Ll_transcript_487744

Id TrinityTRINITY_DN52371_c0_g1_i15
Name TranscriptLl_transcript_487744
SequenceCTCTAATTCGTTACTCTCTCTCTATCGTTCAATATTTTGATTTCGCCTTCCAAATTCGAAACCGAATGCACAGTTTATATGCTGTGGTGTCTAAATCCAA CTTCGATCGCATTCACTTTTTTTTATAGATTTATTAGCTATTTCGTACTCTTTCAAATTTCATTGCTATGTGGTTAGGATTAGCAAAATTAATTTCGTTT CCATTCGTATCAGGACGTTTGAATCGTGCAATTAGAAATTAGCTGAGGCGAGGTTTGCTCTGAGACAGTTTACATCAATTGATGTTAAATTTAGATACGG TTGTAAATAAAATTAGCTTAAATTGGAATCTTAAGATCTGTTCTGAAAGTTTTCGTATTAGGTTTTGAAAAAAGTGATTTTCCGTAGATATTTTTTGGCA GAAACTTGTTTGTGAGTGAGAAGCTGAATTTCTGAGTTCTTTCATATAATTTATTAAAAAACTTATGAATGTTTCCCACAGGTTAGTTTAATTTTCTAAT TACTAATTAATATTTTTATTTTACAGTTTCTGTTCTATGGCATATAAGCTTCTGTCCTTATAGAAAGTTAGTCCTCAGACACACAAGTGTTGGTATCATG AAACTTGAAATTATTTGCTATTGTCATGCTACCAATTAAATTGTTCTTTCTTGGCAAGATTTCACATCAACAAATATTGGTAATGTGAAAGTAGATGGAG TGTATGAGTGTATCTTATATGATAAAATTTTGGCTTGTGATGAACTCATATGTTAAAATATGACCGGTTTTCCTTTGCCATACTTCTGTGCATGCTTGAA GCATCCATGTATTGCATCTATGAGATTCTTCAGCACTTTTGAATGTTGAATTGCTTTGGTACATTCGTTGAGATTCACAATTCAGTTGGAGTCGGGTCTA ATTAGATTAAGATATTATGCACAACCCATCTTAAGTTGTATCCTGATTCCTGAATATGTTGATGGTATTTATACATGTTAAGAGTGGAATGATATTTAGT GTGCTGATGCTCGGTTTATTTTTGAGAATTGGAGAAAATGAAAATCTATTTTGATGTTGGGTTCAATCTATTTATCTTGTCATCTTTTGTTTGGTGATGT CATTCCCTGATTCTATATATCATGATCACAAATTTTATGTACAAACCTGAGATTTTCTCTTCTTTTTGCTTGCAGAAATATGTCTGTTTGAGTTTTTCAA CATTGTTCTCTTTGAGCATTGCAATGAAGGTGTAGAGGATATCTATAGGTAATCAGGCGCTCCAAATTCAACAATGAAGCGATATGTTTACATCAACGAT GATGAATCATTACATGATTTACACTGTGATAACCGTATTTCAAACAGAAAATATACTGTATTGAACTTTCTTCCAAAAAATTTATGGGAACAGTTCAGCC GGTTCATGAACCAGTACTTTTTGCTGATAGCCTGCCTGCAGCTATGGCCTCTCATTACTCCAGTAAATCCTGCCAGTACTTGGGGTCCACTTATCTTTAT TTTTGCAGTCTCTGCATCAAAAGAGGCGTGGGATGATTACAATAGATATCTTTCAGACAAGAAGGCAAATGAGAAACAAGTCTGGGTTGTGAGGAAGGGC GTCAAACAACATGTCCAAGCCCAAGATATTCATGTGGGTAATATAGTATGGCTTCGGGAAAATGACGAAGTGCCTTGTGACCTTGTTTTGATTGGTACCT CTGATCCGCAGGGAGTTTGCTATATAGAGACTTCTGCAATGGATGGTGAAACTGATTTGAAGACACGGGTCATACCTTCTGCTTGCATGGGAATCGTTGT TGAACTATTGCACAAAATTAAGGGTGTAATTGAGTGTCCCAGTCCAGACAAAGACATCAGAAGATTTGATGCAAACATGCGGTTGTTCCCCCCTTTTATT GATAATGATATATGCCCTTTAACCATTAAAAACACAATTCTTCAGTCTTGTTACTTACGGAACACTGAATGGGCATGTGGAGTGGCTGTGTATACAGGCA