Id Trinity | TRINITY_DN52431_c0_g1_i10 |
---|---|
Name Transcript | Ll_transcript_349862 |
Sequence | CCAAAGCTGCTATTTCCTCAAAACAATTGGAAAAAAACATTTTCTTTTTCGGCGGTGGTGTAATTGAATCAAACCCAAACCACTCGATTCTCTGAAAACC CTAACAACAACTTTCCCCATCTTCGTATCACAACCCATGGAAATTCTATTCCTTTCTTAAACCCTAAATTCGAATCATCATTCCCATTCCTTAAATTCAA CGTTTCATTCTATTGGCTGCAATCACAACAGGAATGTCTCTCCCACCAGTACACTATCTATACGTCACAGATGATTCTCTTCGCGAATGGAAGAGTGGAA ACCCTAATCTCAAGATCTCAGAACCTGTTCCATTGCTTCGATTCCTCTACGAGCTATGCTGGACTATGGTTCGGGGTGAATTGCCGTTACAGAAGTGTAA AGTAGCATTAGACTCTGTGAGATTCTCAGAGAAAGCTTCCACTGTGAAATTGGCTTCAAATTTTGCAGATATAGTAACCCAGATGGCTCAAGATCATACT ATGTCAGGAGAGTTCCGCTCCCGTCTCATCAAACTGGCAAGATGGCTTGTGGAATCTGAATTGGTTCCAGTTAGGCTACTTCAAGAACGCTGTGAGGAGG AGTTTTTGGGGGATGCTGAGTTGATCAAAATAAAGGCTCAGGATTTGAAGGGAAAAGAGGTCAGAGTTAATACACGGCTTCTATATCAGCAAACCAAATT TAACCTTCTCAGAGAAGAGAGTGAGGGCTATGCAAAGCTGGTCACTCTTCTTTGCCGGGATTCTGAAGTTCCAACTCAAAAGGCATCTGCAGCAACAATT GGCATTATTAAGTCGTTAATTGGCCACTTTGATTTGGATCCAAATCGTGTTTTTGATATTGTTCTTGAGTGCTTTGAACTTCAGCCTGATAACGATTTGT TTTTGGACCTCATTCCTATTTTTCCGAAGTCTCATGCTTCACAGATTCTTGGATTTAAATTCCAATACTATCAGCGCATGGAAGTGAGCAATCCTGTTCC ATTTGGGCTCTATAAACTCACAGCCTTGCTGGTGAAGCAAGATTTTATTGATCTTGATAGCATATATGCACATCTACTTCCTGGGGATGATGAAGCTTTT GAGCATTATAACAGTTTCTCTTCCAAACGTCTTGATGAGGCTAACAAAATTGGAAAAATAAACCTTGCTGCTACTGGAAAAGATCTTATGGATGATGAGA AACCGGGCGATGTCACAATAGATCTCTTTGCTGCTTTAGACATGGAAACTGATGCAATTGAAGAACGAACGGCTGAGCTTGAAAACAGTCAAACTTTGGG CTTGCTTACTGGCTTTCTTTCAGTAGATGACTGGAGTCATGCACATACACTATTTGACCGCCTTGCACCACTTAATACAGTGGAACATAACCAAATATGT GGCAGTTTGTTTAGGCTTATTGAGAAGTCAATTTCACCAGCATATGATGCTATTCGTCAAGCACATCTTCAAAAGTCTGGGCCGTCGATAGGAGGTGGCA CTGATTCTATGGATGTAGATAACTCTTCGCGAAGTGGATCTTTCATTGATCTCCCAAAGGAACTTTTTCAGATGCTTGCTTGTGCTGGACCTTATCTCTA CCGTGATACTATGTTGTTGCAGAAGGTTTGTAGAGTATTGCGAGGTTATTATCTTTCTGCTCTTGAACTTGTAAGCGGTGGGGATGATGCTTTAAATCCT CATATGCACCTGAAGGACACAAGGCTAAGGGTGGAAGATGCTTTAGGAACATGTCTACTTCCTTCTCTGCAGCTGATTCCTGCCAATCCAGCCGTCGCCC ATGAAATTTGGGAACTTATGAGTCTCCTTCCGTACGAGGTGCGATATCGTTTATATGGTGAATGGGAAAGAGATGATGAGCGCTTTCCAATGCTCTTGGC TGCGAGACAAACTGCCAAGTTGGACACTAGACGTATTTTGAAACGACTGGCAAAAGAAAACTTGAAGCAGCTGGGTCGGATGGTTGCAAAATTAGCTCAT GCCAACCCTATGACAGTCCTTCGGACAATTGTTCATCAGATTGAGGCATACAGAGACATGATTACTCCTGTAGTGGATGCTTTTAAGTATTTAACTCAGC TTGAGTATGATATATTGGAATATGTTGTGATCGAGCGATTGGCACTTGGTGGACGTGATAAGTTAAAGGATGACGGTCTTAATTTGTCAGATTGGCTTCA ATCGCTAGCTTCATTTTGGGGTCACTTGTATGTGTATTTTTTCCTTCCCATTTACATTATTTTTATAGAATTGGGATACTGGATCTGGTTTATCATCATC TACTTCACAGATAATTTAAATGGCAACATAATTCATTAAGTCACAAATTGTAATTTGTCCTCCATGTGTTGTTTGGTCAGCTTTTCTGTTTCTGTTTCTT TTGTGATCTGTCTTTTTGTTTTTAAAAATATTTCTGGCAAGCTCTAATTTTACTAGAACTATTTTATTCTGAAGTAATCATTGTTGATAATGGCATTCAT TAGTCTTTTTTGTACATTCATACCATCCTATGGAATTTAGATATCCAGGACGCGTTGTATCAAATTCCAGGTTGCAGATCAACCTTAACGAATGCAGGAT TGGCTTGCCAGTTGGTGGCATGCACATGCAGCTGTATGATGTGTGGTTACTGTTATTCACTGGCAGATTTTTTGGGATGGATTTTTGCCCTTTGTTGAAA GGGTTGCCACTTCTCTGTTGTCCTTTCAACATTTGAACTGCTATTAGCGCCATGTCCATATCCTTTTAAAAGGGATATTTAAAAAGTTGAAATCTTCCTG CAATAGCCACTGCAATGTTTACGGAGAATTATCTGATCTAAATGAAGTTTTGGACCTTCATCCTTCATACGTAGCATGAAAGGCCAGTGCACTTACCAGA TACAATTAGTCAATGAGAATGAATGAATGAGTACATAAGAAGTGCAAGGAAACTGACTGGAAGTCGTTGGGGTTTTATGAGGAATGATCCGTGTTCATAC ATTTCAATTATTTTTGGTCATTTCGAATGTCAATAATGAAGTGGCACCTTAATGGCATTTGTGGGGATAGTAGGGATACAGATCCGTGTATACTGTGAGT CTACCATTTTGTCCATGCTTATTTTGTGGTGTATCTAAAAAAATCGGGGAACAAATTCATATGCTGTTGGTCTTATAAAGAGGGTGGAGCCCTGAACTGT CTATTTTATGTGTTGGCTATGTGATTATTAATCCTCCTAATTAGGAAGATATGTATTATGCTTGTTGGCATGGGTGCTTAATCCTTGGTATTGGGCTGAT GATGCGAAGGTTTTGGGTCTATCTGATGTGACCGCGGCTGATAGTAGCATTGTTGTAAACGGTCTACTCTATTAGCTATCAGTGTCCTCCTGTGATGCTA ATGATGACTGCAATATTCCAAAGAAATCGTTAGCTTTTCCTGAAGCTGTTTGCTGTCTATTTCTACTAACGGACCTAATGCAGTAGTATTGTTAGATAGT ATACTCTTTCTTCAGATAAGAGAGCGGCAGCTTTTCGTTTGACTTTATCATCACTAGTTTGTTTGATCAACTATAGTTGAGGATGGGAGGATCATATGAT TATATTGTCTGTGACAATGAGTTGCCCACCCTCTGAGGAATGGATTACATAACAAGTTTTTCTAATATTTTACTGATGTGTATACTTCAAAAATGAAGAA TGGCGTGCTTGTGCATGCCTTATTTTTTCCGAGCGTACCGGTCAAATCATGAACAACTTGGGGCCAATATTCTGCTAGGAATTTGTTTTTGCTTTGGAGG GATGGGGAATGATATACTTGGAGCAGTTTGGTTTGCTTTTCTTCTCTCTCTCTATTGTATTTCCCCTTTTTATGTATATAATATTGAGTGTGATACTATA AAATGGTTGTGGAGTGGGATGATATAATGTGTTATCTTTCAGACTATTTTTTTAAGAATTCAAGTGTTTGTGTATCTAGTGAATACTATGATTGCAGTTT CTTAACTTTTTGGATGAGTAACTTGTTCGGGTCTTAATACAAGCTACGGTGAATTATACTGGACTTCCCCAAGGTTGTAAATATTTTACGTGGCACTAGT TTCAAAATCTATTGCACTCTTCCTCAAGATGGACCTTTAGTATATTTAATACTACATTTTGGTGTATGGATGTCATGTGGACATGTCTTCTGTTAATATC TTGGGACATATTTGAGTGTGAGTCAAGAAGAGAACACAGATGCTGCTTATAGTTGGTTTGTTAGGATACTTTCCAAATGACTTTTCTAGATTATAATTGG AGAATTTGAGCTGAAGTCTACTTCAAATAATCTGCATCTATTTTTTTCCCAGTGAGACTTATCTATTTTTTTTATTTTTCATACCATGTTAGGATTTTGT TTGTAGCATCCTTCAAATATTGTGAGCAGAACTAAAATTTGGTGTCCATAATGTATTGATTGAACGTAACGTAACACATGTTACGTCATTGAACAAATTC TTCATCCATGAATGAGGAGTACTTGGTTTCCTTTCTGCACTGTGATTCGTCATATTCTTCATATATATTGTAGAGTTCTTGCGATGTGCGGCAATTACTA TGTAATAATGTTGAGAAGGTTTTCACCTAATTTTCCTTGTTTATATTAAGGCCTGCTTATGTGCAGAATTGAGAAGGATCTATGTGATTACTGGTTAATA TAATGTTTTCTTGAACTCAAATCATTTGTCTGTTATAGGTGTAAAAAGTACCCATCAATGGAATTAAGGGGCCTTTTCCAGTATCTTGTAAATCAGTTGA AAAAGGGGCAAGGAATTGAACTTGTTCTACTGCAGGAGCTCATTCAACAAATGGCAAATTTCCAGTACACTGAGAATTTGACCGAGGAACAACTGGACGC TATGGCAGGGAGTGAAACTCTCAGATATCAAGCAACTTCTTTTGGAGTAACTCGAAATAATAAGGCACTGATAAAGTCAACTAGCAGACTTAGAGATTCA TTACTGCCAAAAGATGAACCGAAGTTGGCAGTTCCCCTCTTATTGCTTATTGCCCAGTATCGTTCTCTGGTTCTCATCAATGCAGATGCACCTTACATTA AGATGCTTAGCGAGCAGTTCGATAGAAGCCATGGAACTCTTCTTCAATATGTCGAATTTCTTTGCAATGCAGTTACGCCAGCAACAAACTATGGTGTCCT TATTCCCTCGCTCAATGACCTGGTCCACCTTTACCATCTGGACCCTGAGGTTGCTTTCTTGATATATCGCCCTGTGATGAGGCTTTTCAAGTCTCAGAGG ACTCCTGATGTTTGCTGGCCCTTGGATGATAAAAATTCTGCAAGTGATGCATCTACAAACATTGAGTCTGATCCTGCAGATTATTCTAGCAGTATGGTTT TAGATCTTGGTTCAGCTCAAAATCCTTCAAGCTGGTCAGATCTTCTTAATACTGTTAAAACCATGTTGCCTTCAAAAGCCTGGAATAGCCTATCTCCTGA TCTTTATGCAACATTTTGGGGTCTCACATTATATGATCTGTATGTTCCAAGAAAGCGTTATGAGTCTGAAATAACCAAGCTGCATGCTAACCTCAAGTCT TTGGAGGAGCTTACTGATAATTCTAACTCAGCAATCACCAAGAGGAAGAAAGAAAAGGAAAGAGTTCAAGAATCCCTTGATCATCTGATTAATGAACTTG ATAAACATGAAGAGCATGTTGCATCTGTTCGTAAACGCCTTTCTCATGAAAAAGACAAATGGTTAAGTTCCTGTCCTGATACCTTGAAGATCAACATGGA GTTTCTTCAGCGTTGTATATTTCCGCGCTGTACTTTCAGCATGCCGGATGCTGTTTATTGTGCTATGTTTGTACACACACTTCATTCCCTTGGAACCCCC TTTTTTAATACAGTCAACCACATAGATGTTTTGATTTGTAAGACCCTACAACCAATGATATGCTGCTGCACTGAATACGAGGCTGGCAGGCTTGGCAGGT TTCTGTATGAAACTTTGAAGATTGCTTACTATTGGAAGAGTGATGAATCTATTTACGAACGTGAGTGTGGAAACATGCCAGGCTTTGCTGTTTATTATAG ATATCCAAACAGCCAGCGAGTTACATATGGGCAGTTTATTAAGGTACACTGGAAGTGGATTCACAGAATAACACGGTTACTGATTCAGTGTTTGGAATCT AGTGAGTACATGGAAATCAGAAATGCTCTCATAATGTTGACAAAAATATCTGGCGTTTTCCCTGTTACTCGGAAGAGTGGGATCAACCTTGAAAAGCGGG TAGCTAAGATTAAAAGTGATGAAAGAGAGGATCTTAAGGTGTTGGCAACTGGTGTTGCAGCAGCATTGGCTGCTAGGAAGCCTTCTTGGGTTAACGATGA