Id Trinity | TRINITY_DN52668_c1_g1_i5 |
---|---|
Name Transcript | Ll_transcript_463553 |
Sequence | AATTGAACAAAAGAAAATGCACACAACAAAATAATAACTGTTGAGAAAGGGAGAAGAGTGAGAAACACACTCAATTCACTTGCTTTCTCTCCATTACTAC TTTCACTCTCTTTTTGTCTCTGTTGCTCCGTTCCATTTCACGTTATTGCTTTCGTTCACTCACGTGATTTATATTGCCTCAATTTTCCGGATCAGTTTGT TAATATTAAGATGTGGTGTTGTTGCTGGTAGTTAGAAGCAGAGGAAAGTTCTGCCGCATTTGCATCTCGACAAGTCTCAGGCATCCTACACGGAGGATAA ATTGGCGTGTTGATGAAAATGTCCAAGTCTCCCTCTTCTCCTGAACAATGGCCGTCCATTTCTTCTAATCTTTCTCAGCCTAGGGAATTTAATGAGGCAA CAGGAATGGACGACCCAGAATCTACAATGGCGACAGTTGCTAATTTTGTAGAGCAGTTGCATACCAACTTGTCATCGGCACTTGAGAAAGAAATTATTAC TCAACGCTTGCTAGGTATTGCCAGGGAAAGAAAGGATGCTAGAACACTTATTGGTTCTCATACCCAAGCCATGCCGTTGTTCATAAACATTCTCAGAAAT GGGACTCCTCTTGCAAAAGTTAATGTTGCTGCCACTCTCAGTGTCCTGTGCAAAGATGAAGAACTAAGATTAAAAGTACTTCTTGGTGGTTGTATCCCAC CTTTACTGTCACTCTTAAAATATGAATCCACTGATGCCAGGAAGGCAGCAGCTGAAGCAATATATGACGTTTCCTCTGATGGTCTTTCACATGATCATGT TGGTATGAAGATTTTTGTTACAGAAGGTGTAGTTCCAACCTTATGGAATCAATTAAATCCAAATAAAAAGCAAGATAAAGTTGTGGAGGGTTTTATTACT GGAGCATTAAGAAATCTGTGTGGTGACAAAGATGGCTACTGGAAAGCAACATTAGAAGCTGGAGGTGTGGATATTATTGTGGGTCTCTTGTACTCGGACA ATGCTGTTTCTCAGTCAAATGCAGCTTCTCTATTGGCACGTTTAATGCTGGCTTTCAGTGATAGCATCCCCAAAGTAATAGACTCTGGAGCAATCAAAGC TTTACTTCAGCTTGTTGGTCAGGAAAATCATATTTCTGTACGAGCTAGTGCTGCTGATGCCCTACAGGCCCTATCTTCAAAGTCAACTAAGGCCAAGGAA GCTATTGTTAGTGAAGATGGTCTACCGATACTTATTGGAGCTATAGTTGCTCCTTCTAAAGAGTGTATGCAAGGTGATGGTGGCCAGGCTCTGCAGGAGC ATGCAACTAGAGCATTATCCAATATCCGTGGTGGGATGTCTGCTTTAATACTATATCTTGGAAAACTTTCCTATTCTCCTCGCCTTTCTGTGCCAGTTGG TGATATAATTGGTGCTCTTGCTTATACACTCATGGTCTATGAGGAAAAAGTTGATGCTGACGTGGAACACTTGAATGCAACTAAGATAGAGGATACTCTA GTAACACTTTTAAAGCCTCAAGACAATATGCTGATTCAAGAACGTATCCTCGAGGCTATGGCTAGCCTATATGGTAACGTATGTCTCTCGAAGTGGCTCA ATCAGGCAGATTCAAAGAAGGTCCTTATTGGACTTATAACCATGGCTGCCACTGATGTGCAAGAATATCTTATACTTTCATTGACAAGCTTGTGTTGTGA TGGGGTAGGAATATGGGAGGCTATAAAAAAGAGAGAAGGTATCCAATTACTTATATCATTGCTGGGATTATCTAGTGAGCAGCATCAAGAGTACTCAGTT CAGTTGCTAGCAATCTTAACTCACCAGGTCGATGACAGCAAGTGGGCAATCACTGCTGCTGGAGGGATTCCACCATTGGTGCAGCTGTTGGAGACAGGAT CACAGAAAGCAAAAGAAGAAGCAGCTAATATCCTGTGGAGTTTGTGTTGTCACAGTGAAGATATTTGTGCATGTGTTGAAAGTGCTGGGGCCATCCCGGC ATTTTTGTGGCTGCTTAAGAGTGGTGGACCAAAAGGACAAGAAGCATCTTCTATGGCACTCACAAAGCTTGTCAGGTTAGCTGATTCTGCCACAATTAAT CAGCTATTAGCATTGCTTCTAGGGGAGTCTCCAAGCTCGAAGGCCCATATAATCCGAGTTTTAGGTCATGTACTTACCTTGTCTTCAGAAAACGATCTCC