Id Trinity | TRINITY_DN52601_c1_g2_i7 |
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Name Transcript | Ll_transcript_464851 |
Sequence | AACATGATGCTTCTCATATTAATATCTCTTACTTGAAGTGAATCAACCGCTATCATTCATTTCCACTTAGTTCGAAGCGCGAAGAAACACCTTCGCTACC AATACATTATTGTTTTCCTTCCAATTTCATCTCTCTTTTTCTCATCACACTTCCATCTCAAAATCAACCAGAAGAAGGAGTGGATCGAAGGATATGAGTA ACAGTGTGATATTACATCAAACCTTGCTTTATCAAAGTAAGGTGGTGAATTCTTGTGGCAACACTTTATTCCAACCGGCGAGTTTCAACAAAGGATCCAA GAAGAAGTTTCTGCTGTCTACGAATTTTCGCGGGAACAGGTTTTGTGTGAGGAAACTGAAACAAGCCATGGGAAAACACCAACATGGCTTCGTTATTCCT TGTGCTGTGTTAACCACCAATGCAGCTTCTGAAGAGCTTTCAAGGAGGTTCAACCTGGAAGGAAATATTGAGTTGCAGGTTGTTGTTAGCCCCTCAGCTC AAGGATCTGCACAAGTAGATATTCAGGTTTCAAATAGTAATGGCTCTCTCGTTTTACATTGGGGAGTTGTACATGATAGGCAAGGGTGGGTACTTCCTTC TCGATCCCCAGATGGAACTAAAACATATAAGAACAGAGCTCTTAGAACTCCTTTTGTGAAATCTGGTTCAGGATCCCTCCTTAAAATAGAAGTTGATGAT CCTGCTGCACAAGCCCTTGAGTTCCTTATACTTGATGAATCTCAGAATAAGTGGTTTAAAAACAATGGTGAAAACTTTCACATCAAGTTACCATCAAAAG ATAAGCGGGTTCAACAGGTTTCAGTTCCTGAAGAGCTTGTACAAATTCAAGCATATCTTAGGTGGGAACGGAAGGGTAAGCAGACATACACTCCAGAGCA 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AACCAATATATTTGACAAGAGTCTAGACACCATTATCTCTATAAATAGGAGGAGCCTCTAGGGGGTGAAGCATCAAATCTTCAAGCCAAAAAATTGAGTA ACATGGAGAGTTGAGTTTTACAAAGTTGTGTGTGTTATCTTTTCTTGTAACTCTTGAGTGGGGTACTTGGGTTTGTAGGTGGCACACATCTCGGGGTGAG TTTTCATTCAGGAAATATGCAATTTTCATGAACCATCCTTTTACATGATATTTCAAGGATACGTTTTAAAAAGAAATTTTTGAATTTAATGTTTTGCTTT TCTCATATAAATTCTTAATCTGACACCTTGAATGGGATTAAACCCAGAGAAATTTAAATTAATTTGAGTTTACAACAATCAATTTCTCCCAATTTTTTGT TTCCCTAGTTGGTTTTATTACATTGACCTCAATTGTTGCACCAAGACATTCTTCAATTGAAACAAACGTCTTCCAAAATAGCTATTTTAGATGTGGCTAA TTTATCTTCAAATTTTAGTGAAGAAAAACTCTATGGTACTCAAGTATATGATCTCCTGAAATCAATGTCATTGATTTGTTTGATTCACAAAAAGGTGTGG GGCTCAAAGTGGAATGAAAGGGCATACTTCAGCACAAGAAAAGTGAAACTCGATCACGATTTTCTTTCCATGGCTGTCCTTGTTCAGGAAGTGGTAAATG CTGACTATGCTTTTGTCATTCACACAACTAATCCATCCTCCGGGGACTCATCAGAAATATATGCTGAGGTGGTTAAGGGACTTGGAGAAACACTGGTTGG AGCTTATCCAGGTCGTGCTTTGAGTTTTATCTGCAAAAAACATGATTTGAACTCCCCACAGGTCTTGGGTTATCCTAGTAAACCTATTGGCTTATTTATA AGAAGGTCGATTATTTTCCGATCTGATTCCAACGGTGAAGATCTAGAAGGTTATGCTGGTGCTGGCCTTTATGACAGTGTGCCCATGGATGAAGAGGACA AAGTGGTGCTTGATTACTCGTCCGACAAATTGATCATTGATGGTAATTTTCGGCAGTCGATCCTGTCAAGCATTGCTCGTGCAGGAAGTGCAATTGAAGA GTTGTATGGCTCTCCTCAGGACATTGAAGGTGTCATCAGGGATGGCAAAGTCTATGTTGTCCAGACCAGACCACAAATGTAAGCTTCTACACCTCGGCTA TGTTCATGCCGGTCCAGCATGGCTCTTCAATCGCGAGTGAGGTAGCTTCTGCTAGTTTGAGAGGGAACCTGCGAATTTCCAAATTAGATTTAATGGAAGT GATATAATATAGTAAAACAATAAATAACTTATAAGTGTAACACTGACTTATGTAAATCCAGAAAATCTGATATGCTATACTTTTTTTCCTACTACATATT ATATGTGATAATTGTTCTTCCAAGCATGATTCAATGTTTACTATCTGTTTTATTGTTAGGTTCAATAATGAGAGATTGAATTATCATTTCAATATTTATT TTTTCATTTAGAGTTCTAAATCGTGTATAACACTATAATAACGCAAGTTAATAACATTAGTGACTTAGTATAAAA BLAST |
Tissue | pods |
Gene name | LI_gene_194059; |
Additional information | details; |
PAB | abscising pods |
PNAB | non-abscising pods |
PS1 | seeds stages 1-3 |
PS2 | seeds stages 4-6 |
PS3 | seeds stages 7-8 |
PW1 | pods wall stages 1-3 |
PW2 | pods wall stages 4-6 |
PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_464851
Blastp | Alpha-glucan water dikinase, chloroplastic from Citrus with 69.08% of identity |
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Blastx | Alpha-glucan water dikinase, chloroplastic from Citrus with 69.08% of identity |
Eggnog | - |
Kegg | - |
CantataDB | - |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019423166.1) |
Pfam | - |
Rfam | - |
GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |