Id Trinity | TRINITY_DN52289_c1_g3_i4 |
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Name Transcript | Ll_transcript_306322 |
Sequence | CTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTGCTTCTTCTATTTTTCCCTTTTACTCTATTTCAAGGCTCACTTCACTTCTTTGCAACCCATCACTCATCTCATGTA AAGATCGCAACTTTACATCTGGGTCGTCACAATTTCATTTGCTCTTTTCTTCTAGTCATTCCATATCTTCATCTCAAATATTGTTATTTTTTAATTCTCT TTTATATTATCCATTATCAAATTGGAATTCATTCTTATTTAATCATGCATTATTTCCTATTTATGGCTCATATTTCCATAACTGAAATCTCCGCATGTGT GATTTAGTTGTGAAGGAAAATGAGAAGAACTGCCTAAGCTTGTAAAAAAAGTGAAAATAATTGTAATAATTTGCGTGGAATTTTTTTAAAATTTTCGTCG CCATGGTTGATTCACAAATTGGAATTTTTTGTTAATAATGCATAGGAAGTTCTGAAAATTCAATTTATGGTTTTTCATTTTTGTATAACTGGAATCCTTT TCTTTTTCTAAGTGTGGTCTGTGAAGGGAAATGACAAGAACTGGCCAAGCTTGAAGGAAAAAAGTTGATCTTTTTGCTTTGAATTTGGCTGTGATGGAGT TCCCTACCGTTCCTCATTTGATGCGAGTCTGCACCCTTTTGCTGCTTCTATTACTATTGAAGAGTGATGTTGTATATTCCAATTCTGATTACTTGATCGG TCTTGGAAGCTATGATATAACGGGTCCTGCAGCTGATGTTAACATGATGGGTTATGCTAACACAGAACAAGTTGCATCTGGTGTTCACTTAAGGCTGCGG TCTCGGGCCTTCATTGTTGCTGAACCACATGGTAACCGGGTAGTTTTTGTGAATCTTGATGCTTGTATGGCTTCACAGCTTGTGACTATCAAAGTACTTG 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CAATTTTCATATTAATCTTTTTCCTCATGTTATGCTTTATTCAATTCTTCCACGACCAATTAAAGTTCCAAGTTTCTTCCAAATTCATCATTTCAAAACG ACACATGTCTTCTTTTATCCCTTAAAATTCACAAGCTTTAATATTATAATGTCAACTTGAAAGATCTACCATTAGTGGTGGTTCGAACTTGTAGTTGAGA ATTACACAAAGTAACAGGTTTTTTCCCTCTGACAACTTTGTCACTCATTATTTCCTTTGCAAGTGGGATATATGTTTTTTTCATGACTCACTTTC BLAST |
Tissue | pods |
Gene name | LI_gene_191516; |
Additional information | details; |
PAB | abscising pods |
PNAB | non-abscising pods |
PS1 | seeds stages 1-3 |
PS2 | seeds stages 4-6 |
PS3 | seeds stages 7-8 |
PW1 | pods wall stages 1-3 |
PW2 | pods wall stages 4-6 |
PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_306322
Blastp | Neutral ceramidase 1 from Arabidopsis with 77.82% of identity |
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Blastx | Neutral ceramidase 1 from Arabidopsis with 78.6% of identity |
Eggnog | Ceramidase(ENOG410XQWE) |
Kegg | - |
CantataDB | - |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019460497.1) |
Pfam | Neutral/alkaline non-lysosomal ceramidase, N-terminal (PF04734.12) |
Rfam | - |
GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |