Ll_transcript_505830

• Id Trinity: TRINITY_DN52597_c3_g2_i18
• Name Transcript: Ll_transcript_505830
• Sequence: AGTGATGATAAAGACTATGGTACAACACATTTACGTCGTCATAGAGGAAGATGTACCAAAATAAGACATGATGATATTGGTCAAATAGTTATGGATAAGG AAGGAAAATTGACGCCTCGAAAGATTGATCAAATGGTTGTACGTGACATGTTAGCTGCTGCAATTATTGAACATCCTTTTAAATTTGTTGAGTTTAAGAA GATTAGATGCTTAATTAACTACTTGAGTTTAGATTTTATTCCTGTTTCGAGAAATAAGACTAAGACTGATCTCATGGTAATCTATATGATAGAAAAAGTT AAGCTTATAAAAGGGATGTCTAGCATTCCTACTAGGATATCTCTAACTTCTGATTTATAGACAGCTTGTACAACTGAGGGTTATATTTGTTTGACTGCTC ATTATGTTAATTCAAATTGGAAGTTAGCAAGTAAAGTTATTAACTTTTGTCACATGTCTCCCCCTCGTACTGGATCTGAATTGTCTAAGAAGATACTTGA ATTTTTGAATGAATGGGGTATAGACAAAAATATTTTTTCTCTAACTTTAGATAATGTTTCCTCTAATGATGTCATGCAAGAGCAATTAAAAAATAAGCTT ATTGTGGAAAACTCATTGTTATGTGATGGACAATTATTTCTTGTGCGTTGTTCTGCACACATATTGAATATACTTGTTCAAGAGGGGTTGAAGGTAGCTA GTGATAACTTATATAAAATCAGGGACAGCATCAAGTGTGTGAGAGGTTCAGAAGGTAGAATGCTCAAATTGATGGTATGTATTGAGAAGATAGGTGGTGT TGATGCTTCTATTGACTTGTGTCTAGATGTTCCTACTGGGTGAAACTTTACTTATTTGATGCTTGAATTTGCTCTTATATATAAGCATGTATTTGAAAAA CTCCACATGTATGATGATAATTACAGATTTTCTACTTCGGTAGAAGAGTAGAAAAGAGCAGATAATCTATGTGTTTTTGTTGCCTTTCTAGCGTACCACA AACTTGATTTTTGGCACATCTTATCCTACTTCCAACTTGTATTTTATGCAAGTTTGGAAAATTCAATGTCTACTCTTTAATACTTTAAGAGATGAAGATG AAGTTTTGAGGAGCATGACTAATAAGATGGTTAAGAAGTTTGAGAAATATTGGGATGATTGTAGTGTTGTGCTTGCAATGGGAGAAATTCTTGACCCAAG AGTGAATTTGGAGACATTGAATTATTTTTGAAAGAGTTGATGATTCTACCTTCGAAACAAATTTGCAGCTAGTTAGGAGAAAATTGTATATGCTATTTGA ATAATATTGTAACACAAGTGCTCCTACTTCTATGCAAACTTTGAGTTTTGATGCTCCTCAGAAAAGGCTAAATTTCAAGACTTTGACTATATGTTTGATG AATTTAATAGGCACAAGAAACAACTTGCCACAAAAACGGGAAAGTCACAACTCGATTTTTATTTGGATGAGTTATCTTTAAATTTTAAAGATAATAATGA TTTGGATGTGTTAGAGTGATGGAAAGAAAATAAAATTCGATTTCTAAAGCTATCAATTATTGCTCGTGACTTGTTTTGTATTCTTATTACAACGGTTGCA TCTGAATCTGCATTTAGCACTTGTTTATATGTTCTTAAGAAGTATAGAAGTAGACTTTTATAAAAAAAAAATGTGAACAACCAACTGAAATGGCTCGGGA ACATCTGAGCAACCAAGTGAAATTACTAGTGTTGCTGGTGTTGGTAAAATAAAAGGAATGGAATAGTATATGTCCACCCCGAGGCAGCGAAGAATATTGT AGGCACCTTAAATGGAAAATAGAAGACCATTGATCACAAAAAAAGATGAAATTGAAGAGAGTCTAAAAGGTCATACCCAAAAAATAAGGAAGAGGTTTCC AATGCAAAAGTCTGTGATTTCCTTAAGTTCATGAGACAAAGCAAATACCAGGCGATAGATAAATTTAGCCTCACCCGTGCTACAGTTTCCTTGTTGTCCC TTCTCATTAATTTAGAAGCTCGCATAAATATATTGTTGAAAATGCTAAACAAGGATCATGTTAGCCATGGTATTACCAGTGATAAATTAAGTGGGATAAT TAACAATGTTGTGGCTCACAATTTCATCTCACTCAATGATCAAGAGATCCTCTTAGAAGGAAACGATCATATTCGCCATTTTCATGTGTCAATGATGTAC ATGGATTTTGTACTAGGAATATTTTTAATTAGAAATAAGTCATCTTTAAAATGTCATGACCAAAATGAGTTTGTCAAAATTACGAGATCATGAATCTCAT ATGAGACCAAGTACAATCACTATCAACCCATTTGACGGATGAAGAAGGGAGGTGATGAAAGAGGTCGAGCTACCCATTAAGATATGACCCTATTCTTTTC AAGTCCTATTTCAAGTAATGGACATAAAAAAAACATACAATATCTTGTTGGGAACACCCTAAATTCATTCCTCAAACGATGTGTCGTTTACTTGCATCAA TGTGTCAAGATTATAGTTGATCGAATTTGTTGATAGTGCTAGAAGAAGAATATATGTTGGTTTCTCAACCATCAAGTTCCCTATATGTTGAAGCAGTTGA GGAGGCCATTGAGACCTCAGTCCAATCCCTGGAAATTTCTCATGCTAATTTTGTAAGAGCAGGAACTCTTATGCTCAAACCACAACCTTCCAAAGCATCA TTTATGATGGCAAAGGTTATGGTGGGAAACTGATTCTAACTCAGAAAAGGCTTGAGAAAGTATGAACAAGGGCCCAAAAGCATATTGTTTCCTCTTGTCA ATAAGGATCATTATGACTTAGGTTATATGCCCATTGGAGCATGCAAGGCCACATTTACGGAGGAGAAAAGGAAAATGAGATTGACACATGTGGGCAGTTT GAATATGAGGTAAGAAGGATTCTTAATTTCTCATACCACATATTAGCTACAACTTCATCACTACATGATTTGAACAACTAGAGATGATTGTGGTAGTAGA AGGAGACTCTCCAAAAGATGGTTCCAGTTACATGTTTTAGTATCCTCCCAACACGATGCTTAATAACTAGACGGAGACCGAAATGCCTGTAGCAGTATTA TATGATGAAAAGTAATTATGCATGAAATTTATTTACTTTATACAAGGCATTTGGATTTTTATTAAATAAGGGTATGTTTTAACTTCTATTGTGAAAGTAT GTATCATTAGTATAATATTAATAAATACAATTTCCATTAAAA
• Tissue: pods
• Gene name: LI_gene_194018;
• Additional information: details;

Expression of Ll_transcript_505830

FPKM

• PAB: 1.8
• PNAB: 0.7
• PS1: 1.8
• PS2: 1.1
• PS3: 1.5
• PW1: 3.1
• PW2: 2.6
• PW3: 2

Labels

• PAB: abscising pods
• PNAB: non-abscising pods
• PS1: seeds stages 1-3
• PS2: seeds stages 4-6
• PS3: seeds stages 7-8
• PW1: pods wall stages 1-3
• PW2: pods wall stages 4-6
• PW3: pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_505830

• Blastp: Zinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 2 from Oryza sativa with 36.43% of identity
• Blastx: Zinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 2 from Oryza sativa with 33.52% of identity
• Eggnog: transposon protein(ENOG410Y37V)
• Kegg: Link to kegg annotations (4334009)
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019414580.1)
• Pfam: -
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;