Id Trinity | TRINITY_DN52514_c2_g1_i2 |
---|---|
Name Transcript | Ll_transcript_506695 |
Sequence | AGAACACATATGTTACACGTGCATTTGCATAGTTAAAACACACATGTTACATATTACCCATACATTTGCATTGTCAAGAATACATGTGCTAGTCGTATAC CAACGCATGTACAATTTTATAAAATGATTAAATGTTATTACTTTTATATTATTAGATAATATATTGAATATATGAACATTAAAAAAGTGAGGTATTTTAG GAGGTAAATTTTTTACTGAGGTTGTGACACATCATGACGTGATAAAACTTTTTTATTATATAGTTAATAGAATAAAAGCCGAAAACCCATCAAAAAATTC GGGCGATACGGGTCGGATCTTACTCACCCATGAACACAATAAAAAAGAGTGCGTTTGAGTGAGAATCATAACAAACGACATAATATCGAGAGTTTTGATG CGCTTTTGTTCATGCAACATTTCACTTCCATCATCATCAAAAATCGCTCTTAAAATGCTTCATTCAACGACTTTAATCGTTTTATGCTTAGGTATTTTTT CGCAGATAACATGCGTGATTGCAGTTTCAGTGCCAACTAATAATTGCTACGCTTTCGATAACTCTAGTCACATTGTTGATTTCAGTAGCTGGGTTGGACA CCTATTTGAGTATGATATGAAGGGTTCTGACTTGGCTGTAAGATTTTGCAAAGATGTGGAAAGTAGATCACAAATGTACATATGGATATGGTAACATATG CTGTGTCATCTGATGCATAACATGTCCAATTTTTTACAGTTTAGATCCTCTAGGTCTATTCCTCCTCAAGGACCTAAGGAACTGTCGTGTAAATGATAAA CCACATTTAACATGGCCTGGATTATTATAAATCTTAAAAAGATTGCTACAGCATTCTGTTGTTTAATTCATTCATATGCTAATCTTAAATGATGTAATCA TCTTCTTTTATCAATTAAAGAAATGCTATTAGTAAATGGTTAACTCACAAGTTGCAAGTATGTACAGCCGAATAGGCCTCTTGAATTCTTCTTGTTTGTC ATTCCTTTCTTTTATGAAAGAGGAAAATAGGACAATTTTTGTCACTTTCGGTTTCTTCTTGTGGGTTTCCGGAGATATTTTCAATAGTTTTGCAGAGGGA TAAGGTCACTTTTGAGCTTATATGTTTTATATTTATTCCTTAAACTCTGCCCCCGATTTTAAAAAAATGATTTTAGGCTGAGTCTTGTTTATTTTTTTGG TGTCTATCATTATTTATTAATAGGTTGCTGCGCTGACGTATTCCCCTGTTGTTTTACAACTACCTGGATATAAGATTACTTCTAATACCTGGGGTGCATT TGGTTTAGCTGTCAAAAATGGTTATCTCAACAATCATTATATAACACTGAATATTTTAGATATGTTAGCTGAAAAGTGATTTTAAGCTAACTTGCTATCT GAAAATGAATTATAATCCATAATACTGAAATAGGAACCTATCATGTTCTTTTTTACCTTCAAGTATTTTTTTATCATTTCAACCCAAACATGTTAGCTTC ACCCCAAAACAAATTTTTTAACCATAGAGTATTTTTTTATATAATTAATTGTTCCAAACACACTTAAATCAGAATAACATGTAACTGTGATTTTTCTTAA ATTTGAATTTGTATCTTTTGTTTCAAAGTCTATCTATTGAGGCATCCTCTTCGTTGATGTAATATATTTTTCACTCCATTGGCTGATTCCCAAAATGTTT AGGGATATGCTGGTTTTGGCCGATTTGATAAGTTCAACTATTTTGTTGCTGGTTCTGGCCAATCTGACTTTGTCCAAGTAAGTTCATTCTTTCTATTCTA TTATGAAAAGGCCAAACGTGAGTGGCAGGGTGAGTGGCAGGGTGAAGCTATTTTCTTTCTATTCTATTTTGTTTCTATTTTGTTGATGTACCCAACCTTA CCCTCACATTCAAAAAGGCCAAACGTGAGTGGCAGGGTGAAGCTAATAAATTTTAAGCTTACAAAGTAATGAAAAAAATAAGTTATAGGACCCATTTGAA AACATAAATAAATAACAAAGGACCTATTTGAATTTGCTAGTAAGAATATTTAGCAATGCCAAACACATCAGTGGCATGTTAAAGTTGTCTTAATATACTA ACACTACTTGAATCTGAATATATGAGTAACTTGATATTTGATGAACATTTGGGTATAATATTTATACTAATCCATCCCTAAACTTAAGGGAATATAATCA GCCATCTAAGGAAAGTATTATAGATAAAGATACAACTAAATAATATTTCAACAATACTAATCAAACTGAAAGTGGATAGGTAGCAAGTGCTCAGTCTTCT TTATTAGTCATATAAGCAGTTTTATAATATATAAGCAAAAAATTCCAAGTTGCAAAAATAGTTTACAATAAAAAATGGGACTTCCAAAGAAGCTGAGTTC TCCTTTGTCGCCAATGTGAGACTTCATCAACCTCTGGGACAATTGTAGGTACTAGGTAGTACATGTAAGTGCACAGGTCGCATTTTATGATCCACTTAGA GTCTTATACTGAAGAATATATGAAATTTTCAAGCCATATTATTTTGCATCACACTTCCAGTTCTCCTCCTTTTTCTTATGACCTTTAATCCAGTTTTATA AACCATTTTCTTGATGTTTAGGAGTTTTATAATGGTGACCTGTTGGGCTGCGAACAAAGTTATGACAAAATGGGAAGAACAGCCAAGGTGAATATCAAAT GTGGGAGTTGTTTGAATGGACAGTGTCAAGGTCATCCTGGATGCATATGTAATGTGTCATTTGAATCAAAGTGCAGGGTTATAGTTGATCTTGCAATTCC ATGTGATAAATCGAGCTCTAAAGTATTTCAAGGATTCACTGTTGGCTTTCATCCACGGTCATCGGAACTTGTTTATAATGGCATGACTCAATTTGGTTTT GAGAAACCCCACAGTGATTTTAGCTTTCAGACAAGTCAAACTCAAGTAGTCCTTTTTATGACTGCAGTTGCTTCGCACTCATCCTTGGTTCAAAAGCCTA GTTTGCAGGTTTTTCCAAATTCGGGTTTGGAAGTTAAACTGTCTGGATCTGCTGCCAGTGGGATGCCTCCTACAACTTTGTCACCCTCAATGTTGATTCT TGATTGGAGATGTGAGGTGTCCCGTGATACTCCATATGAAGTTAACGTCACAATCCCAGTTGACGGTTATGAGCCAATTGAATTCACGCTTACAAAAATA TGTGACTATAAGCAGGATCAAGAAGGAGCTACTACAAGAGGATGGGCAATATTTGGAGTGATATCTTGCATATTCTTTGTCTCTTCGACACTTTTCTGTT GTGGAGGATTCGTTTACAAGACAAAAGTGGAACGCCAGCGTGGACTTGATGCATTGCCTGGCATGACAGTCCTTTCTGCTTGCCTAGAGACGGTGAGTTC CGAGCTCCTACTAATGTTTATTGTTGTAATGGAACTGTTGACATGAAATTAACAATGGGTTAAGTAAATTATGAACTTTATGATAGATTAGGTCCAAGTT GATCATCATCAAATTATCTTCATAGGTCTGAATTTGACTAAACTAAATATTGGACATGAGACACTAAACTTTCATGACATGGTTTAAGCATATGCTAATT GCTAATCATGAGTAAATAATAATAAATTAATTTGTATATATGTTTATTCATAGAGGTATAGAGAAAATTGAATGAGAGGAAAATTTGTGTAGAGAACTTA AAAAAAGAAGTGGGAAGAGAATTTTGGTTCTTATCTTAAATTATTGTTATTTGTATTTACCTTTTTGATCCTATATATTTGACCTGCATGTCTAGGAAAA CGTTAATGAAGTACTTCATAGACAGAATATGAATAATAAAATACTTCACAATTCACTTTATCAATAGCAGAGTGGTATTTGAGATTCAGATGGTGAACTT GTTCATATTGAAAATATTAAACATGACAGAAGTGCAGTATTATTTTGCCAAATCATTTGATAACAATTGCTTGCTCTGCGTTGATATAATTTTAGATGCA TCATCAATTTGTTCCAAAACTTGGCACATTTTTGCTTCCAAAATAGAAAGAAGAAATTGCGACAACGGGACATCGAACTGCAAAAGCAATTGAATTGCGG TATGTAAGTTTGTTTTGCAGTAAAAATGTTTTCTTAAGAATTTGTTTACTGTGTCACGAAAACAGATTAGCGGAGCCGGGCAAGGATACTCGCGGCCAGA AGACCAGAACAGTGCCTTTGCCAGTGAAGCCTCTTGGGAGCGCCCTCCCGCTTCTTCTTCTCAAGGTGCAGCAGCAGCAGGGAGACCAGCTGAAAGAAAA TATGGCGCCATTTGAATGTGTACTGCTACTGACTCTTCATCTTTTTGATTTGTTAAGTAAAAATCTGCCACCATTTTCTAGAATTTGTTCTACCAAAAAT GACATTTAGATAAAACTCATTATAGGTATTTTGAAGGCTCACTTAAAAATGCAAATTTCTATTTACATGATTGTTATTTGTTATTTTCACTCAGATTTGT ATTTGTATGTTATCTTCATGCATTCAAGAAAAGAAAAATGAAATCTAGATATGAAATTTCTT BLAST |
Tissue | pods |
Gene name | LI_gene_193359; |
Additional information | details; |
PAB | abscising pods |
PNAB | non-abscising pods |
PS1 | seeds stages 1-3 |
PS2 | seeds stages 4-6 |
PS3 | seeds stages 7-8 |
PW1 | pods wall stages 1-3 |
PW2 | pods wall stages 4-6 |
PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_506695
Blastp | - |
---|---|
Blastx | - |
Eggnog | - |
Kegg | - |
CantataDB | Link to cantataDB annotations (CNT0000058) |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019423877.1) |
Pfam | - |
Rfam | - |
GO | - |