Id Trinity | TRINITY_DN52446_c1_g1_i9 |
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Name Transcript | Ll_transcript_350594 |
Sequence | TTCAAAATGTACATGGATTTGTTTTGGAGGATAGACCTTTAAGGGCTTGTTTTGGAACAACAAAATATTGTCATGCATGGCTCCGAAATATGCCTTGCAG CAATCCAGATTGTCTATATCTGCATGAGATTGGCTCTCAAGAAGATAGTTTCTCTAAAGATGAAATTAGGTACTTTCATTATGTTGAAGTTTTAATATGA GGCTAATTGTGAAAGAGGGTATATCCCTTAGATTGGTTTTTAATAACAGAAGATGAAAAAAGTTTACTATCCTCTGGGTACTTTTCTTAGCTCAATTTTT ATACGAGGCTTACTATTATTCAGTTGAAAGATAAAATCTGTGGTTGAAATTGGGTGATTTTGATCTTGCTGTTCAAGCCTCTTTAATTGGATAAAGCAGA GAATACTTTACTATTATTTTCTTGAGAAGATTGTTTCTTTTCATTGGCCATGTAAGCATTGCAGATTAATGAATAATCTTTCACTGTTAGAGGATGTAGC ATTACATCAACATGTGAGCTTGCTGATGTGTATACAGGGTATTCAGATTCTACTACCTTTCTGACTCTGGCCAGTTTTTCCCACCGGTCTCAGCGTGTTT CTCTGTCTGTTCTTTCTATGCAGACTCAATCCAAGTCTTGTATCCACAAGCCTAGGCTGTTCGTTATGTTACTGCTACCTCACCTTGAGTGTGCAACTGT GACTCAGGTCTTATAACATTGCCATTGGAAGACAATCATGAGTGCTGAGTATGTTGGTCTTCTTGCCAATAGCACATGACTTGGTTCCTCTCCAAGCTAT CAAATTGGGTATCGGTTGTCAATTGGTGTTCTGGGTCAAAGAGTACCCTGATGGGTGCATTAATATGTATGGGGCTTGGTTCGCAATCAAAGGTTTCCAT 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AAATTGATTGATTTATCCCATATTTATTGGAATTGTATCTTTTTCAGTCTAGTTTAAACTAGATTTTTGGATATAAATAGAGGTTTCATATCATAGCTCT GATTCAATGGATTTGATTTTTGCTGCAGCCTTCCATAGTTTGTGTGATATTCATAGTTGATATGCTTTTTCTATTTGGACTGATCTTGTGGCCTTTTCTC CGGAAGATCTTTTACTAGGTATTTTTTTCTGTGCGTAATTAGTGGTCCTTTTTTTGTTTGTCCAATTTCCATTTTGCAATTGTTTATCAGGCTAATAAAG CATCATGGACAGTGTAGCTTGTGCAACTTTAATGAATACTTTCTACATGTTATAAAGTTA BLAST |
Tissue | pods |
Gene name | LI_gene_192780; |
Additional information | details; |
PAB | abscising pods |
PNAB | non-abscising pods |
PS1 | seeds stages 1-3 |
PS2 | seeds stages 4-6 |
PS3 | seeds stages 7-8 |
PW1 | pods wall stages 1-3 |
PW2 | pods wall stages 4-6 |
PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_350594
Blastp | - |
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Blastx | General negative regulator of transcription subunit 4 from Saccharomyces with 49.06% of identity |
Eggnog | - |
Kegg | - |
CantataDB | Link to cantataDB annotations (CNT0000387) |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019457807.1) |
Pfam | - |
Rfam | - |
GO | - |