AGAATTTGGTATGGGTTTTCTTGAGTTAAAGCCTACACAATCTATAACTAAATCTTTGGCTGGAGCATCTGTACAAAGTGGGATGGGTCTTGGTGTTTCT CAAGCTGAATATTCCAGCGACAAGCATTTGGACTCTGGAAACACAGTCAAAGAGCATATAATAAGACCAAAAACTGGAGACAGCAAGTCAGAAAGGAGTG AAAGCACTGCTGTAACCAAATCTGAATCTGTTCTAGTAAAACTCAAGGGTGGTTCATTGGTGAATGGATTGGATGCTCATTCATCCTTACCCTCATCTTC TGTACAAACTGGAGTTTCAAAATCTACAGAAAACCAAAAGCAAGCGGAAGAACCCATAATTAGAGCATCAGATGAACATGTGACAAGAGCTGCGGAGGTT GTATTTAATATCTCAGATGTTCTGTTCAATTCAGCTTTTTTCATTTGTATCCTGGCCTACTTGCATGGTTCAATTTGCATCACTCATTTTTTTTAACTGG TTATTGCCTCAGCTTACTACTTGAGTTGATGGTGAAGGAAAACAGCTAACTAAATGTGGTCTGAAGAGTTAAAGAACTTCATATAATTCATAATTCATAC TAAGAATAGTAGAGTTCAGTCATAATGTTGGTTAAGAAAAAGTAGTAGTTAATTATTGTGCTATATTTTTGTTTAGGCAGTAAATTAGAATGGTGCCCTT CATAAGTTAAGTGCCGAACATGTTAGTATTAAATAGATTACCCTCTCTGTTTATCTATTTTCCCTTGAGAATGTAACTTGGTTATTGTTCTTTTTGGGCA GTGCCTTATATTGAGTGTGTGATTCTTGCATAAGACTTTTCCTACTAGTCCTAGATCATTGTAACTATAGTGAAAGACTGAGGTATGATCTGACATTTTT GTGTCTTTCTCTATCTTCTATACTCGCCCTGGCTACAAGAGCTTTGCATGAGTGTATATTTTTAACTGATTCAGGAAAGCGGGAGGGTTAAGCTTGAATG TGCTAGGGTAGGCTTCTTGAATGGATATTGGGTATATAAATAGTGTTGGTTTGGAATTTTTGAAATAAAACTAGTCGAATTTTATTATTGATGGTCTCTA GGGCAAAAAGCAAGCGCCAATGAGCTTTCTTGACATCTAAAATTTTTATACTGTGGCAAGAAAATCAGGCATGAGAGTTAAAAAATTGAAGGAAAAGAAG TCCAGAAGATAATGTGAACATTAGAAAGGACCCAAAATCATCTGAATGATATAACCCGAAGTTTTTTTTCACAAAAGAAAGTACAGTTAAAAAGTCCCAA GCCCTAACATATCCCATGGCTTGGGACTGCATAACTAATGATTGATATTGAAATAATAGAACATCTCTATGCTGAGGGTATATTGTTAATCCATAAAATA ATCAAGCCTATGCTAAACCTAATTGTTTTAATCAATTATAGTCTGTTAAATTATACAGAGTAATACACAATGTCCCAATTTCCTAAGTAGACCAAAATAC TAAAATATTCTATTCTCTAGGTGCAGGTGCCTGCACTGCATTCCTAGTATTCGAAAAAATTAGAGTTGTACCATTCATCATGGTGGAAACCTCTGCAAGT CATTAGTTACTTCTGGTGCTTCTGTCTTAAGTCAAGAAATTCTACAAAACGCTCAGGGCCTGCCGGCTCAGTTTCGAAGCCCTCAAAACAAGATCTTGCA AAAGAGGATGGTAGATCTGGAAAAGCTGTTGCTAGAACTTCTGGATCGTCGAGCAGTGACAGGGATCTACAAACCCATGTATCCAATGGAAGACAAACTG GAACTACAAGTGTATCTTCTTCAGTCAATGCTAATGGTAGTACTGTTGCAGGTTCTACAAAAGGCTCTGCTCCATCAGCAAAGATGGATAGTCCTGGTAG TGAATCAAAGGTAGAGGTTGGAGCAGCCAAGTATTCTGATGTTAGGACTTCTGTGGTTAAGGATGACAGAAATGATGTTGCTGACTTGCCAAGAGGATCC TCTTCTCGTGTTGTTCATTCCCTTGGGCATGATATGCCAGTTGTTACTTATAAGTCTAGTGATAAAGTTCAGAAGAGAGCTGGTTCTGCTGAAGAACCAG ATAGACTGGGTAAACGGCGGAAAGGGGATGTAGATCTAAGAGAAGTAGAGGGTGAAGTTCGATTCGCTGAAAGAGAGAAGCTGGTTGATCCACGATTGGC