Ll_transcript_306328

Id TrinityTRINITY_DN52289_c1_g3_i8
Name TranscriptLl_transcript_306328
SequenceCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTGCTTCTTCTATTTTTCCCTTTTACTCTATTTCAAGGCTCACTTCACTTCTTTGCAACCCATCACTCATCTCATGTA AAGATCGCAACTTTACATCTGGGTCGTCACAATTTCATTTGCTCTTTTCTTCTAGTCATTCCATATCTTCATCTCAAATATTGTTATTTTTTAATTCTCT TTTATATTATCCATTATCAAATTGGAATTCATTCTTATTTAATCATGCATTATTTCCTATTTATGGCTCATATTTCCATAACTGAAATCTCCGCATGTGT GATTTAGTTGTGAAGGAAAATGAGAAGAACTGCCTAAGCTTGTAAAAAAAGTGAAAATAATTGTAATAATTTGCGTGGAATTTTTTTAAAATTTTCGTCG CCATGGTTGATTCACAAATTGGAATTTTTTGTTAATAATGCATAGGAAGTTCTGAAAATTCAATTTATGGTTTTTCATTTTTGTATAACTGGAATCCTTT TCTTTTTCTAAGTGTGGTCTGTGAAGGGAAATGACAAGAACTGGCCAAGCTTGAAGGAAAAAAGTTGATCTTTTTGCTTTGAATTTGGCTGTGATGGAGT TCCCTACCGTTCCTCATTTGATGCGAGTCTGCACCCTTTTGCTGCTTCTATTACTATTGAAGAGTGATGTTGTATATTCCAATTCTGATTACTTGATCGG TCTTGGAAGCTATGATATAACGGGTCCTGCAGCTGATGTTAACATGATGGGTTATGCTAACACAGAACAAGTTGCATCTGGTGTTCACTTAAGGCTGCGG TCTCGGGCCTTCATTGTTGCTGAACCACATGGTAACCGGGTAGTTTTTGTGAATCTTGATGCTTGTATGGCTTCACAGCTTGTGACTATCAAAGTACTTG AGAGGCTCAAAGCAAGATATAGTGACCTGTATAATGAAAATAATGTAGCTATTAGTGGCATTCACACTCATGCTGGTCCTGGGGGTTATCTTCAGTATGT TGTGTATATTGTAACATCTCTTGGATTTGTGCGCCAGTCGTTTGACGCCCTTGTTGATGGCATTGAGAAAAGCATTGTCAAAGCCCATGAAAATCTCCGC CCAGGATCAATATTTGTCAATAAGGGAGATCTCTTAGATGCTGGTGTAAATCGAAGTCCTAGTGCTTATCTCAATAATCCTGCTGCAGAGAGAAGCAAAT ATATGTATAATGTTGATAAAGAAATGACTCTTTTAAAGTTTGTTGAAGATGAACGGGGTCCTGTGGGAAGCTTCAACTGGTTTGCTACTCACGGAACTTC AATGAGCCGTACAAACTCATTAATTAGTGGTGACAATAAAGGTGCTGCTGCACGACTTATGGAAGACTGGTTCGAGCGAAAAGATTCTGTAAAAATGAAC TCTGTTGGATTTGAAGATAATAGCATCCCCCGAAGAATTTCAAACATAATTCCCAGCCTCGGCAATAATCACCATGAATTATTGGAACTTGCTTCCTCAT TTCAATCTCCTCCTGGTAGGCCAACATCCAGAACTTCGAGTGTTGCTAGACGTGTGAGAGGTGATCTTAGTCAGGTTGACAAGCCTAGATTTGTATCTGC ATTTTGTCAATCTAATTGTGGTGATGTTAGTCCAAATGTACTTGGAGCTTTTTGTACAGACACTGGACTACCTTGTGACTTCAATCATAGTACATGTGGA GGGAAGAATGAATTATGCTATGGCCGTGGACCTGGTTACCCAGATGAATTTGAAAGTACACGTATTATAGGGGAGAGGCAATTTAGGAAAGCAGTGGATC TGTTCAATGGAGCATCTGAACAAATTAAAGGGAAGGTTGATTATCGACATACCTACATAGATTTCTCCAAGCATGAGGTAACTCTTTCCAAAGGAGGGGC