Ll_transcript_306343

• Id Trinity: TRINITY_DN52289_c1_g6_i3
• Name Transcript: Ll_transcript_306343
• Sequence: AGAAAAGTGAAGGTAATGACCCAATTTGATTAGGTTTTGAAGAGTTGGTGATAGCAGCATTGTTCCACTTCCATGGCTTCGGAGAAAGAAGCTGCTCTTG CAGCTGCTCCCTCTGATTCTCCCACCATATTTGACAAGATCATCAATAAGGAAATTCCTTCTACTGTGGTTTATGAGGATGATAAGGTCCTTGCCTTTAG GGACATATCGCCTCAAGCTCCTACCCATATTCTAATCATTCCTAAAACCAGGGATGGGTTAACTGGTCTATCCAAGGTAACTTAATGGTTTTTCTTTGCC AGTAGACATATTATGTTGTCTCGGATGTTCATTTGGAAACAGGCATCACAGATATACATGGGGCTAATATACTTAATACATAATTTATTACATATTTTTT AAAGTTCGTTTAAAAGGACAACTATTTAGGAATACTTACATTAGTGGTAGATTTCCTTCAGTGTTGATGTGCTGATATTCTGGATAAAAAGACTGTAGCT TGTATCCCCATGTAGTAATAATGCTGCCGCTTTGAAGTTGTCATATGAGGAGGGTTTATCACTTAGGAAAAAAATGATAAAATGCTGAGTCGAGTACCTA AAAGTCTGCTATCATGTGCCAGATAACACTCACTGCTATTGTTCATTATCTTGTAGTTATTAGATGGCCCACATGTTTTTGGATCCAATCTTAGGTTTGT GGAGATGCCAAATATTGGCGGAGTTGTGGTTACTTTGAATTGCTTTGTAAATATACTGCTTATAATTATTTAGGTTGATGCTAAGCTAAATCTTTGATTA TGGCGGCTGATATCACATTCTTTAGCAGAAGAGATTCTACATTCTAGTGCCTTAGTACTATAATTTTTTTGATGTGAAAAAGGTTTTTGGTATTTGTTCA AGTTTTGAATTCATACAGTTTCATTTTAAAGCAATCTGGTTTGGCCTGCGAGATAGTTTGATGTGTTGTAGCCTTGTAGGCCCCTTCTATAAATTTATCC ATTGTTACATATGTGGCGTCTTTGCAGCCTATAGCTCTCTCCATTTTATGATGAGCCAAGCTTGATGCTTTAGATTGCTTCCCTCGCCAACCTTAAATGT CTTTCTTTTCCTTGAGCTCCTGCCTACTATACTTCATTGTTGCTATCCTCACATCATTGTAGCATGAAGTATTTTAGCCTGAAAACACCATCAGCAACTT ATTAAAACATGCTTTGTATGTGCTAGGCATTTTATGTCAATTCTTTCTCGTATGAGGTTATATTACCTATGTGTATATTATAACATTATTTTACTATTTT CAAAGTCTAGTTGACTGCAAATATCCATAGCCTAATTATATGTGTTACATGATTCCTACTGGTAAATCAACTTTTGTTTGACAATTATCAGACTGTGCTA ATATCCTCTTAATAAATTGAGCTAAGCATTGGCTCATTCCGGAGTTGTGGGTTGAAAGGAATCCTCCATATTCCGATCAGTGGAGTTCGGTTCAACAATG GATTTGAGTCAATGATTGTAAAACTTCCTTTTCTTTAGCTTGATTCGCGTAGAAATTTGTAAGTTAGGATCATATAGTCAAACCGGGAAGAGTAATGTGA CATGATAACAGGAAGGAAAAAATAGTAGGGAACTGTTAAATTAGTTTAAGTATCATTCACCCAACAAAATTCTTGTCAGATGGTGACACTAAGGTAGCCT GTGCCCTCTAGGTAGTTAATCGTGTTGACTGCTACTTAGTGACCAAGAAGTCACAAGTTCAAATCGTGTAAATACCCTTCTCGCGCGCTGAGCCGCCCTT TTATGTCTGTCATCGTGTACTGATTTAATAAGGTATTGTTTCCAGGCTGAGGAGAGACACACTGAGATTCTCGGCCGTCTTCTGTACACTGCCAAGCTGG TTGCAAAGCAAGAAGGTCTCGATGATGGCTACAGGATTGTAATTAATGATGGGCCAAGTGGATGCCAATCAGTTTACCACATTCATGTGCATCTCCTCGG CGGACGACAAATGAACTGGCCCCCTGGATAAAAATGTGACTAAGGATTCATAATCATGTTCTGGCTTTGTGTCTATCAATAATGGTTTCAAATAACTAAT CCTTAGCTACTACTTGTTTGAGAAATTATGATGATGAGTTATGTTGGTTTTGTTTAAACATGGTGTTTTGAATATATTCTAAAACTGAATAATAAAACTT GTTCCTAGATTCTTTTGTTTGTGTCACTGCCTATGCAAAATGGTATAGTTGCTGCACCAATATTATGTTTGTGGTGTATATGCTGATAGTGTGCTTCATT TTGTGGTGTTTTTTAGAGATTGAATTTTGGTGAAGTGGGTGTGCTCATCTTTCAAAGTTAATCTATGACATTCATCTTGTGCAAATTTGAAATCATTAGT TTTGATTCAAAAC
• Tissue: pods
• Gene name: LI_gene_191519;
• Additional information: -

Expression of Ll_transcript_306343

FPKM

• PAB: 0.1
• PNAB: 0.6
• PS1: 0.4
• PS2: 0.3
• PS3: 0.1
• PW1: 0.1
• PW2: 0
• PW3: 0.3

Labels

• PAB: abscising pods
• PNAB: non-abscising pods
• PS1: seeds stages 1-3
• PS2: seeds stages 4-6
• PS3: seeds stages 7-8
• PW1: pods wall stages 1-3
• PW2: pods wall stages 4-6
• PW3: pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_306343

• Blastp: -
• Blastx: 14 kDa zinc-binding protein from Brassica with 88.89% of identity
• Eggnog: -
• Kegg: -
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019457140.1)
• Pfam: -
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;