| Id Trinity | TRINITY_DN52472_c0_g1_i30 |
|---|---|
| Name Transcript | Ll_transcript_350247 |
| Sequence | AATGGGTTTGGCTCGAAACTCATCTTCTCAACCGGAGATCGATGACGCCACCGCCGGCAACGACGTTGGATTCCACTCGATCCGTGGCCGATTCCCTTTC AAACGAAACCCTACCTACCACCGACACAGGTCCTTCTCCGATCGTCAATTACCACGAACCAACAACACTAATAGTAATAATACTACTACTACAAATCGAT CTCATCTTCACAATCGCTTCACTCGCAAGGGTCTTCTATGGTTATTCCCTCTCTTTTTCTTCAAAGGCAAGTCTCGATTCTACGCTTTGATTTTTGCAGT TGTGTTTCTTTTTGCACTCGCTTCCATCGTTATGCAGAGCTCCATTGCCTCCGTGTGGCAGCGGAGCGAGAATGGGAGGAACCTCCGGGAAGGGTTGAAG TTCGGGAGCACGCTTAAGTTTGTTCCGGGAAGGGTTTTGAAGAGGTTTCTCTATGGCGATGGGCTCGACCGGGTTCGGTCTCAGCCTAGGATCGGTGTTC GTGCTCCCAGGATAGCTCTTGTGAGTTTTGTGCTTTTACTTTTGATTTTCCTTTTTCAAATCAATGTTGTGTTTAGTTATTTAATAATATATAGTGTGAA GGTTTTAATGTTAGTTATGGCAATGCCAAGTTTACTGTTAGATTTGATTGTGGACAATTAATTAAGTTGAAGTGCTTTTTTTTAATGATCATATTAGTTT TTCTAGATTAGACATGATTTATGATAGAAGATGGTATTCAATTTAATGATCTTGTAGCGGATGAGAAATGAGAATAGGCTGAGCTGTTGTTGAATTGGTT ATTTTTTGAAGGTTCCATTTGAATTATGAAAGAGAACCATTCATTTTATAGAATGATTGTGTTCATTTGTTTCTTTATATAGTAATATAGATGTTTTACT GCTGGTTGTAACAAAGTCAAAAAAACATTTATTGTTTTGATGGACTATATTGGTTATTTAGTTCGATTAATTAATGGGAAGATATTGAATCCATTTGAAT TATATGACTGGAGAATCATGCATTTCATTTCAATTAACAGACTCTGGACCGTTTATTACCACCGTGAGCATTAAATAAATAACATTTAGATATCTTGGGC CTAGATATATTGCTGAGCTGATTTTTACTTCAGCATTTAACCAACATGTAGCAACAGAGTTCGTGCCAGTGTGAATTAGCTGGAGTGCTTGTATTCTGTG GAAGGTTATATTAGGAAGTTATATGCTGAAGAAATTTAAATTGTTATTTTTGTGTATGTATAAGAAAAGGTGAATAACCAAGGGCTACCTTCGGCATTTT GTTATATAATTCAAATAATATGAAAAATGTTGTATGAATTCTTGGTGCAGCAATGCTTGTGCAACACATTGTATCACTGTAAGTTATGAATAAAAATCTA CACCTTTGCCACTGGCCTTGCATTGCAGCCAGTTGGGAATCACTTGATGCCAATTTGTGTTAATATTTGCACTTAGCCTCCAATTTTACACATTCCAATA CCAGGTCTTAGTGCCTCTCTAGTTACAATAAACGGGGAATTTCTTGGGGATATAGTTTAATATCTTCTAATTGGTAGTTGGTTGAAGGGTTTACGATACT TAGTTCAATTACGCCTAGGACACAAATTGTGTATCCTTTAGTTTCCAATCCATTTAGCTAACTATTGAAATAGCTTATCATTTCACAAGTGCTACACTTA ATGTTCATAAATTATAATGTAAATTTAAAATACATGACAGAGAAGTGAAGATTTGATTCACTGAACTGGTTGTGTCTGTAAAGCATGCCACAAGCTTCTA ATGAAATGTTGTTTCAATGAGTGGTTACTTAAAAAAATGGATGATGCTCTTCCATAGCAAAAGTGCAAAATCTATCTGGTGTTCTTAATTTTGTATCAAT CATTTATGCAAACTTTTAGTCCTTTCGGTTCCCTCCATGATTATGGTGGGTTACTGATTTTGACCAATGAGTATAACAATGATAGCTCAATAAAGATACT ATTCACTTTTTAGAAAGCATATGGAAAAGCAACACTTCTAGTTTGTGACCTGGACCTTGTAGCCTTTGGACCAAAAAGGGTTGCCCCTAGCCGTCGTGGG TCGGTCCTTTGGACCAGTTTCATAAAAATGAAAGAAGGGGATGGTTACATTGTCAAACATTAAGGTTTCAGCACTTTATCGGGTTTTCAGACATCATTCA GCATAGTATCATGATCCATGTAAAGCATTTGTTAATTTTTTTTATATATAAATTGAATTGCACACCCTTAGCATATTTATCCGTGCTTGTTTTTTTCGGC AGATTTTAGGTCACATGAAGATAGATCCCCAGTCATTAATGTTGGTTACCGTGGTTCAGAATCTACAGAAATTGGGTTACATTTTTAAGATATTTGCAGT AGGGAATGGGAGGGCTCACTCAATATGGGAAAACGTAGATGGTGGTCTGTCTCTTTTAAGCACAGAACAGAAAGGCCTGACTGATTGGTCAATTTTCGAA GGCATCATTGTTGACTCCCTGGAAGCTAAAGACGCCATTTCAAGCCTTATGCAGGACCCTTTTTGTTCAGTACCATTGATATGGATTATTCAAGAAGATA GCCTTTCAAGTCGCCTACCATTTTACGATAAAATGGGTTGGGAACATCTTGTTTCCCATTGGAGAAGCACTTTTAGCAGAGCCAGTGTTGTTGTCTTTCC AGATTTCACTTATCCGGTAAAGTTAATGATATGTATCACAAAGATGGAAATATGGGCAGTTTTAGAAGTTATTCTCTACTAGACTTGGCCTTAATTGTTT CAAAGGCATTCCTGAGTTTTTATGTCTTCCTGAATCAGATGTTATACAGTGAGCTTGACACTGGAAACTTCTTTGTGATTCCTGGATCGCCAATAGATGT GTGGGCTGCAGAAAGCTATAGTAAGGCCCACACAAAGGATCAGCTTAGAGAACTTAGTGGATTTGGTAAAAATGATATGGTGGTTCTAGTTGTTGGGAGC TCTATCTTCTATGATGACCTATCTTGGGATTATGCAGTGGCAATGCATTCCATAGGGCCTCTGCTGACAAAATATGCAAGGAAAAATGACGCAGCTGAGT CATTTAAATTTGTTTTCTTATGTGGCAATGCTACTGATGGTTACGATGATGCTTTGCAGGAAGTTGCATCACGCTTGGGACTTCCTCATGGTTCTATAAG GCATTATGGCTTGAATGGTGATGTCAATAGTGTGTTACTAATGGCTGATATCATCCTATACGGTTCTGCTCAAGATGTGCAGGGTTTTCCTCCATTATTA ATCAGAGCAATGACTTTTGAAATTCCGGTCATTATACCTGATTTGCCTGTCTTAAGAAAATATATTGTGGATGGAGTCAATGGGATATTTTTTACCAAAC ATAATCCTGATGCTTTGATGAATGCTTTTTCACTTTTACTTTCAAATGGAAGACTTTCTAAATTTGCTCAAGGAATTGCTTCATCTGGAAGACAGCTTGC TAAAAATGTGCTAGCT BLAST |
| Tissue | pods |
| Gene name | LI_gene_193014; |
| Additional information | details; |
| PAB | abscising pods |
| PNAB | non-abscising pods |
| PS1 | seeds stages 1-3 |
| PS2 | seeds stages 4-6 |
| PS3 | seeds stages 7-8 |
| PW1 | pods wall stages 1-3 |
| PW2 | pods wall stages 4-6 |
| PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_350247
| Blastp | - |
|---|---|
| Blastx | - |
| Eggnog | - |
| Kegg | - |
| CantataDB | - |
| Mirbase | - |
| Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019428217.1) |
| Pfam | Glycosyl transferases group 1 (PF13692.5) |
| Rfam | - |
| GO | - |