TTCTGAGGTAGTCAAGACATGCCCTGCTGCAATGGGATTTGCATTTGCTGCTGGAACAACAGATGGGCCTGGAGCTTTTGATTTTAAGCAGGGTGATGAT AAGGGAAATCCTTTCTGGAACTTGGTCCGCAACGTACTTAAATCACCAAACAAGGAACAAATAGACTGTCAACAGCCTAAGCCCATTTTGCTTGATACTG GTGAAATGAAGTTACCATATGACTGGGCAGTAAGTTATTCATTTTCCCGAATATTATGATTTATTGTCTCCCGGCTCAGTTCAATTGTGTTCTCTATGTT TGCTGAAAGATGAAATGTTGATGGCATAAATACTGTCTTCAGCGGATAACTTACTTTCCTCAGGGCATTGCATAACTTGATGACTGTTTTTTTATAATAA TAACTTGATCACCGTTCTCGCCTTCTCCACTTTAGTTCCTTCAGTGAATTCAAACCATTGTTACAACGTCATTCTTCTTTGTTTTTGTTTTATGTTTGGG TTGAAGTCCTAGTATGCATTCTCCAGTTCTTATGATGTATGTTTTTTCAAGATGTTTATTTAATGTTTTCTGGTCAGTGAAGCTAAACTGCTTAAGTTCC ATATAGAAAGTATCTCTGCATCTGTTTTCTGCAGTATAGATATAATTTATGCTAATAAAAGGATCACTTTTACTTAACTAGAGCTTTTTTCACTCGTGTT CATTGCAGCCCTCAATCCTTCCAATCCAGATCCTCCGAGTTGGGCAGTTTGTTATTCTAAGTGTACCAGGAGGTATGAGCTCATATTCTTGTTTCCTATT AAAGATGCTGCTGTTGGAATTCCTATCCTTCACAATTTGAAATGTTAAGTTTAACTACTAATGATCTTAGTGGTATGAGAAGTAATATATAAATCCATAT TAATGAAAAATAAACATGCCTGGATAAAGTTTGTTGAACATCTTCAAGTTTAAAAGAACAAAAACATGTTGAGCTGTTATTGATATGATGATAATTTGTT GCTATGGCTTCTTACAGTATGGTTACAATTCCATGTCTTAGTTGTAATTAATTGCTTCTGGTTTTGCTTTCTTATGAGTGTATAAATATTTAACGCAATG CAAATTGCCAGCATAATATGTTGTTGCGCCTCTATATATGCTTTGGAAATTCATGGTTATTATGTATACATATATGTATTTTTTTGAGGCAAACCAATTA CACCTATGTATTTCTTTTGGTGCATCGCGCTTGTAACTTTCTTGATTCTGGCAGAATTTACAACAATGGCTGGAAGGCGTCTTCGTGATGCAGTGATGGC AGTGTTAAGCAGCAACAAAGATTTTGGCAGCAACGTTCATGTTGTCTTAGCAGGGTTGACTAATACTTATTCACAGTATGTGACAACATACGAAGAGTAC CAGGTCCAAAGATATGAGGGTGCTTCCACACTGTATGGTCCACACACACTGAGTGCATACATTCAAGAGTTCAAGAAGCTAGCAAAAGCTCTCATCAGTG ACCAAAATGTAGAACCAGGTCCACAACCACCAGATCTCCTGAACCAGCAAATAAGCTTACTAACACCGGTTGTAGCGGATGGTACCCCTATCGGTGTAAA CTTCGGAGATGTCATTGCTGACGTACCGAAGAACGCAACCTTCAAGAAAGGTGATAAGGTCACTGTTACTTTCTGGTCTGGGTGCCCTCGTAATGACCTT ATGACTGAAGGCACATTTGCCCTTGTGGAGTTCCTCAGAGGAAAGGATACTTGGGTTCCTGCTTATGATGACGATGATTTCTGTTTGCGATTTATATGGT CGAGGCCGTGGAAACTCAGTTTACGCAGTAAAGCCACCTTAGAATGGCGAATCCCACAGGACGTAACTCCTGGTGTATACAGGTTAAAACATTTTGGTGC