| Id Trinity | TRINITY_DN52255_c2_g1_i4 |
|---|---|
| Name Transcript | Ll_transcript_306837 |
| Sequence | AACCCGTCCCGAAGTGATGCAATTGAAATTTCTATCATGTACACATTGTTTTTAATTTCTAATTTTATTTGACATATTATTGAATCTTCAAACATAAAAG AAATGAAACAATACAAGAGAAAATACAAATGTTAGATAAAAATGAAACGAAAATAATATCATATTTTCCTTTGTACTTTTATAAATTTCATATTTTTTTG AGTTCGGGTTTGATATTTTTATTTTCAACCCCGTTGAGTTTCTGTTCGAGTTCAGGTTTTGAATTTCAAGTTCCGATTTGGATATGCACAAACCCGATCC CGATCCGTCCCGTTACCATTCCTAGATAAGATATATCCAAGAGCCTTAGAGGTTCATATTTTTTCATGCTTTATTTGTTTAACTTTTGGATTCGGGGAGT GATAGAGTTTTTTTGGGCCAAATCCAATTGCCATATTGAAATTGGATCCATGAGCCGACTTTGACGAAAGCATCCAATCCAATATAAACCCTATTTTCCT TCAGTTCCCTCCTCTTGTGTTAGGGTTCAAAACAAGATACGAATAGCACAGTCCACAGGTAAATCTTTCTTCCTTTCAATCTTTTTCTCCCTCTTTTCTT CATCCAAACTTGTTATTTACTTCTCATTCTTCCAATTATCAGTGAAATGGCTCCTAAACACCCAAGTACGGGTCTTTTTGTTGGACTGAACAAGGGTCAC ATTGTTACCAAAAGGGAATTACCTCCACGCCCTAGAGATCGCAAGGGGAAAACAAGCAAGAGGGTGCACTTTGTGAAGAACCTTATTCGCGAGGTTGCTG GTTTTGCACCTTATGAAAAGCGTATCACTGAGTTGCTCAAGGTTGGAAAGGACAAGAGGGCTCTGAAAGTAGCAAAGAGAAAGCTCGGAACCCACAAGCG 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TTTGATTGATAATGGGGAAGGCAAAGTTCATATTGATGATGAAAAGTTCATATTGTTTCACATCATGGGGAAGGCAAAGGTAGATCTTAATGAAAAAAAT TCACTTTCATGAAAAAGGTTATTATGGAAAATGGAACAATATTTCCATATGGAATGTTGTTAACCAAGATCTTCAACAATCATAATTTAAATTTGGAAGG AAAATCCCCTGATAGGGAATGTGGCCCCAGAATTATATTTGATTATAATATTGAAGACATCACCTATTCAAGACTTGCACCATGCTCGGCTGACTTGCCA CCTTTCCTTGAAATGAAAGAAGAAAATGATGAAGATGACTATTATAATGAAGATGACCATTATGATGATTTAGATGATTCTTATTCATCTTATAGTGAAG ACAACGATGATGTTGATGATAAACCCTTGGTTGTACACACTGTCAGAAGTGGAGGACGAGAAGGAGGGGCTGGAAAAAGAAAGAGATGATGGGCCATGGA AACCAACCTCAAAATTCACATCTATAGAAAAGATCTCTAATTATCTTGTAATGAAGTTGCTTATCTTTTATAGTGACTATGTATCTATTTTGTTTTCGTC ACATATTCAATGAGTATATATATATATGCACATGTAAAAA BLAST |
| Tissue | pods |
| Gene name | LI_gene_191285; |
| Additional information | details; |
| PAB | abscising pods |
| PNAB | non-abscising pods |
| PS1 | seeds stages 1-3 |
| PS2 | seeds stages 4-6 |
| PS3 | seeds stages 7-8 |
| PW1 | pods wall stages 1-3 |
| PW2 | pods wall stages 4-6 |
| PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_306837
| Blastp | - |
|---|---|
| Blastx | 60S ribosomal protein L36-3 from Arabidopsis with 85.26% of identity |
| Eggnog | - |
| Kegg | - |
| CantataDB | - |
| Mirbase | - |
| Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019442128.1) |
| Pfam | - |
| Rfam | - |
| GO | - |