| Id Trinity | TRINITY_DN52514_c2_g1_i3 |
|---|---|
| Name Transcript | Ll_transcript_506697 |
| Sequence | AGAACACATATGTTACACGTGCATTTGCATAGTTAAAACACACATGTTACATATTACCCATACATTTGCATTGTCAAGAATACATGTGCTAGTCGTATAC CAACGCATGTACAATTTTATAAAATGATTAAATGTTATTACTTTTATATTATTAGATAATATATTGAATATATGAACATTAAAAAAGTGAGGTATTTTAG GAGGTAAATTTTTTACTGAGGTTGTGACACATCATGACGTGATAAAACTTTTTTATTATATAGTTAATAGAATAAAAGCCGAAAACCCATCAAAAAATTC GGGCGATACGGGTCGGATCTTACTCACCCATGAACACAATAAAAAAGAGTGCGTTTGAGTGAGAATCATAACAAACGACATAATATCGAGAGTTTTGATG CGCTTTTGTTCATGCAACATTTCACTTCCATCATCATCAAAAATCGCTCTTAAAATGCTTCATTCAACGACTTTAATCGTTTTATGCTTAGGTATTTTTT CGCAGATAACATGCGTGATTGCAGTTTCAGTGCCAACTAATAATTGCTACGCTTTCGATAACTCTAGTCACATTGTTGATTTCAGTAGCTGGGTTGGACA CCTATTTGAGTATGATATGAAGGGTTCTGACTTGGCTGTAAGATTTTGCAAAGATGTGGAAAGTAGATCACAAATGGTAGTCCATGTCACCATGCTTTCA AGTACTTAGTTCATTATGCACTCTAACTTTGTCTTTTCCATTTTTTTGGGCAGTACATATGGATATGGTAACATATGCTGTGTCATCTGATGCATAACAT GTCCAATTTTTTACAGTTTAGATCCTCTAGGTCTATTCCTCCTCAAGGACCTAAGGAACTGTCGTGTAAATGATAAACCACATTTAACATGGCCTGGATT ATTATAAATCTTAAAAAGATTGCTACAGCATTCTGTTGTTTAATTCATTCATATGCTAATCTTAAATGATGTAATCATCTTCTTTTATCAATTAAAGAAA TGCTATTAGTAAATGGTTAACTCACAAGTTGCAAGTATGTACAGCCGAATAGGCCTCTTGAATTCTTCTTGTTTGTCATTCCTTTCTTTTATGAAAGAGG AAAATAGGACAATTTTTGTCACTTTCGGTTTCTTCTTGTGGGTTTCCGGAGATATTTTCAATAGTTTTGCAGAGGGATAAGGTCACTTTTGAGCTTATAT GTTTTATATTTATTCCTTAAACTCTGCCCCCGATTTTAAAAAAATGATTTTAGGCTGAGTCTTGTTTATTTTTTTGGTGTCTATCATTATTTATTAATAG GTTGCTGCGCTGACGTATTCCCCTGTTGTTTTACAACTACCTGGATATAAGATTACTTCTAATACCTGGGGTGCATTTGGTTTAGCTGTCAAAAATGGTT ATCTCAACAATCATTATATAACACTGAATATTTTAGATATGTTAGCTGAAAAGTGATTTTAAGCTAACTTGCTATCTGAAAATGAATTATAATCCATAAT ACTGAAATAGGAACCTATCATGTTCTTTTTTACCTTCAAGTATTTTTTTATCATTTCAACCCAAACATGTTAGCTTCACCCCAAAACAAATTTTTTAACC ATAGAGTATTTTTTTATATAATTAATTGTTCCAAACACACTTAAATCAGAATAACATGTAACTGTGATTTTTCTTAAATTTGAATTTGTATCTTTTGTTT CAAAGTCTATCTATTGAGGCATCCTCTTCGTTGATGTAATATATTTTTCACTCCATTGGCTGATTCCCAAAATGTTTAGGGATATGCTGGTTTTGGCCGA TTTGATAAGTTCAACTATTTTGTTGCTGGTTCTGGCCAATCTGACTTTGTCCAAGTAAGTTCATTCTTTCTATTCTATTATGAAAAGGCCAAACGTGAGT GGCAGGGTGAGTGGCAGGGTGAAGCTATTTTCTTTCTATTCTATTTTGTTTCTATTTTGTTGATGTACCCAACCTTACCCTCACATTCAAAAAGGCCAAA CGTGAGTGGCAGGGTGAAGCTAATAAATTTTAAGCTTACAAAGTAATGAAAAAAATAAGTTATAGGACCCATTTGAAAACATAAATAAATAACAAAGGAC CTATTTGAATTTGCTAGTAAGAATATTTAGCAATGCCAAACACATCAGTGGCATGTTAAAGTTGTCTTAATATACTAACACTACTTGAATCTGAATATAT