TGCAAAGAGCTTGTTAGAATCAATTCGTCATTTTACAGGGTCATCAAGTGCATTTGTAGTAACATGATAAAGGGGCATTGTAGTTTATATTTTACAGTTT ACAATTATCACTATACTTATGACTTGTTGGACTGAGCTTTAGCAGAATACACTAAATCAAGGATCATAACTGTGTTCTCTACTATTATCCATCACCTTTC CCTTGAGTATCATTCTATTATGAAAATCTGCATATGTAGGCACAACCGAACAAGATTAATGTAGACATGCTAATTGGTTGTACTCATAGGCATGTGCCTA TGTAAGTTTTATGGACAACAACATCCAACCAAAGTTTATTTTCCTCCCCAAGTGAAACCTGTTACATTGGTTTGAGATATAGCTGAAAAAAGTGGATTAT TTTATGAAAGAACTTTTGGGCCTATAAAAAGTGGGATTTGTGCTTATGAAAATTATCAAGTCATCAGGATAAGAAAATCTTGAAAGACGATAAACAATTT TATGAACAATGCAGAGTAGAATTTGTTGATTCTCGAATACGTAGGTATAAAATGGGCTATATAAAACTGGCATGCCCCGTAACCCACGTGTGGTATTTGA AACGTCTTCCTAGTTATATCGCGAATCTTTTAGATAAATCTCTGAAAGAATTAGAAGGTCTAGTATACTGCGATGTGTGATTTGATCAAAATTCTTATTT TATTGTACAGATTCCGAATGAGAAACTGTTATTCCAGTCAATTGAATTGGCATGCCCCGGATCTGACATGTATGTCTCTTTGGCCGAGTAACATGAAGCT CAGAATTATGGGTATATTAAATACTCTAAAAAAAAAAAGGGGGGGGTTGGTCTATGGTCCATTCAGTAATAGCTGTTACCTCGTGAAAAAAAAAAAAAAA AAATCTTTTTTTTGTAATTCCTATGATGCAATTGGAGCTTATCGACAGAAAAGAATCAATTTCGACAGTCCTTTGTGGCTCCGGTGGCGACTAGATCAAC GCGTTATTTCGTCAAGAGAAGCTCCTATCGAAGTTCACTACGAATCTTTAGGTACCTATCATGATATTTATGAGCATTATCTAGTAGTCAGAAGTATAAA AAAACAAATTCGTTGTATATATATTCGAACCACTGTTGGTCATATTTCTTTTTATCGAGAAATCGAAGAAGCTATACAAGGCTTTTGTCGAGCCCATTCA TAGGGTATCCAATCATATACATAGATGGGTTGGTATCTAACCTAAGTCAATTTAGGATATCGGTGTGAATTCCGGTCTTCCCGGTTCGACTATATGATCC TAACTTATAAATTTCTACGCGAATCAAGCTAAAGAAAAGGAAGTTTTACAATCATTGACTCAAATCCATTGTTGAACCGAACTCCACTGAGCGGAATATG GAGGTACTTATGGCAGAACCGGCCAATTTAGTCTTTCACAATAAAGTTATAGGTGGAACCGTCATTAAACGACTTATTAGCAGATTAATAGACCATATGA AACTTGCTTTGCAGCATTTGTTTTCGGAGCTTCACTGATGATTACTGTGGGTTCACTATGTTTTTTATGTCGGCGGCGCACCAAATTGAGAGTAACAAAG AGCACAAAAAGGCGCATAACTGAAGCTACTGGCAACTACAGTGTTCCTATCTATCCATACAAGGACATTGAGAAAGCCACAAATAGCTTCTCGGAGAAGC AACAGCTTGGAAATGGGGCATATGGGACAGTTTATGCAGGGAAGCTTTACAATGATGAATGGGTTGCAATCAAGAGAATTAAGCATAGAGACACTGATAG TATTGAGCAAGTAATGAATGAGATCAAGCTCCTTTCTTCTGTTAGCCACACCAATTTAGTGCGCTTGTTGGGTTGTTCCATAGAATATGGTGAACAAATC CTAGTCTATGAGTTCATGCCCAATGGAACATTGAGTCAGCATTTGCAAAGAGAAAGAGGGAATGGTCTTACATGGCCAGTTAGACTTGCAATTGCAGCAG AAACAGCACAAGCAATAGCACATCTTCATTCTACTATTAATCCTCCTATTTACCATAGAGATATAAAGTCAAGTAACATACTTTTGGACTATCATTTCAG ATCCAAAGTAGCAGATTTTGGTCTCTCTAGACTTGGAATGACTGAAACATCTCACATTTCAACTGCCCCACAAGGAACCCCTGGCTATGTTGATCCACAA TACCATCAAGATTTTCAACTTTCTGACAAAAGTGATGTGTATAGCTTTGGTGTTGTTCTTGTAGAGATTATAACAGGAATGAAAGTAGTGGACTTTTCTC GTCCTCATAATGAAGTAAACTTAGCTTCTCTTGCTGCAGATAGGATTGGAAGGGGGCTATTAGATGAGATTATAGATCCATTTCTTGAGCCTGAAGTAAG TAATGATGCTTGGTCCTTTTCTTCTATACACAAGATTTCTGAATTAGCATTTAGATGCCTTGCATTTCATAGGGATATGAGGCCTTCTATGACAGAAATA GCAACTGAGTTAGAGCATGTCAGGCTTAGTAACTGGTTAAGTTTTGGAGATAACAATGTTACAACTTCAACAGAGTTGTCCTCTTGTTCTACTTCCTCTT ATCAAAGTGAGAAACCACTAAAAATGGTCGTGGAGAAGAAGGTTGAGCCAGAGGATAAAGCTAAAGCTTATCTCAGATTACAAACTGGGCCAGTTGCATT AAACTCATTGGAAAGGACCAATAGTACTGCATCACCTGTTTCAGTGCAAGATCCAGAAATATGGCTGAGTGAACAAAACTCTTCTTCATCATATAGTTTT CCTAGAAAGTCTTTTAATTGAACTAAGACTATACCTTTTTTTTGGATAGACAAGACTATTCTTTCTTTCATCAAATAGTTGCTAATAAATCATGAACACC CCACATGTTTTATTGCCATTGCTAAGGTCATAGAGATAAAATTCTATAGTGAGGCTTTATTCACTCATAAAATTGATAATTTTTAAAGCAATTTTCATAT TAATCTTTTTCCTCATGTTATGCTTTATTCAATTCTTCCACGACCAATTAAAGTTCCAAGTTTCTTCCAAATTCATCATTTCAAAACGACACATGTCTTC TTTTATCCCTTAAAATTCACAAGCTTTAATATTATAATGTCAACTTGAAAGATCTACCATTAGTGGTGGTTCGAACTTGTAGTTGAGAATTACACAAAGT AACAGGTTTTTTCCCTCTGACAACTTTGTCACTCATTATTTCCTTTGCAAGTGGGATATATGTTTTTTTCATGACTCACTTTC BLAST
Tissuepods
Gene nameLI_gene_191516; 
Additional informationdetails; 

Expression of Ll_transcript_306328

Labels

PAB abscising pods
PNAB non-abscising pods
PS1 seeds stages 1-3
PS2 seeds stages 4-6
PS3 seeds stages 7-8
PW1 pods wall stages 1-3
PW2 pods wall stages 4-6
PW3 pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_306328
BlastpNeutral ceramidase 1 from Arabidopsis with 78.71% of identity
BlastxNeutral ceramidase 1 from Arabidopsis with 79.55% of identity
EggnogCeramidase(ENOG410XQWE)
Kegg-
CantataDB-
Mirbase-
Ncbi proteinLink to NCBI protein (XP_019460497.1)
PfamNeutral/alkaline non-lysosomal ceramidase, N-terminal (PF04734.12)
Rfam-
GOLinks to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;