ATGAAACCAAACTTGGCATGAGTAGAGGTATCCCAGAGCCAAAGCTCACTGCTATGGATGCTATGATTGATAAGTTGACGGGTGCTATATTTGTATTCCA AATTGTTGTTGTTATGGTTCTTGGCGTAGCAGGCAATGTTTGGAAGGATACAGAAGCGAAGAAACAATGGTATGTTCTTTACCCTGATGAAGGCCCTTGG TATGAACTATTGGTCATTCCTTTGCGGTTCGAGCTTCTTTGTTCCATCATGATACCCATTTCAATTAAGGTATCTCTGGATTTAGTGAAGAGCTTATATG CAAACTTTATTGATTGGGACCATCAGATGATAGACCTAGAGACTAGTATTCCATCTCATGCAACAAATACAGCGATAAGCGAGGACCTTGGGCAAGTTGA GTATATCTTGACTGACAAAACAGGCACCCTGACTGAGAATAAAATGATATTTAGAAGATGCTGTATTAATGGCATTTTCTATGGGAATGAGAATGGAGAT GCATTGAAAGATGTAGAGCTCCTCAATGCTGTTTCCAGTGGTTTGCCGGACGTTGTACGATTTCTTACAGTTATGGCAATATGTAATACTGTCATACCTA CACGAAGCACAACTGGAGATATCTTGTATAAGGCACAGTCTCAGGATGAGGATGCTCTTGTTCATGCTGCTGCTTGGCTGCATATGGTTTTCTTCAATAA GAATGGAAACATTCTTGAAGTCAAGTTCAACTCCAAGATACTTCAGTATGAAGTTTTGGAAATCTTAGAGTTCACATCTGATAGGAAAAGAATGTCAGTG GTGTTGAAAGATTGCCAAAATGGGAAGATCCTTCTCCTGTCGAAAGGAGCAGATGAGGCTATTCTTCCATATGCTCGTGCCGGGAAGCAAACCCGAAACA TCATTGAAGCTGTGGAGCAGTATGCTCACTTGGGACTACGTACACTGTGTCTGGCTTGGCGTGAGTTGAACGAGGATGAATATCAAGAATGGTCTTTGAT GTTTAAAGAGGCTAGTAGCACGTTGGTTGATAGAGAGTGGAGAGTAGCTGAGGTCTGTCAAAAAGTAGAGCATAACTTGGAAGTTCTTGGTGTAACAGCA ATAGAGGATCGTTTACAGGATGGTGTCCCTGAAACTATAGAAACACTACGAAAAGCTGGAATAAATTTTTGGATGCTAACAGGGGACAAGCAGAATACCG CAATACAAATTGCCCTGTCATGTAATTTTATTTCTCCAGAACCGAAGGGGCAGCTTCTATTAATTGATGGAAAAGCAGAGGACGAGGTCCGTAGAAGTCT AGAGAGAGTGCTCCTTACAATGCGGATAACTGCGTCAGAACCTAAGAATGTGGCTTTTGTTATCGATGGTTGGGCTCTTGAGATTGCACTTAACCACTAC CGTAAAGCTTTTACCGAGCTGGCAATATTGTCAAGGACTGCTATATGTTGTCGAGTGACACCATCACAAAAAGCACAGCTTGTACAGATCCTAAAATCAT GTGACTATAGAACATTGGCAATTGGTGATGGTGGGAACGATGTAAGGATGATACAGCAGGCTGATATCGGTGTGGGCATTAGTGGCAGAGAAGGATTGCA GGCAGCAAGAGCAGCTGATTACAGTATAGGAAAGTTTCGATTTCTGAAAAGATTAATTCTAGTCCATGGCCGGTACTCCTACAACCGTACAGCATTTCTT TCTCAGTATTCATTCTACAAGTCCCTATTGATATGTTTCATCCAAATCTTTTTTTCATTTGTTTCAGGTGTCTCTGGAACCAGCCTCTTCAATTCTGTTA GTTTGATGGCTTATAATGTTTTCTACACCAGTATTCCGGTTCTAGTCAGTGTGCTTGACAAAGATCTTAGTGAGGAAACTGTGATGCAGCATCCTCAAAT TTTATTTTATTGTCAAGCCGGGAGGCTTCTAAATCCTAGTACGTTTGCTGGATGGTTTGGGCGATCTCTCTTCCATGCAATAGTTGTATTTGTAATAAGT ATACATGCTTATGCCTATGATAAAAGTGAAATGGAAGAGATATCGATGGTTGCCCTCTCCGGCTGTATATGGTTGCAGGCTTTTGTAGTAACAATGGAAA CCAAGTAAGCTTTAATATCAGAAGCTGTTGATGCAGTTGCTTATCATAATTTAACTTTGCATTTAAAACTGAATTCAAAGAGCTAGCTAATGTGCATAGT TTCTTGTAGATATATAAAACCGTTCATGTGCCTTCACCCATCCATGTGTTTACTTTATGTTTCTTTGGTTTGTATGGCTATTGGGAGAAGAATCATTGTG GTTTAAAAGAAACTTTCTTCTGCTTCCTGGAAAAGTTTCTCTTGATTTAATTGTCCGACTTATGTTATTTATGTTTGACTCGTGCAGTTCCTTTACCATA TTGCAACTTGTTGCTATCTGGGGTAATTTGGTTTTCTTCTATGTCATCAACTGGATTTTCAGTGCTCTTCCTTCATCCGGGATGTATACAATTATGTTTC GGTTGTGTCGACAACCATCATATTGGATAGCAGTTTTTGTAAGTGCCTTTGTATCTTTTGCATCTGATTGACAGTTTTTTATTTTTTTTCTTTATGAAGA CAAGCTCCTCTTATAGGATGTCTATCCTTTCCTCTGTTAGCTCAGAAGGTTTTGAAATATCATCCCATTTACATTGCCTATCATTTTCCTGATACTCAAA TATCTGTTTTTTCGGTTAACATGAAATAAGTTAACATAGATCACATGGCCCTAGAGAGGAGCCAAACTGTCTTATTTTTCACATTTTCTTCTTGCCAAAG ATTGTTATTGTATTGATTTTGGTTATGCTTTGATGGGGACTGTGATTCCGTACAGCTCATGGTTGCAGCCGGGATGGGTCCAGTTCTAGCCATCAAGTAC TTCCGATATACATATAGACCGAGCAAAATCAATACACTTCAGCAGGCTGAACGCCTGGGTGGGCCAATCTTGTCTTTTGGCACCATCGAGCCTCAACCTA GATCTATAGAGAAAGAAGTTTCTACCTTGTCAATAATTCAACCCAAAGACAGAGACCCTGTCTGCGAACCTCTTCTATCGGATTCTCCGAATTCCACAAG ATCTTTTGGAGCAGGAACAGCATTTGATTTCTTTCAGTCACAGTCAAGATTATCGCTATCTAGGCACACACGAAAAGACAACTGAAATCAACAAAAAGTT GGGAGTTGTGGAAGCCACATCATTGTAGTATATACCTTCTGGATATCTAACAAAATATGTAGTTAGTTGTTAGAAGAAATATTTATTGTCCCAGTGAATG TATATTTTTGTTACAATTTCTTTTTCTTACCAGATATATTTTATTTCAACCACTATGTTGGGGACTTTACCATATTACTTTAGTTTATTAACAGAGCTCC TCTAAAGTGTTATATATGTGTCTATACAAGTTTCTCTCTATAAATATAACTGTTGAAATGAAGTTTTACGAAAATGATTTCTCAC BLAST
Tissuepods
Gene nameLI_gene_192178; 
Additional informationdetails; 

Expression of Ll_transcript_487744

Labels

PAB abscising pods
PNAB non-abscising pods
PS1 seeds stages 1-3
PS2 seeds stages 4-6
PS3 seeds stages 7-8
PW1 pods wall stages 1-3
PW2 pods wall stages 4-6
PW3 pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_487744
BlastpPhospholipid-transporting ATPase 2 from Arabidopsis with 86.85% of identity
BlastxPhospholipid-transporting ATPase 2 from Arabidopsis with 86.85% of identity
EggnogPhospholipid-transporting atpase(ENOG410XPYK)
KeggLink to kegg annotations (AT5G44240)
CantataDB-
Mirbase-
Ncbi proteinLink to NCBI protein (XP_019432177.1)
PfamPhospholipid-translocating ATPase N-terminal (PF16209.4)
Rfam-
GOLinks to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;