| Id Trinity | TRINITY_DN52279_c2_g1_i22 |
|---|---|
| Name Transcript | Ll_transcript_305834 |
| Sequence | TCTTGTACTACAGTCATTCCATCCCATGCCCTGATGTACTGTTTTGATGTTGTAGGTATCCATACAATAACTTTCTGCATCACCATGTAGAAAATATTAT TATGTCATGCTTGGAGAGCAAGAATTCTTTTCTTGTTGCGCACCTTCTCCATGATTGTGATTTTGTTGGGAAAATTATTCAAGCAGAAAAGCATTTCACA TTGGAAGCTGATGCAAACAAGCCAACAATACCTTCTGAGGGAAAGTCACCTCCTCGGATAGGAAGCATAGGACACTTAACCCGTATTTCTAACAAACTTG GCCAGTTAGGGAATAACAACAGTGTGATTCAGGAGCATTTGCAGGGAAACACTGAATGGACAGATTGGTATGCAGATGTTCTATCAAAGCGAAACACTGT GGAAAATGTTTACCAATGGGCATGTGGGAGACCAACAGCGTTGCATGACAGAAATAGGGATAGTGACGATGATGATTATCAAGATCGGGACTATGATGTT GCAGCCTTAGCAAATAACTTGAGTCAAGCCTTCCGTTATGGCATTTACAATAATGAAGACATTGAAGAGGTACTTTCCTTTTTAAGCAGCACCTGGCAAT CTGCATTTCATTGTTTCATTGTTTATAGGCCTTATCATAAAAGAGATACAGCTGGAGTTTCCATTGAAAGTTTATTTTATCAAACCTCAATTTAATTGAT TATCGGTGCTGCCTGTATAATACCTTTAAGGTAGATTTTTTCAAAATGACCAGAAGTTATTAGAATGTAGTAACACATAAGATTATTGAAGTTTGCCTAT GTGTTAATACACGGATGTCACCAGCTCACAGTTAATTATTATGCTTGGCTCCTACACTATTGTAGATGTTCTAGGCACAGCTTTATGTACCTGAACCAGA TCAGATTCAGTCAGTTATGACAGTTTGCAGTTCTCTGAATTCCAAATCTCTCCTTTCTGTTCCTATTTTCCTTAACTCTTTCTCTCGTTTTATCAGATAT CATGAACTCTGAAAGAAGTTTCTGGCAAAATGAATTGTGTTGGGGGTTTTATTGTGTCAAAAGGTTTAACTTAAATTGGAACGGCTCAGTCCTGGGTTCT CAAATCCTTTTTGTTAGGTAGTAAAGACAACTTATCCTATCAGAAAGCAGTTTGCATGTCATATCTTCGCCATACTAAACAAATAAGCTCGGCATTATTC CCATCTAATGTAGGACTATCTTAACATCTACAGTTATAAAAGATCTCAGACTCGATAACTTCTGCTACTACTTTTTATGTCAAATTGCTCTGCAAAATTT GTCCAACAAATAGCCAGTTTGTGCTTTTTTACACATTTTACTTACAGATTTTGGTTACCACTTTCTTAGTCATTGGGAATTACTATCCTTAGTTCATCAA CATTTCGCAACTATAATTTATGTTATTATATAATACAAGATTTTGTCTGATGGATAACAAATTTGTGATTTTTTTGCTCATTTTACTACAGGAGGTTAGT AACCATGTTCCTAGTGGTTAAATATTATTTTCGTCACCCCTTCATAATTTTTCTGTATTTCATTATAGTAAGATAAATTTCTGATGGCTGATGCCAATTT TAGGTTTTGATCCCTCTTTGATAATGGACCTGCTTTATGTACTAATGATTTGTTGCTCTTGCTTGTCATGATTGTCATTTTATGGTTTTAGTCATTGGTT CTCAATTCCTGACCTGTGTATATTGTGTTTCAGGTTCATGGCTCCCTTGAACGAGATGATGAGGTAACATTTTATTTTCCTCTTAATGTGGAGTCCTGGG GGAAATGAATTTATAATTGAATGTGGCAAGTTAGTTCTTCGGCTAATTTTCTCCTGTAAAAAAAACTTGACTGAAATGGAAAGAGTAATCTGATTACATT CAATATTTGTCTCATTAGCATACTAGTATATCAACATGATTTAAGATAGAGTTTATGATACCGTTTGATCCATATAGTCAACTCCACCTAGAGGGATGAA GACTTGGTTGTTGTTGTATTATATTAGTATCAGGAAGGTTTCACCTCACTAGTACATTATAGTTGCAATATGTGGCGTTAATGTGTGATTTGTCTACATA TCACGTGACATCAGCTAAAGTCCACCTGTCCTTTCTAATGCTTAAATTTTTTTGGAGGGTTCTTGAATTGTTGTGATGCTTTTAATTACCTTATTCCCGT AGTAAACTCTTCTGGTTAAAAACCTCTTAAGAAATTCCTTTTATTGTAGTTTTCACTCATTGCTTGAATTAGTTAAGATATTCATAATGATAGTGGATAT TCTAAATCAGAAAAGGGCTAAGAAGAAGAAAGTCCTAATTGAACTATTGTTCACGGAATTGAATAAATTAGGAAAGGAATGATATACTATATAATTAACC TTTTAATTTAGGAATGAAGGAAATTGAGTACATATCTGGTGTTCATGAGCACAGGAGCAATTTGATATCAGGTTCCTAAGGATATTTTGCCTTTAGCAAT TTCATCTGTATAATCAGTACAAATTTTGCAACAGGAACAACTTGTCTGCTTGATTCTTTTGAATGTGATATCACCAAGCGTTGTTTATGGGTTATGTGCA ACCCTTCATTTCATTATTGATTAATAATAGATTTTCTTATATATTTGGTCTCGCACGAGCCCACATGAGCGTGTCTGATGTCGTAGCCCTGGCCACAATA TGCTTTCAATGCCCCTTCTTAAACGTTTACCCACATGAAGTTCAGGTTGCCAACATGAGCCGCAGCCTGTGGTTAGACAGTGTTTTAATCCAACTAATCT GCAGTCGCAGCACATGATGTCTTTTCTTGTGTGATTTCTGTGCTTATCTTTATCATTGATTGTCATAATGAAGCATCTTATGTCTACATATTCTGCAGGA TGTGTACTTCGATGATGAATCTGCAGAAGTTGTTATATCTTCTTTGCGGTTGGGAGATGACCATGAAAGTGGCTCTCTTTTCACAAATTCCAACTGGTTT GATTTTGAGGATGATAGAAATGAAGTAGCCAATGAACGCTCAACTGGTTCAGTTGCTTCTCCATCACCCAATGCTGAGGAGGACGGTGCTATCATTGCAA GTGGAGATGATGATGTTGTTACTGGTGAAGATGGTGACTTAGCTGACACGGCATCATCTTCGCCTGAAGCAGAACCAAAATTAGAACAAAGTGGAACTGA TATACCGGTTGAGTGGGTTGAATGGAGAGAATCTTCAGATGCCAATGACCCTTCTGATGTTTTGCTCAACAGAGAACTTGAGACAGAATCAGAGAAGAAT AATCCCGATACAGATGAACCATCATCTCCATCACCCGTTGCATTAGCAAAGGATGAACAGGTTGCTGCCGAAATATTACCATCCTCCAGTATTGCATTAA CAAAGGATGAAAAGATTGCTGCTGAGCCACTAGCATCATCTAGTGTTGCCTTAACAAAGAAGGAACAAGTTGCTGCTGAACCACCAGCATCTGTTAATGA GACCCCAACTATTGAAACCTCTGAGCCAACTCACACAGGAAATGAAAATCCAACTTCATTTACACCCACTTCTGCGAATGAGGCAGTGGCTCAAGTTGGA GGAGATGACAGCAATGATACAACAGAGCTCAAAAAAGAAGTCGCAAATTAGTAGCTAATGTAAATTCCCGTGAATCCGCATCGGTAGCTATGCAACATAT TAGCCAGGTGGGAAGATATATTCTAAGAATGGCTAGGCATAGTATTTAGTTCTGCAGCTGGTTTATTTTTATAGGAAAACTGATTTATTACTCCCACCTA CTTCTGAAGCTTTTTTAATAAGGCTTTAGCACATGCCATTAGTAGCTACTGCCAAATTCTTCACCTGTCCATATCAATATTTACTAATCCAATTAGGTGT TTAACTGTTTATACAAATACATCTCTTCGTTCCAAGTGTTTAGGAATGGATGTTCATTCATTATCCGATTGTTGAACAAACTCAGTTTTTTAGCATTGCA AAGCTTGATGGAGATGCTGATAGAGATTTGTACTTCAAAGGGCATGCTGGAAATGAGAGAAAATAAAAATGAAGGTGGATCTTTTGTAATTATAATTTGA GAGGAATAAGATTTGTTACAGATTCTGGAACTTGTATTGATTTCTTCAGGTATTGTATAAGTTTGTTTCCTAATCAACTTTAGAGCAGAGACTATCTATC TAGTACTACATGATTTAAGAAGTCTCATACATTGGCGTTTTTTGTGTTTGTTTTACTATTTGACGATATGTTAACATTAAACAGCTAAACTCAACGACCC TATAAACCAAAGAAAAGCATATAACACAAG BLAST |
| Tissue | pods |
| Gene name | LI_gene_191445; |
| Additional information | details; |
| PAB | abscising pods |
| PNAB | non-abscising pods |
| PS1 | seeds stages 1-3 |
| PS2 | seeds stages 4-6 |
| PS3 | seeds stages 7-8 |
| PW1 | pods wall stages 1-3 |
| PW2 | pods wall stages 4-6 |
| PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_305834
| Blastp | - |
|---|---|
| Blastx | - |
| Eggnog | - |
| Kegg | - |
| CantataDB | - |
| Mirbase | - |
| Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019440103.1) |
| Pfam | SIT4 phosphatase-associated protein (PF04499.14) |
| Rfam | - |
| GO | - |