Id Trinity | TRINITY_DN52268_c2_g3_i4 |
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Name Transcript | Ll_transcript_304741 |
Sequence | TGTTTTTAACTCGGCCACTATTGAATTTTTAGGCTCAGACCATGACAAAAACAATACTCTAGAGAGTGCATCAGCAGCCAAGTTGTCTTTTCCTGGCTTG TACTCAATGGTGAAGTCGTAGCCTAAGAATCTATGGAGCCACTTTTGTTGTTCTGGGGTGTGCAAACTTTGCTCCATTAAACTTCTTAAGCTTTGCTGAT CGGTGCGAATAATAAATCTATGACCCAATAGATAGTGTCTGAACTTCGCAATTGCTTCAGCTATGGCCAGCATTTCTCTAAAATAAGCAGACTTTTGTTG AGTGCGTGGTGCAAGTTTCTTGGAAAAATAGGCAATTGGGTGGCCATTTTGGTGTAACACTGCGCCTATGCCAACCCCCGAGGCATCGGTTTCTAAGATA AATGGTTGTTTGAAGTTTGGCAGCCCAAGAACAGGTGTTGTTGTCATGGTTGCCTTGAGTGTTTTGAAGGTTGTGTCCGTGGCCTCAGTCCACACATAAC CATCTTTCTTGAGTAATTCAGTTAGAGGAGTAGCAATGTTGGCATATGCTTTGATAAAACGTCTATAGTAGCCTGTGAGACCCAAGAATCCTCGTAATTG ATGCACATTTGTTGGTGTTGGCCAATCAAGGATTGCTTGAATCTTGCTGTTAACCATAGAAACACCTTGTCCAGAAACAATGTGACCCAAATATTCAATT TCTAGGACACCAAATGAACACTTGGATAATTTTGCAAACAGCACATGTTGTTGAAGAACCTGTAGCACATTTTCCAAATGAGTCAAATGGTCATGCCAAG TAACACTATAAATGAGTATATCATCACAAAAAACAAGCACATATTTTCTTAAGGCCTCCTGAAAAACCTGATTCATCAAATTTTGAAAAGTTGCGGGAGC 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Tissue | pods |
Gene name | LI_gene_191385; |
Additional information | details; |
PAB | abscising pods |
PNAB | non-abscising pods |
PS1 | seeds stages 1-3 |
PS2 | seeds stages 4-6 |
PS3 | seeds stages 7-8 |
PW1 | pods wall stages 1-3 |
PW2 | pods wall stages 4-6 |
PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_304741
Blastp | Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon 297 from Sophophora with 44.67% of identity |
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Blastx | Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon 297 from Sophophora with 44.5% of identity |
Eggnog | - |
Kegg | - |
CantataDB | Link to cantataDB annotations (CNT0002914) |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_014627597.1) |
Pfam | Reverse transcriptase (RNA-dependent DNA polymerase) (PF00078.26) |
Rfam | - |
GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |