Id Trinity | TRINITY_DN52366_c1_g1_i6 |
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Name Transcript | Ll_transcript_487331 |
Sequence | CTTTCTTCATTTTATGATCAAAACAAAAACAACAACAATGGATAGTAGTGGAGTAGCAGCAACAGGAGGAGGAGGAGGCGGCGGAGGCGGCGGCGGCGGA GGCTTTCATGGCTACCGCAAGCTCCCCAACAACACTACCATTTCTGGGTTGAAGCTATCAGTGGGAGGTGGTGAGAACATTAACAACCAATCAGCAGCAG CAGCAGCAACAGAAGATAATGAATGCATGGTGAGGGAGCAAGATCGTTTCATGCCAATTGCAAATGTGATAAGGATAATGAGGAAGATACTGCCACCACA TGCAAAAATATCAGACGATGCAAAAGAAACAATACAAGAGTGTGTGTCTGAGTATATAAGCTTCATAACTGGTGAAGCCAATGAGCGTTGCCAAAGGGAA CAACGCAAAACTATCACCGCAGAAGATGTGCTTTGGGCTATGAGCAAGCTTGGCTTTGATGACTACATTGAACCTCTCACAATCTACCTTCACAGGTAAA AACACTTCACACAATAGTTAATTCTCTATACTGCTTGCTTAATTCATCTAATACCGTAAACAGTAATATATTAGAATTTTAAACTAATGAACATAGACTT AACCATTGAATTTTAATATAATGTGATTAATTTTATATATTTATTAATTCATATAATACTTTGAATAAGAGTGTATTTGAATTTCAAACTAGTAAGAAAA ATAAGCTTAAGTATATCTTTCTGTTTTCGAATTTATTAGATTTTGGTTTTAGATCTTATATTTTTTCTAAATTTTTTGTTTTAGTCTTGAGTGATGATGC GATCACATGTGATAATAACTAATGACATAGACCAATTGTTGTGTTTATACATGTTTAATTAGCCGTACTTAAATGAAAATGAAAAACTAAAATAGAGGTG AAAATGGAAATAATTGAGTCTGAAAAAGAAGTTGATAGAAATAAATTAAAATGGTGATTAGTTGATGTATTATATTGATTAGAAAAAGTAAGGTAGAATT GAAGAAAGGGTAAGTTTTGAGTAATGAAAACAGGTACCGTGAGTTGGAGGGTGACAGAAGCTCAATGAGGGGTGAAGCACTCGGGAAGAGGAGTAGTTCT AGTGGTAGTGGTAGTGTGGAATATGGGACACTTGGTGTTGCTACTGCTTTTGTGCCACAGTTTCATCATCATCACCATCATCATCACTCAAATGGGTATT ATGATCATGCTGCTGCTGCTGTTATGGGGAATTACATGAGGGATGCTGCATCAAACAATCATAGTAATAATACCAACAATGCTGCATCTAAGGCTGCAAC CATCACGAATGCTGATCAACCAATATGAATCACTATTTAATTACTACTCATCAAATCATACTCTTAACTCTCTAATCGCAATAACATTCCTTAATGTGGA CCCTATCATCTTATGTGCCCATTCATTAAGCACTTTTAATTTTAATGCTCCTGTCTTTTTACTTAATATATACTTAATTATTTGGCTCAACCACGTTAGA GAAGCAGTAAAAACAACTCATAGTCTAATACTAATACTAATATATATCGTTAATGAATGAAAGTTAGAGAAGCAAATAGTTATACTTATTCGCTTAAAAA CAAGTAACTTATTTCTAAATTTGTCTATGCATCCTTATATATTTAATTATTTGTATGACATGGACATGGCATTATCAACTATATATCTCTTTAATTAATA CACCATTACTTCCACACTCATTTTTTTGGGATGTGTGACAATTATTTCCTTATTACATGGAGCTTACAACACCGGATTTATTTAAACTCAATCACTCACT CACTTAAGAATGACACTCTTATTTTCTTTATTTCAATCCCCGCCCTCTGCTTATTCATAACGTTTTAAACTAATTCCCAATAATAATCACTAAAATCTAT TATAAACTAATACAATAGATTATGTGTACTTTAAAGTCATAAATTTTTTAAATATATATTAAAAATACAATTGGGAATATGTAAGGATTTGGGGGAAGAC TATGTATATGTATCATAGAGATTCGTTAATCATATTCTATCAAGTAATATTTTTTCACTTAAACATCACCTTTTAGTTAAATTGATACACACATATAATA ATAAAAGCGTGAGAGATTACCTCCGTTGATGCCCTTATATACTATAAATTGTTGAGTTATTTTTGTAATAATACATATATATTTTTACATACAATTTTGT AGTTATTATTAATATGTAAGTTAAGATATAAAATGATATATTATTAATGGCATATAGGTGGAGCTGAGTCATGTTTATAAGGTGATAAAATGGAAGCATA GCATATTTGGGTATTGGGAATAATATTGTTGGATAAGGATCGCAATCATAATAATAGTTATACTATTCATATTTCCAACATCAACACCAACACCAACGTT GTTCGGTTGATTCCATGTCTTCTTCTTCTTCTTCCACTTCTGCTTCTATTAAACCCCCACTTCCAGATGTCTGTATTGTTGGTGTTGCACGCACTCCAAT TGGTGCTTTGCTTGGCACTCTATCATCTCTTTCAGCTACACAATTAGGCTCAATTGCTATAACATCTGCTCTTAAGAGAGCCAATGTTGATCCTTCAGCT