TGATGACAGGCCAGGACCTGATGAACTTGGGTTGTACAGGACAGGTGATAAGCCATTGGAAAGGCCAAAAGAAAAAGGAAATGACAGATATGAAAGGGAG CACAGGGAAAGATTGGACCGTCCGGATAAGTCTCATGAAGATGATTTCATTGTGGAAAAATATAGGGATAGGTCAATAGAAAGATATGGAAGAGAAAGGT CTATTGAGAGAATACAAGAGAGGGGTAGTGATAGGAGTTTTAATAGAGTCCCTGAGAAGGCTAAGGATGATAGAAGTAAGTTACGATACAGTGATGCACC TGTAGAAAAACCTCATGCTGACGATCGTTACCATGGGCAAAGCTTGCCTCCGCCACCCCCTTTACCTCCTAACATGGTTCCACATTCTGTTGGTGCGAAT AGGCGTGATGAAGACTCTGATAGGCGATATGGAGCTGCAAGGCATTCTCAAAGGCTTTCTCCTAGGCATGAAGAAAAAGAACGGAGGCAGTCTGAAGAAA CTGTGGTTTCTCAGGATGATGCCAGGCGCAGAAAGGAAGATGATTTTCGAGATCGGAAACGTGAGGAACGAGATGGATTGTCAATGAAGGTGGAAGAGAG GGACAGGGAGAGAGACAGAGACAAAGCAAACCTTTTAAAGGAAGATTTGGACCTAAATGCTGCATCCAAGAGGCGTAAACTTAAGAGGGAGCATCTACCA GCAATTGAACCTGGGGAGTATTCACCAGTGGCCCCGCCACCTCCTCTCCAGGGTGGTGGTATTTCACAAGCATATGATGGAAGAGACAGGGGAGACAGAA AGGGACTCATAATTCAGCATGCAAGTTACATAGACGAACCTGGTCTCAGGATTCATGGTAAAGAGGTTGCCAGCAAGCTGAATCGCCGTGATCCCGATCC CTTGAATGACCGAGAATGGGATGATGAGAAGAGACAAAGGGCTGATCAAAAGAGAAGGCACAGGAAATAGCACATCAAAGTTGAGATTTAACCTTTTGGA AGGTTCACCATTTCTTGAAGCTAATGTTCTGGGTTCACATTCTAGCTGCTACCCTCTCATTTATGTGTTTTATTTAAAACAAAGTTTCAGCTTTTCATAT TTATTTTTTCTTTCTGAAGTCAATGAGAAGAAATTGTGAACCGACTTGTACACTTGTATATATTGTGTTGTATAATTTGGGTAACCAGTGATCAAATGTA CACTGTGACAATGTTAATTAGTTTGTCTGAATCCTAAGTTAAATGAGTGGTCCAAACGAGGAAACTTGCATGTTAGCAACACTTATTTTTGTCCTAACTA TTTTATTATGATTGAAAGATAATAAAAGATTGGTCTTTGAAAAAAA BLAST |
Tissue | pods |
Gene name | LI_gene_192654; |
Additional information | details; |
PAB | abscising pods |
PNAB | non-abscising pods |
PS1 | seeds stages 1-3 |
PS2 | seeds stages 4-6 |
PS3 | seeds stages 7-8 |
PW1 | pods wall stages 1-3 |
PW2 | pods wall stages 4-6 |
PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_349862
Blastp | THO complex subunit 2 from Arabidopsis with 73.73% of identity |
---|---|
Blastx | THO complex subunit 2 from Arabidopsis with 73.73% of identity |
Eggnog | tHO complex(ENOG410XQ2A) |
Kegg | Link to kegg annotations (AT1G24706) |
CantataDB | - |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019437447.1) |
Pfam | THO complex subunit 2 N-terminus (PF16134.4) |
Rfam | - |
GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |