Ll_transcript_349290

• Id Trinity: TRINITY_DN52463_c1_g1_i1
• Name Transcript: Ll_transcript_349290
• Sequence: ATCATCTACCATTCATTTGGATTATTTTTTCTAAAAAGTCAACAATAATTAAAAATTAATGGTGATAACGTAATGACAGTGTATAAAACTCATATATTGT CAGTGCATACATCTTTCTCTCGATCGAAAAACACATCAATCAATGAAAACGTAACAAACGTTATACATATTACATTTTTTATTTGTTGAATTCCTCCCTA TGATGACCTCTTTACATCCTTGTAGTTAATACTTTTTTCATGTAATAACTAATTAATAAAAGAGTTTAATATCTCTATACATTACAGACGTAATTTTTTT TACACAAATGTGTATATTATTTATTAATCATGTGTATTAATTTTATGTAAAAATGAATAATAATTAACACATGAATAATAAATAATAAGCTGACAATATA AAAACTAATTTATTTTCGAGTTAAATTTTGAAAATGAATGAATGAAAATGGAAGGCTCGAGAGTTAGCTCTAAAGCCTTCCTTTTCCTTTTACTGATTCT AAAAGTCATCTTGCAAACAGGCTCTGCAATATTTGTTGGCACTACTAAGAATATCTATTTCGTCACCTTCTTAGGTAAGAAACTAATCACTTCCCGAGTT TATGGCTGCCCCTTCCAACAAGTATTGTTCCCAGGAATCGAACTCTGAAACTTGGAGATACAATGAAACCTTAGATCATTTTATAAACGCCTTCTTAATA TATGTATATAGTTAGCATGTAAAGTACATGATACATCTACATGTGATTCCTGCAGCTATGTATATGAAGGTGAAATCACCTGTACCCTACAGATTAAGGA AACTAATGCCACAACACCTTAAATATGGGATAAACTTTGCTGTTGGGGGTACTGGTGTCTTTGACACCTTAACTGGAGGTCCTAACATGACAACACAGAT TGATTTGTTTGAACAAGTTATCAAAGATAAAGTCTACACTGCCTCAGATTTCAACACTTCAGTGGCTCTTGTTTCTATAGCTGGAAATGACTATAGTCAT TACTTGGCCACAAATGGCTCTACTCAGGTAATTAAACTCACTTCATTTATTCTAATATCTATCAGTATAAAATAGGGTTGTGCATTCGTTAGGTTAGGTT GAGACGGGTTAAGGCTTATCCTTATCCGGCCATAAATGTTGGTCATTTTCTGAACCTGGACTTAGCCCTAGCTCTGAGGCTAACCCGACCCTAAAAAATC GAGCCATTTAGTCTTTAAAACCGACCCGATCCTAGATCCGATTAAATATAACACATACTTATTTTAGATAAAGTTTTATCAAGATGTAATTTGACATATA AAATGATATGTATATATGATAAAAATTAGAGAACCAATAAAACTTTCGACAAAAATAGTGGCGTTACTCTATATACATTTGAATTGGAACATATACAAAC ATGGTGAGTGAATGATTATGGGTCGAGTCATGTCGAGTCATGCTTAGTCCCTCTCGATTCTAAATATTAATCGGGTCGAATTTTTGAACCCGAACTTGGC CCTAGGCCCGATGAGACCCGATCATATTTGGACTCGATCACGATCGAGTCATGCCGAGTGAGCAGGTAGGGTCGAGTCTTGTCATCTATAGCATAAAGAT TTATACAGAGTTATTATATCATTCATCATTTATTTGCAGTACTCTTTATTTGTATAAAGTGTTAGTAATGATGATTAAATATGAAGGATGGATATATAAA ACCACATATATCTTTTCCATTATTTTATACTAATTCTTAGCTAAACGAGTTGTTTCATGTGCTTTTTTAACTTCAGAGATTTTTGGCTTCTTCTTTTAAG AAGAAAAAACGAATATTTCTCATTTTGGTTTAATTAAAATTTAGTACCAACATTTTTAACTTTAGATTATACTATTTTTTAGCTAAAGGAGTTGTTTCAT TTGCTTTTCACTTTACAGATTTTTTGTTTCTTTTTTTAAGAAGAAAAAACGAATCTTTTTAATTAAAATTTAGTACCAACATTTTTAACTTTATATTGTA AATACTCTTGTAGCTAATATTCGATCTTAATTTATGTGTTGGATCAAGCAGATATATAGAAATTAGCCTTATTGATAACCATCACATGTTACATATTTTT TAGTCAGAAATAACTAAAAGTTAGAGTTAATTAAGTTTGTTAAATTAGATTTGAAAACCAATAAGGTGTTGCCGCGTTGGTCTAATGGTGTAAGGTCTCA CTCGATTTCCAAGTCGAGGGTTCGCCATGCCATTGCGAAGATTCCGGAAAATGAAATATATTATATCAAGCAATTTGAATTATTCATGCAGGGTTTGCCA TCTTTTGTGGCCTCAGTGATTAACCAAACAACCACCAATTTGATTAGAATCAAAGGGTTAGGAGTGAAGAAAATTGTAGTAGGTGGTCTTCAACCACTAG GGTGTCTACCTCAAATGACAGCAACATTTTCATTCCAACAATGTAACAACACAACCAATGACCTAGTACTTCTCCACAACAACCTATTAACACAAGTTGT TACAACATTGAACCAACAAACCAATGATCATTCAAGTTTCATAGTCCTTAACCTTTATGATAGTTTCATGTCAGTGTTGAATCACCCTTCAACACATCAT ATTCAGAACCAGTTGAAGCCATGTTGTGTTGGAGTTAGTAGTGAAAGTTTTTGTGGTAGTGTGGATGAGAAGAATGTGAAGAAATATAAGGTGTGTGATG ATCCTAAATCAGCTTTCTTTTGGGATTTGGTGCATCCTACACAAGCTGGGTGGCATGCTGTGTATAACAAGTTGAGGACTATGAATGTTCTTCAACAAAT TTATTACTAGCTTAGTTAGTTGTGACATTTCAGACATGTTTATTGACTTGTTCTTTTTGTTTAGTGTTTAATAATGGACCACCACTTTTCATTTATTATT TGTTCCTCAAATTGTGTCTTGTTTGTAATTATATTCCAACTTATTCTGGTGCTGTGGGTTTGTTGTGGAAATAGAATGTTATAGTTTTGTTGCTAGCTAG GAATTTTTAAGTCA
• Tissue: pods
• Gene name: LI_gene_192923;
• Additional information: details;

Expression of Ll_transcript_349290

FPKM

• PAB: 0.1
• PNAB: 0
• PS1: 1.8
• PS2: 0.6
• PS3: 0
• PW1: 0
• PW2: 0
• PW3: 0

Labels

• PAB: abscising pods
• PNAB: non-abscising pods
• PS1: seeds stages 1-3
• PS2: seeds stages 4-6
• PS3: seeds stages 7-8
• PW1: pods wall stages 1-3
• PW2: pods wall stages 4-6
• PW3: pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_349290

• Blastp: GDSL esterase/lipase At5g03610 from Arabidopsis with 57.58% of identity
• Blastx: GDSL esterase/lipase At5g03610 from Arabidopsis with 57.58% of identity
• Eggnog: GDSL esterase lipase(ENOG4111T31)
• Kegg: Link to kegg annotations (AT5G03610)
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019455740.1)
• Pfam: -
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;