GTGGAAGAGTTGTTTTTTGGGAATGTTCTCAGTGCAAATTTAGGACAAGCTCCTGCCAGACAAGCTGCATTAGGAGCTGGTATACCCACTTCTGTAATCT GCACTACTGTCAACAAGGTCTGTGCAGCTGGGATGAAAGCTACCATGCTTGCAGCACAGACCATACAACTCGGTATCAATCATATTGTTGTCGCCGGTGG TATGGAGAGCATGTCAAATGCACCCAAGTACATTGCACAAGCAAGGAAGGGATCTCGGTTAGGACATGATACTCTCATTGATGGTATGCTCAAAGATGGC CTTTGGGATGTCTATAATGACTTTGGCATGGGTATTTGTGCAGAACTATGTGCAGATCAACATGCCATAACAAGATCTGAGCAGGACTCTTATGCCATTC AAAGCTTTGAAAGAGGAATATCAGCACAAAATGCTGGTCATTTTTCTTGGGAGATAGTTCCGGTTGAAATTTCCAATGGAAAAGGGAAGCCTCACACACT TGTTGATAGAGATGAAGGTCTGGGGAAGTTTGATGCTGCAAAGTTAAGGAAGCTTAGACCAAACTTTAAGGAGGATGGGGGTACTGTGACTGCCGGCAAT GCTTCTAGCATAAGTGATGGTGCTGCTGCATTAGTACTAGTGAGTGAACAGAAGGCACGCGAGCTTGGATTGCGAGTAATAGCAAAGATAAAAGGATATG CGGATGCGGCTCAGGCACCTGAATTATTTCCAACTGCTCCTACCCTTGCAATTCCAAAAGCTATATCGAATGCTGGTTTAGAAGCTTCTCAAATTGATTA CTACGAAATAAATGAAGCATTTTCTGTTGTGGCTCTTGCAAATCAGAAGCTTCTTGGTCTTAATCCGGAAAAGGTTAATGTGCATGGTGGAGCTGTATCA TTGGGTCATCCACTGGGTTGCAGCGGAGCTCGTATCTTGGTTACATTATTAGGGGTAACTTGTGACCTTGGTTACTCTAGTTTTTTTCCCTCTTCCACTG ATGTATATAAATTATTCTGTTTTATTCTCCGGATTTTTGGTGATCTTGGTTGTGTTGTGTTTCAGGTATTGAGAGAGAAGAATGGAAGGTATGGTGTTGC TGCAATTTGCAATGGGAGAGGAGGGGCATCTGCTATTGTCTGTGAGCTCATGTAAGCCCTCTTCTATCACTTTTGTTTAGAACTCATTCAAAATAAAGAG AAGAATATGTTTCATTTTTATCAGAAGCTTCTTTCATCACTTTCTAATAAGGTTGTTGCATTTTGTAGGCCATTTGCAAGTTTGAGACGTACTTCATTAT GATTTGGTGTCCTCACAGCTTACTGCATTCCAATTATATATACATCATTTTCTGAAAGTATAAAACATGTAATAAATTTGATTCAGGAAATAAGTCACAT TACTTCATAACATATGAAATATAAGAAATATATGAATTATATTTTGAAGGCTATCAAGATGGGTAGCGAGAGAGTGAGGTTGGAATAGGACCTATGTAAT TTGAGGCATATGTTTCACTTTGGTCAAGTGCATGCCAATGTATTTGGTCTCTATTTTATGGTTCTAGAAATCTGAAGTATTATTAGCTTCAAAACATGTT CTTAAGCCTACAAGTTTTATGCATACTTGTCCAACAACTTCAGAAGTATGTACTTGACAAATTCTAGTATTTGGAATCGATCTATACATTCACATATCAC TTGGAGTTTACTCCTAACTTGCACAGTAGAGAAAGTTCAATCATCTTATAATGTTCTACTTGCACTTTTTAGGTAAATTTTCTAC BLAST |
Tissue | pods |
Gene name | LI_gene_192139; |
Additional information | details; |
PAB | abscising pods |
PNAB | non-abscising pods |
PS1 | seeds stages 1-3 |
PS2 | seeds stages 4-6 |
PS3 | seeds stages 7-8 |
PW1 | pods wall stages 1-3 |
PW2 | pods wall stages 4-6 |
PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_487331
Blastp | Probable acetyl-CoA acetyltransferase, cytosolic 2 from Arabidopsis with 73.43% of identity |
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Blastx | Probable acetyl-CoA acetyltransferase, cytosolic 2 from Arabidopsis with 73.43% of identity |
Eggnog | acetyl-coa acetyltransferase(COG0183) |
Kegg | Link to kegg annotations (AT5G47720) |
CantataDB | - |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019434944.1) |
Pfam | Thiolase, N-terminal domain (PF00108.22) |
Rfam | - |
GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |