATTTAAAGATTGAATCATGAAAGTTGTG ATTATTTAGTGACACAAACTAATTAAAGGTGAAGGCATGGTTAACAAAAAAAAAGTTTGTGATTATTGAGTTGCAATAATGAATTGAATGGTTTTGATGT GCAATGCATGATTGCATGGTGGGTCATGGAGGAGAGCACATTTATTGTCCCATAGTTTGTTCTACTCCATGTGTCACAGATTTATGATTGATCAGAAAAA ATAAATTTAAGTTATGGACAGAGACATTCAGGTTAAAGGTGAAACCAGGGAAGACATATCTTCTTCGTTTGATCAATGCTGCACTCAATGATGAACTTTT TTTCAGCATAGCAAACCACACCTTAGTCACTGTTGAAGCTGATGCTACATATGTTAAACCTTTCAAATCCAACGTTATTCTCATTACACCAGGACAAACC ACAAATGTTTTGTTAAAGACAAAACCTCATTACCCAAACACCACTTTCTTCATGCTAGCAAGCCCATATTTCACAGGTTTGGGTACCTTTGACAATTCCA CAGTGGCTGGAATTGTAGAGTATGTTAACCCATTTGGTAGTATCAATGTTCCTAATTCTTCAACCAATTTGAAACCTACACTTCCAGCAATCAATGACAC ATCATTTGTTGCAAACTTCAGTAGCAAACTTCGCAGTTTGAACAATGCAAAGTACCCTGCTAACGTGCCTCAAACTATTGACAAGAGTTTCTTCTTCACG GTAGGAATTGGATCAAGTCCATGCCCAAAAAACCAAACATGCCAAGGACCAAATAATAGTTCAAAGTTTGCAGCTTCAATGAACAATATATCTTTTGCTC TACCTTCAGTAGCACTTCTCCAACAACATTATTTGTTTAGGGAGAAATATAAAAGTGTTTATACTACAGACTTTCCAATTGTACCTCTTGATCCATTCAA CTATACAGGGACTCCACCAAATAACACTAGGGTCAGTAATGGAACAAAGACTGTGGTGATACCTTATAATACAAGTGTGCAGGTTGTGTTGCAGGACACT AGCATTTTGGGAGCTGAGAGCCATCCTTTCCACCTTCATGGATTCAATTTCTATGTTGTGGGTCAAGGCTTTGGGAACTTTAATTCTAGTGCAGACCCTG CAAAGTTCAATCTTGTTGACCCTGTTGAGAGGAACACTGTTGGTGTGCCCTCTGGTGGTTGGCTTGCAATTCGATTCCTTGCTGACAACCCAGGTGTTTG GATGATGCATTGCCACTTTGATGTGCACCTTAGTTGGGGGTTAAGGATGGCTTGGATTGTTGAAGATGGGAAGCTCCCTAATCAGAAGTTGCCTCCTCCA CCACCTGATCTCCCTAAATGTTGAATACAATGACCCTTTTTCGTATGCATGGACCACCTGCTGCATGTTCTTGCCAATTTTCCTTCCTCAACAAACTCTC TTTTCATCTTCTGCTTTTTCCAATTCTTAGTTAATTTAGGATTTTTTTGCCATGTTTTACCTTCTATATATGAGTGAAGAATAACCATCATGCAGTGGCA ATATTCAATCTATATTTCTTAGTAAACTTTCAAGTACAAAAAAAGTTGGGGGAGGTGGGGTTCTTTTTTAAAATAAACAACAACTTTGAGCCTCATTGAA CAATACTTGTATCATCGAACATAACATTCAAAGGACACATTCTTGAATATTAAGTATCTATATTAACATTACTGCCATGCAAAAATGTTGGTGTACCTCC CAAGAATAGTTCTATTGACCAACCATACCTGGAGCTAGCACGTATAGAATGTACATGAGATCTAATATCAATATGTAAAATGCAAATTATGCAATACACC TCACACTGAAGGTGATTAGTTGATTCATCCTTAAGCTTCTTATTACATTTTGGTGGAACTTTGCAAAGCCT
• Tissue: pods
• Gene name: LI_gene_191067;
• Additional information: details;

Expression of Ll_transcript_304779

FPKM

• PAB: 0
• PNAB: 0
• PS1: 0.2
• PS2: 0
• PS3: 0.1
• PW1: 0.1
• PW2: 0.1
• PW3: 0.5

Labels

• PAB: abscising pods
• PNAB: non-abscising pods
• PS1: seeds stages 1-3
• PS2: seeds stages 4-6
• PS3: seeds stages 7-8
• PW1: pods wall stages 1-3
• PW2: pods wall stages 4-6
• PW3: pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_304779

• Blastp: Laccase-2 from Arabidopsis with 65.19% of identity
• Blastx: Laccase-2 from Arabidopsis with 67.42% of identity
• Eggnog: Multicopper oxidase(COG2132)
• Kegg: Link to kegg annotations (AT2G29130)
• CantataDB: Link to cantataDB annotations (CNT0001549)
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019465203.1)
• Pfam: Multicopper oxidase (PF07731.13)
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;
  Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;