Id Trinity | TRINITY_DN52635_c0_g1_i11 |
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Name Transcript | Ll_transcript_465541 |
Sequence | ATTTTGATAGAGAAACAGAACAAAAACCCTTCTTTCTTTTCTCTCTCTCTCTTTAACTCGTTCACTTCAATTCAAACCAAACCAAATCTCGTAGCAACTC ATGCACTCGCAACACTGAAAACGCCACCGTTTTGTTTCGTCTCGTCATGGCTCTGGAACCTTACCTTCAGCTCCAGGACCTGGGATCCAAGCTCGACACT CTTCCTTCTTCCAAAGACGCTCTCATCACGCTCCTAAAGGTTTTTTTTTATTTTCGTAATTTTCATTTTTCTATGTTTCTTTAGGGTAGCTATATCCCTA GTTTATGTTAGACGAACTCATATTTGATAGATTAAGTTGTTTTGTATCATGCAATAACTGAATTTAGCTCAAAATGTGTTAATTAGGGTTATTGGACCTA TGTTTTTGTGTTTTTAAGTCCGTGTGGTTTGTAATTGAGGATTGTTGTTGACTTGTTGTAAATGGAGAAGATAAGTTAGCAGATTTACTCTGTTTTTGAA ATTGGCAGATTTACTCTGTTTGATGTGAAACTTTAACTAGTTTGAATCAATTTTGTGGAGAATATTTCCAGTTAGGTTAATTTGTGAAGGAATTTGTCAT GAAGGTGATTTAGGTTTGAATATGGTGTCATTGTCATGTTGGTATTATACTGTGATATGCAATTTTGCATGAGAGTGGAGGAAAAGAAGTGGAATTAAAG TTTTCTACCGATAAACTTGCAGCTGCAGCTGCTTACTTTTACTCTACTGTGTGATTTTTGAATGACTGAATCCCCTAATTCAATGAACCTAGAATTTGTT GAATGATATGTTATGGCATCATTGTTAGTGTTGATGGATTAGGGACCCTTTCAATTTCAAAATGCATTTTAGGTTGAAAGGGTTATTTCCTTGAGTTTTA 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AGGATGTTGAAGCATACAATAATATATACAGGCAGCTGCACTTGATACTATCACTGCTACTGCAAAGAGATGAAGATGTCAAGTTAGAAGTAGGTACCCA CAAAGAAAAGGAAGTCCTATCTACCATCACTGTTATCTTTCAAAGTATCAAGCACTCTGAAGATATGGTTGATGCATCAAAGTCGAAGAATTCTCATGCC ATATGTGACCTTGGGTTAGCAATCACCAAGCGACTTGTACAGAAGGATGTTGATTTGCAAGGATTGTCTTCTTCATTTTCTCTACCTCCTATACTATACA AAGCATGTGAGAAGGACGGCAACACTGTGGTAAGTGAGGTGACAACCTGGTTGGCTGATGAAAATGTCTTGGCTCACTTTGGATCACTTAAATTAGAAAT GGTTCCATCTCAATTAGCTGAGGATGATGCTTTAAGGGACAGTGAAAAGGATGGAAATGAAATTCCCCTCCGAAAAATTATGAAGAACATAAAATCTCGT AGAACCAAGGGCAAAAAAGTGAAAAAGAACAAGTCTATACCAGCTGAAACAAAAAAGACTGAAAATGATATCGACATCTTAAATATGGTCAGAGAAATTA ATTTGGATAACTTGGGGATGTCTGCTGATTTTGAATCCAGTAATGGTCATCAGCATTCTTTGAGGAAGAAGTTGCAGAAGGATCCAGTGTGTGCAACAAA TAAAAAAAGAAAAGGTGATGAAGAAACACCCTCTCCGGTGCCCAAACGTAAGCGTTCTTCCCTTACTCATGGAAAATTGAGATCAAGTAATACTCCAAAG GGTCCTCGAAAATTTTCTGTGGAAAAACCGTCTGGAGCAAAATCACTAGTGGATGAAGAAATTAACCCTGATACAGATATCAAAGC BLAST |
Tissue | pods |
Gene name | LI_gene_194317; |
Additional information | details; |
PAB | abscising pods |
PNAB | non-abscising pods |
PS1 | seeds stages 1-3 |
PS2 | seeds stages 4-6 |
PS3 | seeds stages 7-8 |
PW1 | pods wall stages 1-3 |
PW2 | pods wall stages 4-6 |
PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_465541
Blastp | Sister chromatid cohesion protein PDS5 homolog B from Gallus with 22.5% of identity |
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Blastx | Sister chromatid cohesion protein PDS5 homolog B from Gallus with 24.52% of identity |
Eggnog | PDS5, regulator of cohesion maintenance, homolog(ENOG410XQW7) |
Kegg | - |
CantataDB | - |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019425451.1) |
Pfam | - |
Rfam | - |
GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |