Ll_transcript_348761

• Id Trinity: TRINITY_DN52423_c0_g1_i2
• Name Transcript: Ll_transcript_348761
• Sequence: GTTAATTTGGCAGGTGTTGGAGACTGTTGATGATCAAATTATGAAGTCATAATCTTATAGATGGAAGGGCCATAATTTGATCATCAACAGTCTCTTATTA CTTGATCAGCAGTCTCTTATATTTTATGATTTTTATTCCAGGCTCCATGTATCATACCAGATACCAAATACTAGATATTTTCAGTGTCTGTCAAACTTGA CGACTAGATATCTAATCTTTTGTAGACTTACTTTTGATACCATGTTTTTTATTCTTTATTTCTAACTTGAAAAGAAGGTTTAACTTATTAGTAGGATGTT TTGTCGGAGGCATTACTTATATAATAAATCATACTCTGTTTATCGAGTGTGCTTATTTGTGAGAACATTTCTTATAAAGTAAAGAGTAATGGTAAATATT ACAATTTAATTTTCATAGATGCATACAGGAAAAGGATTTGCTCTAATATATATTAAAGTTTAAACTTTTGGACTCAATCCTTATAATTGATTTATCCCAC TAATATAATTATTCAAAAGGATGATTGGACATTCGTAAATACAATTTTGTGTAAAGTAAATAGAGTCTATCGTGTGGGAACCCCTTGACTGTGTTTTTGT TTTGTTCCCTTATAAGGAAAGACAAGGAAAAATAAAGGAATATATTCATTATGTTATCATTTAAGTGCCTGTCTGCTTAATAGGTTCAAGATCATATAAT ACTTTTTTGGCTCTCAATTCCATTGTGACGAAACCCGTTCTTATCGCTCTAACCTTGTACTCATCTTAGCTTTTGTCCTTTCTTCGTTGTGTTCTCTTTT ATAAAATGAATCGAGTAATGATCAGTCCTCTTTTTAATTGTGATAATGGATAGTGTTTTTTTGTTTCTCTCATGTGCCTGAACTATTATTTAATTTTGCA GCTTCTTGAACCTGGAAGATATATATGGTTATTCAAAGCATTGTACGGTCTTCTAATGTTGCTTCCTCAGGTATCTGAAACTTTAACAATTTCTTTTCTT CAAAAGCTAGCGAGGCTTTAATTTTTTGACAATTCATAAGCGACATGCGTCACGTGACCAGTTTCCTAGTTATATTACTACACTCTTAATCAAGCTCTAA TTTTCTCATTTCTATGTGGTTAATCATTTCAAAAGCAGGAATGTGTTATACTCTATATTTTGTTTCCTTCCCTTTTGCATCTGTTTTATTTGGAGAGATA TTTATTATTTGCCCATGACAGGCCTTGCCATTGCTTGTAGATGATTTTTTTTTTCAATCTTTGATTCTACCTTCCTGAATTTACTTTGGTAAAAAATGCA CTGTTATATGCTTAAAGGCTGGGCAGCCAATCGCACAAAATCAAGTAGGAGTGGTGCACTCCGGCATATAGTTATCTGGTATGCGATATGGTATGGGTTT CACTTGGGTACGTGGTTTGCCACTTTTTACATACGACAAATTCAGTATACGGTAGGTAGGATGAATGAGAGAATTATGTCACTATGCTTCAGCCCTTCCT TGCAATGAGAAGTAAAATCAAGGAGTGGACAACTTAATGCTCATTCGCGATGGTTTTGCTGGAGCTTTGGCCAGGATGGGTTTTGTTTAGAAATTTAAAG GATGAAAAGCCTAATTTACCCCGACTAAAGACACATGTGAAATCCGAGTTTTTAATGTTTTAGTTAATTTCGCGCTCTTCTTTTTGTGATTTGGGCCAAT CCCAACAAAAGATTTTGAACCTCACCTCTCCTAAACTGTTTCTGAAGCCATGAGAAATACGAACGACAAAAAATAAACTTCCTCTGCTGAAGATTTTGAG GCCAAGACGAACACCAAGGCACAAAACTGCTGTGATTTCTGGCGGCTCCCATACTTGCTTTAGCATAATCGCTATAACCCAGTTGAAGCTTTGGAGGTTT AAACTTATTTTGATTATAAGTATGAATGTGTATCTTATTTGGCGCGCTTTAGTATTTTTGAGTGTTTATATGTGTAAGGTATAAACTATCTACCTAGCTT AAAGGGCATACTATGTTTTAGATTCAGTACGAGAAAAATATCAGTAGTTCTTAAGCTATCGTTCAGAATCTACTAGTAAAGGTTTGATCCTGTGTTACTA GGTATATTGGTTGGTGCAAGTTCATCTTTGTATTTTAGTTTTATGTTTTTCTTACATGATTTTTTAGATGTGTACATGCCAGCCAATAAAATTAATGATG ATTCTGATGACAAACTATTGTTGAATGTATCAACTTATCTTCTTGCTGCTTAACTTCTGCATTTTCTTGACAATCTTGGTGATATGAATGGTTTACTGTT TATTTGTTGACTCTTAATCTTATACCACTACGCAGCAAAGTGCCGCCTTCAAGATACTAAAAACTCGTTTAAAAGTTGTACCATCTCATTCTTTCAATGA TGTGCAATCGAAGAGAATGCCTTCAGGGGATCCCCACCAATTTCAGAACATGTCTGATGGATCACAAGTTACCGAGGATGGTGACTTAACTAAAGATTAT GGGAGCTCACATAATGGAATAAATTTTGCTGCAAGGCTACAACAGTTTCAGCAAATGCAGCATTTGCACCGGATGCACTTTAAAGCACAGACGAAGTTGC ACAATAAACCCATTCCATTACCAAAGGAGGCGCAAAGAGAGGAAGAACCAAGTAGAACACAATCTATTGACCTTAATGTTCTTCCTCATAGATCATCAAA GAGAGGTCCAGGGCAGCTAAAATTATAGTGCTAACGTTGCATCTGCCCCTATCTCAAGTCCAATTGTGCATTGATCTCGAAGTGTATGTGAACTTTGAAT GGCATCAGGTATAATGTGTAAAGTTGTAAATCATAGTAGCTCGTTTTATTCTAGTTGTTAGAGGTTGGGACTTGGGATGGTGAATATTGGGTTTTGGAAT CAAGCTAAAGCTAGGGCTTTCCTGGTCTATTCTTTTGACCTCTATACAACTTGATAACCACATGGTTCTGTTATTTTTTGTGTTGATAACCATGTGGGCT AGAGGGATATCTTATCTAGTAATTAACCAATTGGCATGGGGTACTGTAAAGGTTCACATTTATTTTTGTATTTGGTTTGATTCAGTAGCATTAAGCCAGT ATCATTGTCTACATGATTAATTCGGGTCAATGGTTATAGTTTTCTACTTTTGTCTATTTCTATTTCAAGACTTGAATGGTGATATTGCATCAAAGCTCAC TGGATATAAGAGGGATAGAATAATTTATTTTGTGCTGTACAAAAGGTATGGATATTTGTTTTTTTTCTTCACAAATCAGTAATTAACTTACAAAGCTTAT CATGTC
• Tissue: pods
• Gene name: LI_gene_192590;
• Additional information: details;

Expression of Ll_transcript_348761

FPKM

• PAB: 0.3
• PNAB: 0.6
• PS1: 0.2
• PS2: 0
• PS3: 0
• PW1: 0
• PW2: 0.2
• PW3: 0.1

Labels

• PAB: abscising pods
• PNAB: non-abscising pods
• PS1: seeds stages 1-3
• PS2: seeds stages 4-6
• PS3: seeds stages 7-8
• PW1: pods wall stages 1-3
• PW2: pods wall stages 4-6
• PW3: pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_348761

• Blastp: Protein VAC14 homolog from Arabidopsis with 38.18% of identity
• Blastx: Protein VAC14 homolog from Arabidopsis with 40.99% of identity
• Eggnog: vac14 homolog (S. cerevisiae)(ENOG410XP6E)
• Kegg: Link to kegg annotations (AT2G01690)
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019461623.1)
• Pfam: -
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;