Ll_transcript_485942

• Id Trinity: TRINITY_DN52385_c6_g5_i1
• Name Transcript: Ll_transcript_485942
• Sequence: TCAAGTTATTCTAAGAATAACTTTACTCTTCATCTTAGCCATCAATTTCTTGGAAATCCAATAGTTTAAATCTATTCAGTAATTCAAATCATTGAATGTA TCTAAAATTAAATTGATGATTGAGATGATGTGTAAATCTAAAATAATTACTCTTGGAGTAACTTGATCTCTCCCCTCATTCTTAATCGAAAAGGAAAGTG AAGAGAATAGATGTTGTATGAAAAAAAGTTAAATATTATCTGACTCTTATATATGCTAAAAAGATATATATTATTCTTATGTTTAGCTCATCTAGAGGTT TAATATATTATAAAATAATAAGTGAACCTAAATATAAATGTACAATTACTTTTATTCTTTCTTGATCACTAATTCTTGGTAAATTTAAATTTTGTCTCCA TGATTGGTTTAGAAACATTGATGATGTTCTCAAAAAAGTGTTGGGATTTGTTTTATAGTAAAGTAATGATATTTTTTATAAAATCATCTTGCTGGTCAGT AGTAGTAAATTAATTTTTGATAACGAAAATATCACCTTTTTGACTTATTTTTTGTGATGTGGAAGAATGTAGTAAATATCAATTTTTTTGTCCTCAAAGC AATTTCATTTTTTATATTTTAAACCAGAAAAAAAAATATACCGACAATTGAAAAAAAAAATATACCCACAATTTAAGAATGTTATACAATATCAGTCTAT AATACATACTTATTTTTAATCATTATTGACTATTACAAATGAATAATACTTTGAATGTATATAAATTTTATACTAATAGTACCTAGATATTAGGGTCTTT AAACAATACTTATTATACTAATATAATCCTATACTGTTAATGCTTAGATTCAATTATTCAAACCCCAATAGTTATTCATTTCCTAAAAAAACTGAAAAGA AATTACGTCTATAATCTATATATAAATTATAACACAGTACAGGTTTCAGATAGCCAGATGATAACTAAATTCACAAGATTCACTTTATTTCCTTCTCTTC TACTACATAATGGCTTTATTACAATATCAAAATATTTGTCAATGATATAATTAGTGGAGTCTTAACATGTGAAATTATATTTGTTTGGATGATTAATCAG GAAAACTGGTAGAGAATGAGTTTGAAAATTAAATATAACATAAAGGATTTTGATTGAAGAAAAGAAAAATGCTTTAGACTTGGTACTTATTTTCATGACA TACAGATATCATGTTCTCAACAGTTAATTATACATTCTCCACTTCACACCTCCGTCATATAGGCTATATATTTCAGGTTCCCTTCTTGTTTGGGTAATCC GAAACCCAACAGATTCGGGATGATATTGTTAATTTTAATTCCTCTAAGTTCGGGTTTGGGTTTTAAATGCCAATAAGCCAATATGTATGATGAATTAGAT AACCATCTTTATTATGAAAAGGTAGCAAACTGTTTGTTGTAATGAAAGCAATTGTTATGCAGTGGGAACAATAAATTAAGTAAAAGTGAGGATAAATGAT AGATAAAAATACAATAGATTTAATAACAATGTTCGACTAATTATGTCTTCCTATAATATCGATATTTGTAAGTGGTGAGCATGATACATGATTGTGGGTC CATAATCGACATGGAAATGTATCGTTTCCCATGGTCGGATGTATCACTCACATGGTCGTGAGTTAGTCCATGCCGGAGGTACACGGTCATGGTTGCCACC ATATCGTAGTGTTGTCCTATCTATAACTCTACATCTTCTAGTGTTTCGAGAACACAGTATCCCCACACGGCCTGGCGATGTGGCATTTCCTTGATCATGA GCCATTTGTCAATCAGGATGCGGCACACAACAATCTCCACCTTGAAGAATATCAACTCCTATTCTTCGCGGACACTTCCTCCTCTGAATATTCTTGATAA TACTCAACATAAGTCCATCTGTATATAAAATGTCCCTTATTTAAAATGACCCATCTTTGTGATTAGCACATTATAGTTAGAAGAATACATGTCATAATGA ATCAGCTATCTTCTTATTTGTTTATATTTCAACTTGTCTTTGGTGGTGAAAGGGAAATAGCATCAGGAACAATACCAGATCCAGGGTCCTTGAAGGCTAG TGACATAACAATGTTGGATGTGCCAGTGAAAGTGGCTCACAGCATATTGCTGAGTTTGGCAAGGGACATTGGAACAGATTGGGACATAGATTATCAATTG GATATTTATCTTATTATTGATCTTCCTGTTATTGGCAACTTCACCATTCCTCTTTCACAGAAGGGAGAGTTCAAGCTACCAACTTTTTCTGACATATTTG CTTAGCATCACCAATCACCACAAGTATTGGATCAAGAAAATAAATGCAGCCTACACTATTTCTTTATGTCAATTTCTATTCAGTATTTCTTTTCTTCTCT GGTTGTAATGATGTTGTAATGGTGTTGTTCTATACTGATGCTATAACCATTAATCATACATGGCTATAATATCTCAAATAATTGTTGTCAAAGGATGTGT TTTTTGGGAAGCTTGGGTTTGTTATGTCGCGCTCGATTTTCGGTTACGCGACAATGTTGTATTCCAAAAAGATAAGTGTGGGATAATTGTAAGCAAAAAA TAAAATGAAAAGTGGTAAAATTAGATCTTTATGGTTGTTTTCTATTCATGTAAGAATCTTACACAATGTAATGCCCCTATGTTTGCAAAAGCAGGCAAGA TGTTAGTGACAGTAATGAAGTGAAATATAGTACCACTCAACTTCATTTTCGTGAGGAGATTTACGGTTAGTTTGGGAGTTGGATTTTAAAGGGGAAAGAA GAGAAAATGAAGGCG
• Tissue: pods
• Gene name: LI_gene_192288;
• Additional information: details;

Expression of Ll_transcript_485942

FPKM

• PAB: 31.6
• PNAB: 11
• PS1: 21.5
• PS2: 1
• PS3: 1.6
• PW1: 44.9
• PW2: 18.7
• PW3: 8.8

Labels

• PAB: abscising pods
• PNAB: non-abscising pods
• PS1: seeds stages 1-3
• PS2: seeds stages 4-6
• PS3: seeds stages 7-8
• PW1: pods wall stages 1-3
• PW2: pods wall stages 4-6
• PW3: pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_485942

• Blastp: Desiccation protectant protein Lea14 homolog from Soja with 86.9% of identity
• Blastx: Desiccation protectant protein Lea14 homolog from Soja with 86.9% of identity
• Eggnog: late embryogenesis abundant protein(ENOG4111PUK)
• Kegg: Link to kegg annotations (547837)
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019415888.1)
• Pfam: Late embryogenesis abundant protein (PF03168.12)
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;