GAGTAACTTGATATTTGATGAACATTTGGGTATAATATTTATACTAATCCATCCCTAAACTTAAGGGAATATAATCAGCCATCTAAGGAAAGTATTATAG ATAAAGATACAACTAAATAATATTTCAACAATACTAATCAAACTGAAAGTGGATAGGTAGCAAGTGCTCAGTCTTCTTTATTAGTCATATAAGCAGTTTT ATAATATATAAGCAAAAAATTCCAAGTTGCAAAAATAGTTTACAATAAAAAATGGGACTTCCAAAGAAGCTGAGTTCTCCTTTGTCGCCAATGTGAGACT TCATCAACCTCTGGGACAATTGTAGGTACTAGGTAGTACATGTAAGTGCACAGGTCGCATTTTATGATCCACTTAGAGTCTTATACTGAAGAATATATGA AATTTTCAAGCCATATTATTTTGCATCACACTTCCAGTTCTCCTCCTTTTTCTTATGACCTTTAATCCAGTTTTATAAACCATTTTCTTGATGTTTAGGA GTTTTATAATGGTGACCTGTTGGGCTGCGAACAAAGTTATGACAAAATGGGAAGAACAGCCAAGGTGAATATCAAATGTGGGAGTTGTTTGAATGGACAG TGTCAAGGTCATCCTGGATGCATATGTAATGTGTCATTTGAATCAAAGTGCAGGGTTATAGTTGATCTTGCAATTCCATGTGATAAATCGAGCTCTAAAG TATTTCAAGGATTCACTGTTGGCTTTCATCCACGGTCATCGGAACTTGTTTATAATGGCATGACTCAATTTGGTTTTGAGAAACCCCACAGTGATTTTAG CTTTCAGACAAGTCAAACTCAAGTAGTCCTTTTTATGACTGCAGTTGCTTCGCACTCATCCTTGGTTCAAAAGCCTAGTTTGCAGGTTTTTCCAAATTCG GGTTTGGAAGTTAAACTGTCTGGATCTGCTGCCAGTGGGATGCCTCCTACAACTTTGTCACCCTCAATGTTGATTCTTGATTGGAGATGTGAGGTGTCCC GTGATACTCCATATGAAGTTAACGTCACAATCCCAGTTGACGGTTATGAGCCAATTGAATTCACGCTTACAAAAATATGTGACTATAAGCAGGATCAAGA AGGAGCTACTACAAGAGGATGGGCAATATTTGGAGTGATATCTTGCATATTCTTTGTCTCTTCGACACTTTTCTGTTGTGGAGGATTCGTTTACAAGACA AAAGTGGAACGCCAGCGTGGACTTGATGCATTGCCTGGCATGACAGTCCTTTCTGCTTGCCTAGAGACGATTAGCGGAGCCGGGCAAGGATACTCGCGGC CAGAAGACCAGAACAGTGCCTTTGCCAGTGAAGCCTCTTGGGAGCGCCCTCCCGCTTCTTCTTCTCAAGGTGCAGCAGCAGCAGGGAGACCAGCTGAAAG AAAATATGGCGCCATTTGAATGTGTACTGCTACTGACTCTTCATCTTTTTGATTTGTTAAGTAAAAATCTGCCACCATTTTCTAGAATTTGTTCTACCAA AAATGACATTTAGATAAAACTCATTATAGGTATTTTGAAGGCTCACTTAAAAATGCAAATTTCTATTTACATGATTGTTATTTGTTATTTTCACTCAGAT TTGTATTTGTATGTTATCTTCATGCATTCAAGAAAAGAAAAATGAAATCTAGATATGAAATTTCTT BLAST |
| Tissue | pods |
| Gene name | LI_gene_193359; |
| Additional information | details; |
| PAB | abscising pods |
| PNAB | non-abscising pods |
| PS1 | seeds stages 1-3 |
| PS2 | seeds stages 4-6 |
| PS3 | seeds stages 7-8 |
| PW1 | pods wall stages 1-3 |
| PW2 | pods wall stages 4-6 |
| PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_506697
| Blastp | - |
|---|---|
| Blastx | - |
| Eggnog | - |
| Kegg | - |
| CantataDB | Link to cantataDB annotations (CNT0000058) |
| Mirbase | - |
| Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019423877.1) |
| Pfam | - |
| Rfam | - |
| GO | - |