Id Trinity | TRINITY_DN52254_c0_g3_i1 |
---|---|
Name Transcript | Ll_transcript_306767 |
Sequence | TGCCAGGGTTTGAACTTTGAACCCAAAGGCTCATGCTTAATGTCCCGTGACTCTACCAACTGAGCTGACTCTTGGAGACCGCAGCTGCCAGGGTTTGAAC TTTGAACCGAAATGGTTATTCATGCTTAATGTCCTGCAATTCTACCAACCGAGTTGACTCTTGGAATCACCCCACTTGTTTTCTTAAAATGGGTTTCCTT TGTTTTGGTGGGTTGTGATTTATTGGATGAAAGGAAGCCTTGGGGTAAACATTTGAAGTTGTTGATGGAGGTCACACTGTTTGAGTTTCTTGCAAATGCA AGGTAAGGTTGCCTATTATAGACAAACATGGCTAGTCCGACTCTTTCTTGGACCCTGGGCATGGTAGGAGCTTTGTAGCATTAGCTTGCATTTTCGGAAT TTATTGAATCCATTTGGTATTACTGGTGAAGGGAATTTCTGCTTTGGAATGTGCTTGTAGAGCTTCGGATTTTGCTTTTATGTTGAGTTTTAACTAATTA ATTGTATTATGTAAGTTTTCAACCTAGATTACTGTTTCCACTTGTCTCTTTGTGAATATAAGGACACATTAGTTTCCCTGTGATGGCATGTATTGCCCTA GATTTGCTTCGCCATCACGCAAGTAGAAACTGCAATGAGATTGTTTCATAGGTTGAATGATTTGGAGATTGCTGACGATGCTAAACTTTCATGAAGTTGC TCATTAATAGCTCTAACAAAATCATGTGTTGGTTATGTTGTTGGTAAAAAAGCTTGCTGTCATGAGACTTACTTGGTTAGAAATAGGAATATGTGGTTAG GCCTGTAGGGTTTACAAAACTGAATATAAGCTTCTATGATGGTATTTACACTAATTCATTTGCTGCCACCAATAATCTTTAGGCACTGTTAGAAATTCAC AAAGTGGAATCTACAAACCGCAATTGCAGTATGATGCTATTTTGATAAAGTAATTATTTCTTTAGTTGTTGCAGCAAATATAATAATATAGATTTACTCT ATCTGAAGATCCAATTGATTATCTGCTCAAGCCTTTGCGTCCCTAATCTATTGAGAAGTAATCAAACTTTGTATAAGAAAACTAAATACACGGAATGAAA ATAAAGGATTTGGAAAGCATATGAAGATCTTATTCTATGAATTTTAGGAAGACATATTTTAAATTGTAGGGTAACTCCACTTCCTGAAATCTCTGTATCT CTACTGTGATGTTTTCAAAGGTGATCATTTGATTATGGTGCCTTTCTCATAGTCTCCACTTTTGTCATAGCGTAACAGATTTTGTTATATTTGCTGTTCC AGTTACCTAGTTGCTGCTGTCAGCCTTCAAACCTTGTGGAGCCTCTCTCTAGCAATTGCTGATATATATGCCATTTTAGTAAGGCGCAGCTACCGAAATT CCAGAATTGTCAGACTATTCTCTATTGGTGATGGGGTAAGACTATGATGGTAAATTTAGTTAACTGGTTCAATTAATGTTGTAAACTTGTTTTCTCATCA TTCTCACTTGCAGTACTTTGGAGAAGAACTCTGACTTTGAGTTAATTAGTTATACAAACAATTGATCTTGTAAAACTATTCATGGTAGCAGTACTTTGTA GTGAAAAATAAATGTAGCCGGCCTCACGTAATGGGACTACGGCTTGGTTGTTGTTTGTCTAAGTGAAGACTTCCTCCTAACCATTAGAACGATGTGGTCT GATTAATTCTTAACCACCATACATATGCAAAAATCATGTTAGCTATGGATCTTATTGTTTACTGGTTTATATACTATAGCCGCGTTTTGGTATGGTGTGG GGTGAGATATGGAAGTCAATATTTTCATGCAGCCTATTATTGAGAATTTTTGCTTTCTATTAGGATTAATGATTTGATATAACTCATTGCATAAAGAGAA TGCAGAGGCACACATTATACCCATGGTGTGTTTTTTAAATGTTTGTCTCTATGAAACTTCTGATTTTCTTCTCCATGAATTCTACTGCAGATTACTTCAA CACTAACGTTTTCTTCGGCCTGTGCTTCGGCCGGTATCACCGTCCTTATTGGCAATGATCTGAATGATTGTGCACAGAACCATTGCAGCAGATTTGAGAC AGCAACAGCCATGGCATTTATGAGTTGGTTTGCTGCTTCACCTTCATTTTTTTTGAATTTCTGGACTCTAGCTTCCAAATAGAAGCAGCATGGAAGCTTT CTAGTTATAGCTGTGTATGTAATACACTATGGATTGATGGCCCTGATTGTTTCAAATCATATTATTGGGCTTCTTTTGACCTTTGAAATGTTTCCACTCT TCAAATCAAGGTATGAGCTTGAAAACAGTTGTTAACATTTATCAAATGATGTGATAGTTACCCTTGCAAGTAAATTATGTGCACATGGACAATGGGTTGG TATGTATTAGTTGGAGAAGAGATCAGAAACTAATCAACTTGGTTGGGTGAGTTGATTTGAGTTAATACAGTTCGACTTACAAACCTGAACCGAACCAACA CGATGTTGATCGAGTTGGATAGGTCTTTTTTTTATAAGTAGTTGGGTAGGTCTATTGAGTGCAATGTCTAAATTTAAACACTAACTTTGTAAAAGAAGAA AGATTAGTAGCAAAAGGAAAGCATTATTTTCCAAAATTAAATCAATAGATGATATCATTGAAAGAAAAAAACATCACATGA BLAST |
Tissue | pods |
Gene name | LI_gene_191278; |
Additional information | - |
PAB | abscising pods |
PNAB | non-abscising pods |
PS1 | seeds stages 1-3 |
PS2 | seeds stages 4-6 |
PS3 | seeds stages 7-8 |
PW1 | pods wall stages 1-3 |
PW2 | pods wall stages 4-6 |
PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_306767
Blastp | - |
---|---|
Blastx | CASP-like protein 5A2 from Arabidopsis with 76.19% of identity |
Eggnog | CASP-like protein(ENOG4111IKS) |
Kegg | Link to kegg annotations (AT2G28370) |
CantataDB | - |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019414090.1) |
Pfam | - |
Rfam | - |
GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |