Ll_transcript_485892

• Id Trinity: TRINITY_DN52392_c0_g1_i6
• Name Transcript: Ll_transcript_485892
• Sequence: CAGAAGAAATATCTTGAAGAGTCATGCAAACCAAAATGTGTAAAACCATTACTTGAATATCAGGTGTGCTTTTCTCATTTGTAAACCTATAACCTTGGAA GTTTGACAATTTAAATGTGAGCTTTATTCTTAATGTCAGTCAATAATACAAGATTTATTTATTGCTCAGATTTTAAAATCCATAGAAGATGGGTGAAAGT TGACTTTTTTCTCCTTTAGTTAACACTGGTTGGATTTTATTGCTATTTGTCAATCATATTGTCTCTATAACTGAGTGTATGTGAAAAGAAGTATAAAGGT GGTACTGACATGAAGAGAACTATAAGAAATGCAATGTAGCAAAGATAGTTGTGAAGGAGGTACTAGGTGTCTTAGGCCAATGGTTTCGTAATTTTATATG ATCTTATAATCTGCATTTTGTAAATGATTAAATTGGATTTTTGTACTGAACTATAACATGATATCCAGGTGCTTTTCCTTTCTTCTGATGTGTTTTGCTC TTCACTTGTATTCTGTGGACTGTGGAGAGTTTAGCATTTAAACTTATGTCGGGGATTAGTCTTCAAGTAACGAAAGATTATAACTGCGGGTTGATGAATT TCTGGCACTAATTAAGTAGTTGCTAGTCTCTTCTAGAGAGTTGGCATTGATTGAACCTCATTGGATATATCTTGATGCATCAACAAGTTTTAAAGATGCA AGACTTCAAACTTACATATGTGGGGATCGTGGGATTAGGGTGGAGATCCTAGGTTCAATTTCATGTTCAATAAAAAAGATTATGGTATTGTGGGCTTCCT TTTATAACACATTTCATCTCCATTTAATTGACAAAAGTAGCACACTGATATCATTTGTAGGCACCTTTGATTTTATTTTTTGCCATTAGAAGAAAAGTTT GGGTGAAAGGAGGTTTTCTTAATTTCAAGGTCTGTGTGACTAACCTATGCAAAGATTTACAATGGGAATACAGATTGTCTAGCTACAGGGGATTCCTGGA TTCAAATACATGTGATGCAATTCTCAGTACCTTAGACACTAAATTGTAGTAATAATGAACTATACCTTAGATTACAGTATATGATAGTATTTATAAACAG TAAATTTTGGAGTTGGGAGTTAGGACTAACGAATCAACATTAGCTATTTTTTTTTTCCTTTCGGCCTTATTTTTTCTGTTTTTTGAAATGATTTTTTTGC ATTGCAAGTAAAAGTAATTTTTAAAATTGCTACAGGCATGTGTTAAAAGGATCCAAGGGGACGAATCTGGTCACAAACATTGCACTGGACAGTATTTTGA TTATTGGTCTTGTGTTGACAAATGTGTTGCACCAAGGCTACTCCCCAAACTGAAGTGATGGATGATATTTTATGCTATATTATCTTTTTGTTCTATTTTC ATTCCCTTAAAACTGCTCCCAAATGATTTTGTAACCAAACTTTATGTTCTTTGCTGTGAAATTTTGAACTCATTGGGACCTCAGTCTATTATTAATAAGA AAGACATATTGTAACTTTGAGATTAGTAAAGATGTATTCTGGTATTGATCCAGCATTTGATGCAAGTTTGAATATTTGAATCTTATGATGCCAGCTTGTA TTGTACTTAAATATACTTTCTTACTACTCCATTACCTACTCTTTAGCTTCACTTGGAATTCATATAAGAGAAAGTTGTGTTCTTTTCTAAGCCACATTAC CGCCAAACTTGGCTACCCTTTTGGATGTTGATATATTGCTTGGTCCATTCAGAATAAACAAGAGTCAGAAACACCATAGAAATAAAGACTCTTTGCACTT TCAAGATTTCATTTTTCATTGTTTAGTGGCCATTTTTTTATCTTACAAGTTTAACAAACCATATTGAATTGTTAAACTCAAAATATTAGCTACTTACGAG GTTCTGTGATTGATAATGTTCATGTTGTGATGGGGAAACAAGGGTCTTCTAAGGATGTCGTTTTTGGCTTAGGAATGAAAGTTCACAACATTAGATGTCG TAATGATCCTCCATCTTGGAGGAGGATGACTAGTGTTGATTGCCATTAGAATTCAAAATCATTATTGTTTCATGAGTTAAAAAATGACACTTCTAAGTAG AGTTCTTGTAAGAGACTATATGTTGGAAAAAGCATTTGTGGCTCCAAAAGCACAAAAAGATTATAGTTGTCATGTTTGGATTGTTGAGTAGTCTTTTCCT TCTTGATTCTCTTATATTCTTTTCTGATTTTGCAAAATTTCAACCCTCTACAGCCTCTAATAGCTCAAGTGAGTTTCAGGTACGAGTACAACTAAGAATA TCTCAGGCTTGTTAGCATTGTCCTTGAATTAATATCTACAAAGACTACATTAGCTCTCTTTGTCTATATTTATTCTATTTACCATGCATGTTCAAGTCAT TAAACTTGAGTAGGCTTATTTATATCTTAGCCTAGTTTCCAATAGTGTTCTCTCATAATCAAGTGCATTCATGTTTATCTTGTGTCCTCCCTTCGATGTT TTTCGGATGTGTACGTGCAATATTGTATTCTGCTTTGCATGTGATGTTTTTAATTTTGAATTATCCAGCACAGATTATGTTAATCTTGGTGATCAATGTG TTTCTCATAAATTAGACTAGACTTGGAGTTGAAGTAACTATTACTTCTAAAATTCATGTATTATTTAACATTGACGTTTTTCAAAATTGTATGCCTAATG TGTTTGTTTTAATGAGAAGGGTAGAGCTTCCTACATCAACAAGAAACAATCACCAATACAGATGTATGATCGGTTGCTCCATCAACAACAAAATTGTATG CCTAATGCATTTGTTTCGGGGCCGGAC
• Tissue: pods
• Gene name: LI_gene_192355;
• Additional information: -

Expression of Ll_transcript_485892

FPKM

• PAB: 0.6
• PNAB: 0.5
• PS1: 0.6
• PS2: 0.5
• PS3: 0.6
• PW1: 0.6
• PW2: 0.5
• PW3: 0.7

Labels

• PAB: abscising pods
• PNAB: non-abscising pods
• PS1: seeds stages 1-3
• PS2: seeds stages 4-6
• PS3: seeds stages 7-8
• PW1: pods wall stages 1-3
• PW2: pods wall stages 4-6
• PW3: pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_485892

• Blastp: -
• Blastx: Cytochrome b-c1 complex subunit 6 from Solanum with 75.61% of identity
• Eggnog: -
• Kegg: -
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019462663.1)
• Pfam: -
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;