TGCAAAAGGGTTCTGCAGCTAATAAAGGCTTGAGATCTCTTGTCCAGGTTCTCAATTCATTGAATGAGGAAACCCAAGAGTATGCAGCCTCAGTCCTAGC TGATTTATTTATCATCAGACAAGACATTTGTGACAGCCTTGCAACTGACGAGGTTGTGCTTCCTTGCATGAAGCTTCTGACCAGCAAAACTCAAGCCGTT GCCACTCAGTCAGCTCGAGTGTTAAGTGCTTTGTCCCATCCAACTAAAAACAAAGCTGCAAATAAGATGTCTTATATTTTAGAGGGGGACATCAACCCAC TAATCAAGTTGGCTAAAACATCCTCTGTTGATGCTGCTGAAACTGCCGTTGCTGCATTGGCCAATCTTCTCTTTGATCCTTTTATTGCTGCCGAGGCTCT GGCTGAGGATGTCGTTTCAGCTATAACACGAGTTCTAGCAGAAGGAACCTTAGAAGGTAAGCAAAATGCATCTCGTGCGCTCCATCAATTATTGAAGCAT TTTGCTTTAGGTGAAATTCTCAAGGGGAATGCACAATGCCATTTCACTGTGCTTGCACTTGTTGATTCCTTAAGAGTCATGGATATGGATGGAACTGATA CTGCAAATGCTTTAGATGTAATTTCTTTGCTAGCAAGGACTAAACAGGGTGTCAACTTTACTTACCCTCCATGGTCGGTTCTAGCCGAATCGCCATCAAG CTTTGAACCCCTTATTCGCTGCCTCTCTGAGGGGCCTCCCCATGTTCAGGACAAGGCAATTGAAGTTCTGTCTAGGCTTTGTAGAGATCAGCCTGTTGTA CTTGGTGATTTGTTATCTGCTAGTTCTAGATCCATTGGTTCATTAGCTACAAGAATAATGAACTCCTCCAGTTTAGAAGTAAAAGTTGGAGGTGTTGCCT TACTAATTTGTGCTGCAAAGGAAAAGAAAGAGCTGTCAATGGATTCACTTGATGCTTCTGGGTTGCTAAAACCATTAATATGTTCTTTAGTTGATATGCT GAAACATAATTCTAGCCGCTCTTCATTAGAAATTGAAGTTCACCCTCCTAGCGGTTTTATGGAGAGAAATGCATTTCAAGAATTTGATGAATTTGATATT ATGGACCCAGCTATGGTGTTGGGAAGTAATGTAGCCTTGTGGTTGCTCTCAATTATTGCTTCTCTCCATATAAACAACAAACTTGAAATTATGGAAGCTG GTGGTCTCGAAGCTCTCTCTGACAAACTTGCAAGACACACTTCAAATCCACAGGCGGAATATGAGGATACAGAAGGAATATGGATCAGTGCTTTGCTCTT GGCCATATTATTTCAAGATGCAAGCATTGTTCTATCTCCTGCTACAATGCACATCATATCTTCTCTCACTCTTCTGCTAAGATCAGATGAAATGATTGAT AAGTATTTTGCTGCCCAGGCTATGGCTAGTCTTGTTTGTAATGGTAATAAGGGAATAGATCTTGCCATTGCAAATTCCGGTGCTATTGCTGGGTTGATAA CTATTATTGGGCATATAGAGTCAGATATGTCAAACTTGACAGGTTTATCAGGGGAATTCTCTCTTGTAAAAAACCCTGATCAAGTTGTCTTAGATCATCT TTTCGAAATTGAAGATGTAAGAGTGGGATCTACTGCAAGGAAATCAATACCACTGTTGGTGGATCTCTTGAGACCAATAGCAGAAAGGCCTAGTGCTCCA CCAGTAGCTGTCAGACTCTTGATATCCATTGCAAATGGAAGTGACACAAATAAATTAATTTTGGCTGAAGCTGGAGCTCTTGAAGCTTTGAACAAGTACC TGTCCTTGAGCCCTCAAGAATCAACTGAGGCTGCTATTTCTGAGTTATTGAGAATATTATTTTGCAATTCTGATCTTCTTAAACATGAAGCATCAACAAG TTCGTTAAACCAACTCATGGCTGTTTTGCGCCTTGGATCAAGAAATGGTAGATATCATGCAGCAAGAGCACTTCATGAGCTTTTCAATGCTGAGAGCATT AGGGACTCTGAGTTAGCTAAACAGGCCATTCAGCCGTTGGTTGACATGCTTAATACACCATCAGGGAGTGAGCAGGAGGCTGCTCTCATGGCCTTGATCA AGTTAACCTCCGATAATTCTTCAAAAGCATCTCTTTTTACTTATGTGGAAGGCAACCCACTAGAAAGTTTATACAAAATATTGTCTTCTACTGCTTCATC CTTGGAACTGAAGAGCCATGCTGCACAACTCTGCTTTGCTCTTTTTGGTAATAGCAAGATCAGGGCAGATCCAATTGCCACGGAATGCCTAGAACCTCTT ATATCACTGGTGCAATCTGATTCTGGGACAGCAATTCAATATGGGGTTTGTGCTTTTGAGAGATTGTTGGAAGATGAACAACAGATAGAGCTAGCAGCAG CCTATAATGTTGTGGATCTCCTTGTCAGCTTAGTTTCTGGTACAAACTACCAGCTTGTTGAGGCTACCATATCTGCTCTCATCAAATTGGGCAAAGACAG AACTCCTAGCAAACTAGACATGGTCAAAGCTGGCATTATTAATAATTGTCTAAAGCTACTCCAATCAGCTCCTAGCTCATTATGCTCCACAATTGCGGAG CTGTTTCGCATTTTAACTAATAGTAATGCAATTGCTAGAGGTTCAGATGCTGCAGAAATTGTAGAACCTCTTTTCCATGTTTTGCTTCGTCGAGATTTCA ACTTATGGGGACAACATAGTGCCTTACAAGCACTAGTGAATATATTGGAGAAGCCACAGAGTCTTGCAACCTTAAATCTTACTCCTAGCCAAATTATTGA ACCATTGATTTCATTTCTGGAATCCCCATCCCAAGCTATTCAGCAGCTTGGCACAGAACTTTTATCTCATCTTCTTGCACAAGAACATTTTCAGCAAGAT ATTACAACAAAGAATGCAGTTGTGCCTCTTGTAAAACTATCAGGAATTGGAATATTAAACTTACAGCAAACAGCAATAAAAGCATTGGAAAAAATTTCCA AGAGCTGGCCGAAGGCAGTTGCTGATGCAGGAGGTATTTTTGAGCTTGCAAAGGTTATTATTCAAGATGACCCTCAGCCACCACATGCACTCTGGGAATC AGCTGCTTTAGTTCTCTCTAATGTATTACGTTCCAATGCTGATTACTATTTTAAAGTTCCTGTGTTGGTTCTTGTTAAACTGTTGCTCTCAACATGTGAC AGTACAATTACCATAGCCCTTGATGCTTTAACAGTTCATGAAAGAAGTGACGCTACAAGTGCTGAACAGATGGTGGAAGCTGGAGCTATAGATACACTGT TGGAGCTTTTAAGATCTCATCATTGTGAAGAAGCATCTGCTAGATTACTTGAAGCTTTATTTAACAATGTGAGAGTACGAGAGATGAAGGTATCTAAGTA TGCTATAGCGCCTTTATCACAGTATCTGTTAGACCCACAAACCAGATCACAGCCTGGCAAGCTTCTTGCTGCTTTAGCCCTGGGAAATATTTCCCAGAAC GAGGGACATGCTCGATATAGTGAGTCTGTTTCTGCATGTCGCGCATTAATAAGTTTACTTGAAGATCAATCAGCTGAAGAAATGAAGATGGTGGCTGTAT GTGCATTGCAAAACTTTGTCATGAACAGCAGGACCAATAGACGAGCTGTTGCAGAAGCTGGGGGTATACTGGTGATCCAGGAATTGCTACTGTCTCCAAA TACTGAAGTTGCTGGACAAGCAGCACTACTGATCAAATTTTTGTTTTCTACCCACACACTGCAAGAATACGTGTCAAATGAGCTGATCAGATCCTTGACA GGTGCACTGGGAAGAGAGTTGTGGTCGACTGCCACTATAAATGAAGAGGTTTTGAAAACTCTGCATGTGATATTCATGAACTTCCCTAAGCTCCACATAT CTGAAGCAGCAACCCTTTGCATTCCTCATTTGGTAGGGGCACTTAAATCTGGTGGTGAAGTGGCTCAGGACTCTGTGCTAGACACCTTTTTCCTGCTAAG ACAATCTTGGTCAACTATGCCAATAGATATAGCAAAGTCTCAAGCTATGGTTGCTGCTGAAGCCATCCCCATCTTGCAAATGCTCATGAAAACCTGCCCA CCAAGCTTTCATGAGAGAGCAGATGCTCTTTTGCACTGCTTACCGGGTTGCTTGACTGTCACCATTAAGCGTGGAAACAACCTCAAGCAAACTATGGGAA GCACAAATGCATTTTGCCGATTGACAATAGGCAATGGTCCTCCAAAACAAACTAAGGTAGTGAGTCATAGTACTTCTCCAGAATGGAAAGAAGGGTTCAC ATGGGCATTTGATGTACCTCCAAAGGGCCAAAAGCTCCATATCATATGCAAAAGCAAGAATACTTTTGGCAAGTCAACTCTTGGAAGAGTCACTATTCAA ATTGATAAAGTTGTGACAGAAGGGGTTTATAGTGGATTATTCAGCCTTAATCATGATGGAAACAAAGATGGTTCTTCCCGGACTCTTGAAATTGAGATTA