Id Trinity | TRINITY_DN52319_c0_g1_i1 |
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Name Transcript | Ll_transcript_486315 |
Sequence | AAAAAAGGTTATAACTTGAAGTCTTACTGATAGTAAAAATACTAATACCATAATATTTGCTAATAGAAAAATAATAAATCTCTTCCAAGATACTTGTTGA GAGGATACTTACATCGCTTCAAACAAAATAACTCTTCCAAGAATGTCCCTAAATACATGCAGCAAAGCCTTATATAAATCCTAAGAGTTGTAGTGCTTAA ATGCCGCAAAATACAAAGAAAGACAAACAAAAGCTCCTCCTTTTTAGTTCCTTTCCCCATTACCTTAAACCAACTCTCTCTTTCTCTCTTATCACATTAG AGAAAGAAAGAGAGAGATTGAGAAAATGGGTATGTACAATTTCTTCTCTAGTTTCGTTCTCTTCTTTGTTATTCATCTTCTCTTCCTTGTTGTGATAGAA GTGAAGGGAAAGGGTTTGGGTATTGGTGAATGTGATTTGTTCAAAGGTACATGGGTTAAGGATGAAGAACTGTACCCACTTTATCAGCCAGACACGTGTC CATTCATAGAGAGAGAGTTCAGGTGCCAAGGGAATGGACGGCCAGATCTCATGTACACTCACTATAGATGGCAGCCACTTGCCTGCAACTTACTCAGATT TAATGGGGTAGATTTTCTGGAAAAGATGAGAGGAAAAAGCATTATGTTCGTTGGAGATTCACTTAGCCGTAATCAATGGCAATCTCTGACTTGTATGCTT CACTCTTCACTACCCAATTCCACTTACACTGTGGACAGAGTCACAGATGTTTCTATATTCACCTTTACGGTATCAATCTATTCCTCTAAATATTTCACAC AGAAAATAATGTACCATTTATAATTCATTATAACATTCATTATTAATATGTGATTATTATTGATTCATAATATAAATGAGTGATAAATGATATGTTGGTT ATGTATGAATAATGGTATATAAACATTGTAGACTAAATATTTATTATAGATGTTATCCTATCATGATCTATATATATTGTCCCATATTTTACTACAAGTG AAAAAATGTTATAACATTTTGTGACAACTCATGTGAGAAAGTTAATTTATGATTGTTTAAATAAACAACTTTTTTGGGTGATGTTGATCATAATTATGTT ATCTGACATATGATTAGTAAAGTGGAGGAAAAAGAATCTTATCTTTAAATGATAGTGGTGTTGAGTTTGCAGAGGTATTGTACAATGTGAAGTAAATTGC AATAGTTAAGTGATAAGTGGTCCCTTTACTTGTCCATGTTTATAACTCACAAGTAACCTCACCAAATAGCTACGATACAAAATAATATATAAAGATAGTT ATATCCTCTTATTTATTAATCACATTTTTGTTATTGAGAATATAAATAAAAACAAACAATCTCTATGTGTAATATTATATCTTTCTACAAAATGTTTTAC TCATAAAAAATGATAAATGTTAATTATAAATTAATCATTAATAAATAAAATATTATACTATAATATATCACTTTTTATGGTACGAGCATTCAAGGAAGAA TTTATATTTTGGTATGTTAATTGGCTTCCATTTTCACACTTTGGTCCCCATCAACTTACAAGCCCCACTCCTTTGCTATATCTTATCTAGGATTGAAGTT GCTTTCAGAATTTAAAGGCCAGAATCTTCTGAAATAATCATCCTTAGCTTTTTTCTTATCTTTAACACTCATACCAAAAACTTATTATCTACTCATCTTG TGATTGCAATCAAGCACGTAATTTATAACCTATTCTACTACCTTATTTAATAAAAATTAAGTTATATTAATAAATGAATTTATTTTAATAAACTACAAGC ATCTCATATTTAAAAAACTATTCAAAGTAGTTTATGACTAAAAGATAGGGTATTTTATTATTTTCTACATATTATAAGACTTTTCAGTTAACGCTTATCA ATTTATATCTTTTAGCTCCTAACTAATTAATTTTTTTTAGCTAACTTGAGGTTTTCACTTAACTTATTAGTTTATATATCCCTTCAGCTAACTAGTTTGA AGTTTTTGTCCTTATCATGCAATCGTGCAAAATACATTCTGTATTATTATATGGCTTTATTTGTAATATTGTATTAGAACAAAAGTCTATAAGCTAGATT CTATTATCGGAATTTTTGTTTTCTATAATAATAACTTTAATGTTACAATTTAAATTATATTATGTTCTTGTTCTATTTTTTTTTTGCAGGAGTATAATGT GAAAATAATGCTAAATAGAAACGTGTATCTAGTAGATGTTGTTAGAGAAGATATTGGAAGGGTCTTAAAGCTTGATTCTATAGAAGGAAGTAAACTATGG AGAGGAATTGATATGCTTATATTTAACACATGGCATTGGTGGTCACGTAGAGGACCTACTCAACCGTAAATTCATTAACTATTTCTTTAACAACTATTAA TTATTTATTCACGGTTTTATATTTTTTGTTATTATATGTGTTTATGGTCAATGGGTTTTTTTTTCAGATGGGATTATATACAAGAAGGAAGTGAAGTTAT GAAAGACATGGATAGAATGGAGGCTTTTGAAAAAGCACTTAAGACATGGGGTGCATGGGTAGATGCTAATATTGACCCTGAAAAAGTGAAGGTTTTCTTT CAAGGGATTTCCCCATCTCATTACAAGTAAGTAGCCAAAAAAATAACATTCATTTTTGGAAAATTATTGCTTGCACACTATCTCTTTATTCTTTTTAGTT ACTCCTATTACACTAAGAAAAAGTAATTTGGTGAGTGTGTTTGTCTTATTATTAAATCTCAAAAAAATAAAAATAAAAATAGAACATTGTGTTAGAAAAC TATATGAAAATAGCATCACCTTTATATTCCTATTATTCAAAACTCATATTGAAAAGAAGTTTAGCAACTTATCTTATCCAAAATATATATAGAGAGAGAG AGTGTGAGCAATCTTATTACAACTAGATGAAGTAAAAATAAAAAGTATGCTCTTTTTAGTTGATTTCATATCATTGAAATTTGACCAATTTTAGAAGTTT GCATTAGTGTTGAATAAAAAAATTCACCAATTTAATTGTAGTATGTATAAAAATATAAGCATTAATCATGCTAAGTTGTTGGACTATGGGATCCAAACAT GTACATGATTTATTATTATGGTAACTAGTATATGATTCTCATATATAAATAAATGATTAGTTGCAAAACAAAATTTAATAATGTGTTTATTTGAAAACAT TGGTTTCAGTGGCAGCCTATGGAATGAACCAAGTGCAAAGAGTTGTGTCCGGGAAATAACTCCGGTGGCCGGATCGACATATCCGGGTGGTTTGCCGCCA CCGGTAACGGTGTTGAAGAGTGTATTAAGAACAATTAAGAAACCAGTAACACTACTTGACATCACAACTCTCTCATTGCTTAGAAAAGATGGACATCCTT CAATTTATGGACTTGGTGGACCAACAGGAATGGATTGTAGCCATTGGTGTCTTCCTGGTGTTCCAGATACATGGAATGAAATACTTTACAACCTTATTTA ATAGAACAATGAAATTGATTCATGATTGAATTTTATTAGGGTTATTCAGTGAATTCTTATAGGAAAATTTGTATACATTATAATGGTGGCTGTATCTTAT TTTGATAACTAGCACCTTGATTGTTATATGTGTTGTGCTCTACAGTGAATAATAGTAAAATTATTCAGCATACATTATGTGTAATATAATGTCAAACTAT AAGG BLAST |
Tissue | pods |
Gene name | LI_gene_191731; |
Additional information | details; |
PAB | abscising pods |
PNAB | non-abscising pods |
PS1 | seeds stages 1-3 |
PS2 | seeds stages 4-6 |
PS3 | seeds stages 7-8 |
PW1 | pods wall stages 1-3 |
PW2 | pods wall stages 4-6 |
PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_486315
Blastp | Protein trichome birefringence-like 41 from Arabidopsis with 67.68% of identity |
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Blastx | Protein trichome birefringence-like 41 from Arabidopsis with 66.07% of identity |
Eggnog | Pfam:DUF231(ENOG41118PY) |
Kegg | Link to kegg annotations (AT3G14850) |
CantataDB | - |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019443850.1) |
Pfam | GDSL/SGNH-like Acyl-Esterase family found in Pmr5 and Cas1p (PF13839.5) |
Rfam | - |
GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |