| Id Trinity | TRINITY_DN52446_c1_g1_i1 |
|---|---|
| Name Transcript | Ll_transcript_350582 |
| Sequence | TTCAAAATGTACATGGATTTGTTTTGGAGGATAGACCTTTAAGGGCTTGTTTTGGAACAACAAAATATTGTCATGCATGGCTCCGAAATATGCCTTGCAG CAATCCAGATTGTCTATATCTGCATGAGATTGGCTCTCAAGAAGATAGTTTCTCTAAAGATGAAATTAGGTACTTTCATTATGTTGAAGTTTTAATATGA GGCTAATTGTGAAAGAGGGTATATCCCTTAGATTGGTTTTTAATAACAGAAGATGAAAAAAGTTTACTATCCTCTGGGTACTTTTCTTAGCTCAATTTTT ATACGAGGCTTACTATTATTCAGTTGAAAGATAAAATCTGTGGTTGAAATTGGGTGATTTTGATCTTGCTGTTCAAGCCTCTTTAATTGGATAAAGCAGA GAATACTTTACTATTATTTTCTTGAGAAGATTGTTTCTTTTCATTGGCCATGTAAGCATTGCAGATTAATGAATAATCTTTCACTGTTAGAGGATGTAGC ATTACATCAACATGTGAGCTTGCTGATGTGTATACAGGACTCAATCCAAGTCTTGTATCCACAAGCCTAGGCTGTTCGTTATGTTACTGCTACCTCACCT TGAGTGTGCAACTGTGACTCAGGTCTTATAACATTGCCATTGGAAGACAATCATGAGTGCTGAGTATGTTGGTCTTCTTGCCAATAGCACATGACTTGGT TCCTCTCCAAGCTATCAAATTGGGTATCGGTTGTCAATTGGTGTTCTGGGTCAAAGAGTACCCTGATGGGTGCATTAATATGTATGGGGCTTGGTTCGCA ATCAAAGGTTTCCATCAACAGTCTGGTTTTACTACATTGAAACCTTCTCACTACTGTTCAAACCTGTGATTGTTGAGCTATCCTAACCTTAGTCCTCAGT AATCACTGGCCTGTCTAACAACTTGATTATAATAATGCTCTCCTCAGTGGATTCTTAGAGGAAGAAGTTTACACGCAGCAACTTAATGGGTTTGAAAATA AAGAATAATTGCCTTGGACACTAAACAAGGCTAGATTGAAACATGCACTCATGGCCTTCACTTTTTATTAACGCGGGAGCATAGTCATGCGTCCTTGTCT ATATACATGACGTCGTTATTATTGGCAGTTCTTGATCTTTAATTAAAAGACTATAATCCAAAACGAATTCAATATTTTCCCTCCAACATTTGGGTAATTT GGACTACTTCCTAGTGATTCTTTGCTTCTCCGGCAACAAAGAGCAGATCAAAGAACTTTTCGAAAGGATAAAGTGGGTGAAGCTTAGGGCAAATCTACTC ATTTGCTTGTTGGCGGGAAATTGACCTAGTTTGAGGATATTCACTCCAGACCTCTATAGGTCAGTTGGTGCATTCCAAGCCCACAATCGTTAGATCTGAA ATCTGTTATAGTGTGAACAAAATGCATCACTTTCTGCCATAACCTCGGAAAGATTTTTCTAAGTGGTTAAGTGCCTAACAGGGTCCTTAACTTATTGTTT ACTGCTGCAGCCATCTCTGCTTCATCCTCCACATCCTCTGCTGATTTGGGCACCATATCCAGATAATCATAGATTAACATCTTGAGTTTGTTTGGGGCCT AATCTCACTTCTTGCTAATCAACATGAACATATCAGTGGTTCCAAGTTCTTGCACTGAATCTTAGTAAAGAAGCCTAGTTAACACTTCAGTAGAGTTACT TTATATTCAGAAACTGCCCAAAGAACACAGTCCCAGTTTTGATGATTGCTATTATCTATGGCTGTGACAACCTAAGCATTGTTTCGCCGATAAATAATCC AATTTCTCTCTCAAAGAGTACAATATGTAGCATTACATCTGCTTATAATCTTGCTGCCTTTCCAACATAGCTGTGACCAACTTATAGTTAATTATTGTTT TGCCGTGATCTAGGTGGTCTGGACACACTATATATACCTGGAAAAAATCGATTTCTTTTATGTTATTTTTAGTTAGATTTTGTCTTTTTTAAATAGATTT AGATGGGATTCACATTACGTTAAAACTATTTCCATTATGAACATCTTAATATCGTATTTTCAAGAACCATGCTGTTTTTGAACTGCGTGTAGTGCTTTTC ATATAATAGTCTAGTCACTTGCTTTATTGTTTTGAAGAGGTCGTGTTCAACAAATTACTGGTGCTGCCAACAATATGCAACAACGGTCAGGGACTGTATT GCCGCCTCCCTTGGATGATTGCATGAATAATTCGCCAGGAAAACCCATTATGAAAAATGTTTCAAGTCAATGCTCTGCTAGCCTTGTAAGAGGTTCACCT CCTAATGGAAGTTCTGGCAGGCCTATGGCTCTTCCTGCTGCTGCCTGGGGTTCACGGGCTACAAATTCTCAGCCTGCTGCTGAAGGTACATTATGCCCAA ATGGCCCTTCCATGCCCAGATCCGATACAATCAGCAATGCACTGTCGTCCTCCTTAGCTGTTGCAGACACAAATCAGGCTTCACTGCATATTGATGTGAC AACGAGGCCACTGTCCAGTGATGAGAGTCATAGTATGACATCTAGGGTAAAAAACGAATCGTTGAAACCTCTTAAACAGTACAACAACGTGGATAGCAGT GTTGGCGAAAAAACCTTACCCACTGATGTTTCTCTTGCATCTTTAAATTTGAACAATCAGTTGTCTTCTCTATCATTAGCCAGAGATAGTGATAAAGGCA GTTGTACTACAACAGACACGACAAATTCTATTGACATTACTGGGCAACCAGGTAGCTTTGGTCCTGAAGAAGCAATTATTGCTACAAATGAATATTTTCA TAATTTATCTTCTGAGTTATCCTCAATTAACAATGATAGAAGTGTCCGTAATGAACACTACAGCCTAACTGAACCTAGTAGACCACCTTCTGATTCCATC TTAGTCAAATATTCCCAGTCTGAAGGATCACAGGTCAATTCTGACAAATTTAGAGATTCAATGATTACAAATGCAGCTGTATCAGCTTCCACATCAGATA ATGGGGTTTGTAATCCAAAGGAATGGTGTGATTTGAGATTTGATTCTCAAACCCTCGTATTATCAGGTAATGCTGAAGTCGAAGACGATGTAGCATCTTT TGATAATCAACGGCTCAAGGATCCAGAAGTTGTTTCTCGTTCTTATTTGCCAAAGTCATCTAGCTTCCTCAATGCGTCAAACTGTTGCAGTCCTCATCTT CTGCAACATGGTGAACATGTTGTTGCAAATGCTGGTTCCATTTCTATGCCTGATAAAGTTGGGAATGATTCTGTATTGCATGCACCTGACATATTATACA ATGGATACCCTAAAAAATTGGAAAGTATCAGCTCTTACAGTTTGCCTCATGATGAAACAAACAAACAATGTAACGGAAGATTGGTTACTGAAGCCGTTAA TACAGGAAGTGGTGCTGCTGTGGATAAGGGTGAGAGTACTATAATTTCAAATATATTGTCCATGGAATTCGATGGCTGGGGTGACTCACTAACATCACCT AAGAATTTGGCCAAACTGTTGGGTGACAACACTGATAACCAGAATGGTCCATTGAAGAATTCTAGTACCCGAAAAGTCCAAAGTAACAATCAATCAAGAT TTTCTTTTGCAAGGCAAGAGGAATCCAACATTCATGCCTTTAATGTACATCCATCATACAATACCAGCCATCAATTTCCAAATAGCAGGTCACCCATGCT GGAATTTTCAGAAAGAGATGTGTCTCTGGGTAAGTTCGGTATTGCTAATGGCTTCCATGCCAGTAGCCTTGAGGAATCTGAAATTCTACGCAATGGTCAT TTGCTTGCGTTTTCTAATAAGCCCTCTGTTGTTTCAAGATCTCAAATTTCAGCGCCGCCAGGATTTTCAGTTCCAAGCAGGC BLAST |
| Tissue | pods |
| Gene name | LI_gene_192780; |
| Additional information | details; |
| PAB | abscising pods |
| PNAB | non-abscising pods |
| PS1 | seeds stages 1-3 |
| PS2 | seeds stages 4-6 |
| PS3 | seeds stages 7-8 |
| PW1 | pods wall stages 1-3 |
| PW2 | pods wall stages 4-6 |
| PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_350582
| Blastp | - |
|---|---|
| Blastx | General negative regulator of transcription subunit 4 from Saccharomyces with 49.06% of identity |
| Eggnog | - |
| Kegg | - |
| CantataDB | - |
| Mirbase | - |
| Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019457807.1) |
| Pfam | - |
| Rfam | - |
| GO | - |