TATGGTCCAACAGGATTTCTAATGATGATATTTGAATTAGCTATTTTTAGTGCTGGAAGCACGCATATTAATCTGCAGTGTGTGCAATATGGTGCAAATG GTTTTTGCTTGTAATTATTAGCATATTTGGAAGATCAAATTTTGTAGCCTGGCATATAAAGTTGGTTCAATTGAAGGTGTAAATTAAATTACAAATGTCC AGAGGAAAGCGTTTGAAAAGGAGGCATGAATATCCCACGGTAAAAAGCTGGGTAGAATTGTACAGGTCAGTAGTCAGTAGGAATTAGAAATATGAATGGT ATGAACAAATGGCATTTGAATTAAATTTATGTCAAAAGCATTAATTTTTTTCTTAGCTGCTAATATTGATGTTCACTAGCTTCTGATATTGGATGTCATT TTCTACTAGTGTTGGAAACATTCTTTTCTTTTATCAACATCACATGCCATCAAAATGCGGTATTTCTTCCATTTTACTTGATTATTCAGGGTAATGTTGT GGGGTTCAGATCCCATTACACTTTTACTGACCATGCAGAATTTCAGCTACAACGTATCTGCATTGAGAGTTTGAGACCTTGCAGCATAGTGATACATATC CTTGAGACCTATAACATTGGCACAGTGCCACTCATAAACATGAGTGAATATCAGGCAATACCACCCTGTTGATTAAATGTTAGTTATTTAGCAGGTGCAG ATCTATCATGTGTGAAGGAAGTGATAACTGAATTAAGGTGAAGTTTGTCATAGCACCCAAAACTCAATTATACCTGGAAGAAGATATGAAATTCCATTCT TGTAAACTGCATTGGGGGAAAAACTGGGGCAGAGGCAGGAAGGGACAACCTACATAGAAGTCATATTCATAAATAAATAGAGCCTCACATTAAAGATCTG TTACCATGGAACATGTACCTAGCAGCAGCATGAAAATGACAACATAAGTAGGTAGAAGAGCACAACAATGGCGATTTTGGATAATCATCCTCAAGGAGAA AACAGTGCCATCGGTGTAGAACTATATGAATGTATCATTGAAGTGACTTAAGTATCATAAATCATAATGCTTGCAGCTCCCACTATCAAACATAAGTTCA AGACCCTTAACATCAGTAGCTTTTCCATTGAGAAACAATTCAGCTTTTAGTGCATTGTATTATTTTCTGATTCGATGGTTTTGTATAAGTTGGCCTGAGT GGCAATAGATGGTACATGCTGAAGCAAGAACAAGTCAGAAGGAAACAAGTAACATTAATTTGCCAAGAAACTTAGTATTAGATGCTTAGGCTCAAGTAAG TATACTTTTGTTATAATGTCAGCTGTGTTAACTTGACTTCATCAATGTAGCTGGTCTTTCGTCTCTATAAATAGAAATACTCTCCTATTGCTATTCTTAT TCCAAATâBLAST |
Tissue | pods |
Gene name | LI_gene_194556; |
Additional information | details; |
PAB | abscising pods |
PNAB | non-abscising pods |
PS1 | seeds stages 1-3 |
PS2 | seeds stages 4-6 |
PS3 | seeds stages 7-8 |
PW1 | pods wall stages 1-3 |
PW2 | pods wall stages 4-6 |
PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_463553
Blastp | Protein CELLULOSE SYNTHASE INTERACTIVE 3 from Arabidopsis with 67.63% of identity |
---|---|
Blastx | Protein CELLULOSE SYNTHASE INTERACTIVE 3 from Arabidopsis with 67.63% of identity |
Eggnog | U-box domain-containing protein(ENOG410XRTN) |
Kegg | Link to kegg annotations (AT1G77460) |
CantataDB | - |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019455634.1) |
Pfam | Armadillo/beta-catenin-like repeat (PF00514.22) |
Rfam | - |
GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |