Ll_transcript_487196

Id TrinityTRINITY_DN52304_c1_g1_i25
Name TranscriptLl_transcript_487196
SequenceAGGGCAGAAGATGTTCTTGCTCATAAGAGATTGCTCAAGTTGGCAGAGGACCCTACCAACCAACCTGCATTTCAAGTTCGCTTAGTACAGGTATATCCTT CTGGCAGTGCAATTGATTCCATGCACTCAGATCCTTCTGAGAAAGAAGATGCACAAAGTTCTCTTAATTATTCTTTTAAGCAGGGAATTCATCCACCACC TACTTTTGGTTCATCCTCTAATCTTGAAACTCTTCCACTTCAAACAACTAAAAATAACATTGAAGATGGTGGCAGTGCTATGGGTGTGAAAGCATGTTTT CCACGGCCCATGCATGAGATTACCTTTTCAACAATTGACAAGCCCAAACTCCTTAGTCAGTTAACTTCAATACTTGGTGAGATGGGACTTAACATTCTAG AAGCTCATGCATTTTCCACCACTGATGGGTTTTCTCTAGATGTTTTTGTCGTCGAGGGATGGCCAAACGAGGTAGGAAGAAAATAGATAACCAATCTCCT CCTAGAAAGTATTTGGGAAACATAGAGGCTTAATTATGTAGGCCTTGAAAATCTTGATATGAGAACAGGCTGCAGTTTTGAATTTGTAAAAAAGATGTGT AAAGATCCGACTTCAACATTTTCTTATCACTTCATGGCATGCTTACCATTCCATTAAACCATTCCAATAGATGATATATGGTTGCTTATGCTGTCCCCAT GGAATTTTTAACTATCATATTGTATGGAACAAATACATAAATGCATCGTTATTTGATCAATTTTGGATATGGCAGGTTATTTTATTAAACAGTATGCCTA ATCAGTGTAAACAATATCATCAGCCAACAATGTAAAAACATTCCATTTTAGCTATAAAGTTAAGGCATGCAACATAATTAAAGGGTACATACCAAGTACA GGTACTACACCTAAAACAGTGTATCAGTATGACCTATGGGATGATGATTTCTCATTTTATATTGTACACCCACCTTGTTTTGAAATGTTGTGAAACTTTA AGTTGTCTGCTTTCAACATTAATTTCATTATCTATAATTGTTTTCTTCTTTTTCCGAATCAAGATTATTGGCATACTGCATCCACTTAAATTTTCTTTGT TTTCTGTTATAAGTTGCTCTTAAGCATTTTCCTTTTTCATATGAGAGACCTGAATGCATTCTATCTTTTCTATATAATCATGGTTAAAATGTTTGATTAC TGTATCTTTTGTATTTGTGAGATCTTCCATCAGTTAACGTCTTCCGTATATGCTTGATATCCATTATCAAGTAAAAAAGCATATCTTGGTTTTAAGTTTT AATTGAAATTCCTTGCCAAAAACTAGCTTAGGAGCTTCCTATACAAGGTATGTTAATGTTGGTTTCCACAATATAATTGAATGTTCACAGAAACGAATAT CAGAGGAAGGTTTGACTAAACATTGAATGTTACATAATATTTCGTTGACTTCTTATTTTTGTCTGGCATTCACGAGTCCAGCAAGCTTTTGTTGTTTTCG ACTTTTGTTTACTTTTTATAACAGTTTCCAGCCATAGGATTGGATTGTCATAATTCACGAGGATTTGAATCTTCTGCTTACAAATCCTTTGGCTGTTTGT TCATATAATTTATTTACTTTTGTGTGAAGCTAATATTAAATTTTGTGTGGTTAACTTTTCTTCTTCATTTTCAAATACATTTTCCATTTCCAAATAGGCA TTATTTATCTTTTCCTTTTGACATTAAGGAAACTGAGGAGCTTAAAGGTGTGCTGGAAAAGGAAATTTTGAAGGTTAAGGAGCAATATCTGTCAAATCAG GGCATACTTCCTGCTACTAATGAACAATGCCGGGCAAGGATGGAAATCTCCCCTCATTGCATACAAATACCTTCTGATGGAGCTGATGTGTGGGAAATTG ATACCAATCACTTGATCTATGCAAACAGAGTTGGCTCTGGGTCATTTGGTGACTTGTACAGAGGTACATATTGCAGCCAAGATGTGGCTATCAAAGTTCT AAAGCCTGAGCGCATAAGTACAGATATGCTGAAAGAGTTTGCACAGGAAGTCTATATCATGAGGAAGATTCGACACAAGAATGTTGTTCAGTTCATCGGT GCATGTACCCGACCACCAAATCTTTGTATTGTTACTGAGTTTATGTCTAGAGGGAGCTTATACGACTATCTACACAAACAAAGGGGTGTATTTAAACTTC AATCTTTACTAAAAATAGCGATTGATGTTTCCAAGGGAATGAACTATTTGCACCAAAATAATATAATTCACAGGGACCTCAAGACTGCCAATCTTCTGAT GGATGAAAATGAAGTAAGAGGATTATATTAATGAAAAAAAAATTTCCTTGTGCATTTACAATGTTATTATATTGGTCTATGTTTTGCTGCTATCTTTATA ATATTTGGCTCTGTGATGACCTGTACTGTATGTGGAACTGTGGATCATATTGATCTTATTTTGCCAGCTGCATTCCTACACTCGATATACAATTATTTTT GCATGTTCCTGTTAAAGTATCAGCAATCTGTTACTTCTCTCTGCCATCGGTTCATTGCATTGTTGACTGCCATTTTCAATTCATATAGTTAATCATGGAA TCTCTACCAATAAATGTATAGTAATTCATTGTAAGCACTATAATGGTGTTTCAAATTCATGGTAGGTAGTATTTCAATTTTCATTATCCCTAGGTACAGT CACATCACACTCTTAATCTTTCATTCATGCTTCCAGTCCAAAAAGAAAAGTTATCATTTTACCCATTGTGGTGTTACATGTTCAATCTAACTACTTGTCT TGTGCCTATATTGTCCCATTCATATAGTTCTGTGCATGTTAGGTCCTATATTTGTTGATGAACCAGAAGCGTATTGTTTAAACAAGTTTAACATGGGTAG TTGTGTAATGCTGGACTCTATTGTTAGCATACTGTAAAATATGAACTTAAATACTCGGAAATGAGAGTAAAACAATGACTTATTTATCCTTGAGGAATTA AATCATCTCAAACATTGTCTTTCATATGCACTCAAATAGCATTTCCTTCTTCAACAGTTGGTCAAGGTGGCTGATTTTGGGGTTGCTAGAGTGCAAACTC AGTCTGGAGTGATGACAGCTGAAACTGGAACATACCGCTGGATGGCACCAGAGGTCATTGAACACAAACCATATGGCCAGAAGGCAGATGTTTTCAGTTT TGGAATATCTCTTTGGGAGCTTTTAACTGGAGAACTGCCTTACTCTCACTTGACCCCAATTACAAGCAGCTGTTGGCGTCGTTCAGAAGGTTTTCATTTT TTCCCTCTTTGCAGAAAACTTCATTGTAAACATTTTTCTTGTTTATGCGTCGAAATTTTGCCGAAATAATAGAAATTCTTTGGCAGATAACAAACGAGGT AATGTATTTTTTAATTTTTTTTAAAATAAGACAGTTTGAACTATTAAGCAATTTTTGCGTTGTGTTTCTAACAGGTCAATGATGGAAAAACAGATGGACA AAAAGATAAGGCATCTCATTCCTTTCTCTCATCATTTAAACGCTCTCACCACTGAGTATTGGAGTTCCTATTTAAGGATCATATAACACAGTATAGCCTT TTTGTCCTGTATAGTCTAACCAAAGATCAAATGAGTTGGTTGCTTCTGCTCATGAAAGATCGGTTATATTATGCTATTCTATTGCCTTTAATTTATCTTA CAGTCTACACCTCTCCCTTTTGTACGTTCCACGATTCTTACTTTCATGTGAATAGATTGGATGCAAGAGTGGTAAAAATCCAAAGTTCAAGGCATCATGT AATGTCAAAGTTTTTCTTTGTTTTTCATGTTTTTTGAATTGAGACCTTTTAACATGTGATCCCCTGCAATCCAAACCCTCAAGGTGACTAGCAGAAACAA TGTAGTTAATGATGTAAAAAACATTACAATCTACCAGGCTTATTTGTAATAAGATTGGTATGTGCTATTATCCTCTTCGATTCAATTCCAAAAGCATTGA AGCACAAGATTTTCACGTCTTTCTC BLAST
Tissuepods
Gene nameLI_gene_191624; 
Additional informationdetails; 

Expression of Ll_transcript_487196

Labels

PAB abscising pods
PNAB non-abscising pods
PS1 seeds stages 1-3
PS2 seeds stages 4-6
PS3 seeds stages 7-8
PW1 pods wall stages 1-3
PW2 pods wall stages 4-6
PW3 pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_487196
BlastpSerine/threonine-protein kinase STY17 from Arabidopsis with 62.26% of identity
BlastxSerine/threonine-protein kinase STY17 from Arabidopsis with 67.51% of identity
EggnogSerine Threonine protein kinase(COG0515)
KeggLink to kegg annotations (AT4G35780)
CantataDB-
Mirbase-
Ncbi proteinLink to NCBI protein (XP_019421298.1)
PfamACT domain (PF01842.24)
Rfam-
GOLinks to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;