Ll_transcript_481193

• Id Trinity: TRINITY_DN52722_c0_g2_i14
• Name Transcript: Ll_transcript_481193
• Sequence: GAGATAGAAGAGACAAACATATTCGAGCTTGTTCAATTCTAATTCAAACTCCAACATTAACAAGACATGTGGGTCCATGCACGACACGTGGCACTACCAA ATCCATAGTCTTGAACATGCAGCAACAACATAATCGGTACCGTCTCTGACACGGGAATGAATTTCTCTCATCAATGGTTGTGTGAGAAAGAAAGCAGGCA CCCACTGTGAATACAAATTAAGTAACATTCCTTTGATTTGCTCCACATCCTAATCATCAATTCTAGAAAAATTCAATGATTTAAATTAATAAATGAATCT AAACCATTTGATTCCCAAAAAATTAATGGTTAAGATAAAAAGTAATTCTTTTAGACTTTATCCTGAAGTAACTTGATCCACACCCCTGGGTATATATCCC TTATCTCTTGTAATATAGTGAAACCTTTCATTCATTTCCATATTTTTTAACTTACCATTCATTATTCTGTTACATTACTCGACATAGGTAATAAGCGCTT CATTATTTTATTTTTATTTGTGCTGAGTAATTAGCTCGTGTTAGAGTTACATAAATTTAGCTGAGTGTGGTTGGATTTATTGACTTATTCAGCATGTTTG CATTAAAATATTTTATTATGACCAGTTTGGTGTGATTTTGTTGCTCAATAGCTTTCATCAAACCCTTTACTTTCCGTGAGTTTCAAGTCACCCAAATTTA ATTTTTTTTATCATTCTGTTCATTCTTAATTTTTGAAGTTTTTTTGTCACCCAATTCAGTTTGGTGAGAAAATTTTCAATCTTTAGATCTGATTTTTTTT GGGTCTATTTAAACGTGTCTATGATCATGGAGTATTCGATCAGAAGAGTAGCTTGTGATACTCAGGGTCATTATTCCACTGTCCTTTTCTTCTTCTGCTA TCTCTGGCAGTTGTCATTTTCTGTATCTTGCTTCTTAATTTGATAGATCTGAAGTGAATTTAATTTCAGAAGTGTTTGCAATGGCAGCCAATTCTTCTAA TGGAGATAATGCAGCATCAAAGCAACCTCCTTTGCCATCTCCTTTGCGTTTTTCCAAATTCTTCCAGGTCAATTGTCTCATATTTTATTTTATTGGCAAA AATGCACTTTTTGTATGGTAGTTTTGTATCATTTTGCTCCCTTGTTTTTTGGTTATCTCAGACAAAAAAAAAGGTAGATCTTTGTTGATGGTGTAAACTG TAACGGGTTTTTTGGGTCAATCACATTATATCATAATATGATATGATTTCACAGTTCTGTACTTCTGTTGTAAGATTTGAATTTTTATTTTTGTTTTATC CATCTCTTGAATGGTGATCATAATAAATGTAGTTAATAAGTTATTATTTTTTTCAAGTTTGTTCTTAGCACTTTAAGACAGTACACTAGTACAGTTTACT AGTACACAGAACACAATCACCTCAAACTTCATAAATTGAACCATAAAGAGCTTACTCCTCAGAATATGACTAGGTGCGAAATGTTTTACACCACGAATCT TATAAGACAGAGGGAGTGATAAGTTTTGATTGGAAGTTATCCCTTTAATTTTTTGGTATGCTGATACTTAAATCGGTTAATCTTCAAAAGTTTTTACCAT TTATCTTGTCTCTTGCATACCTATGCTTTAAAAGTGTGTGCATTTGGGGACATATGTGTGTCTTACTTCTGTTGATTGGAAATTTGTCAAGTGATTTTGA ATACACAACCGGACTTTTGTCAGAATCGCTTAGTTTACAAATTTATCGTTTTTATTTCATTTTGATGCCTTGTTTCACCAATGTTTCTTTTATTACTAAC AACAGTCCAACATGAGAATCTTGGTTACTGGAGGAGCTGGATTTATTGGTTCTCACCTAGTCGATAGATTGATGGAAAATGAAAAGAATGAGGTCATTGT TGCTGACAACTACTTCACCGGGTCGAAGGACAACCTCAAAAAATGGATCGGACATCCAAGATTTGAGCTTATCCGTCATGGTATAATTACGTCCTTGTTA AAACTGTTATGCATGCTATATAATGGAGTTTTTATTTTTGCAGGAGGTCTCATTTGGTAGTATGTTGAAGTCTAAACACTTATGTCTAGATTGTTAACTA ATTTCTGTTACCTTAAAAGACTGAAACTGTTGAGTTGTTACAACTTGAACCACAAATTGAAGTTATTGATATATTAGCTGTTTTTTAATCAACCACAATC TGAATAGCTGGCTGTATGTTGTTTTGGTCAAGAAAAACTAACAATGAAGCTGTAGTGTGACATCTTATATTCAGCATTGCCTTTAAATCTGAGTAATTGC ATAGATCGTGCTGCTGATACACATTATCATTCCGACCCCTTTATAGATGTCACTGAGCCTTTGTTGATTGAGGTTGATCAGATCTACCATCTTGCATGCC CTGCTTCTCCCATTTTCTACAAATATAATCCTGTGAAGGTATAGTTCTTGGTCTTATTTTCATCATTTATCTTTTACTTGAAGTGTAAGCATTCATTTCA AGTTTCAACTGTTGAAAACTTCGCTTTCACTGTTCATTGCTTTGTATCTACTTATGCCACATGCCATTGCTTAAAAGATATCTCTTTCTACCGAACCTCG AGAGATTGTCTAATGTGTATGGAAATAACAATTTTTCAGACAATAAAGACAAATGTGATTGGCACACTGAACATGCTTGGGCTTGCTAAACGAGTTGGAG CAAGGATTTTGCTTACATCAACTTCTGAGGTATATGGGGATCCTCTTATCCATCCCCAACCTGAAAGCTATTGGGGCAATGTTAACCCTATTGGAGTTCG TAGCTGCTATGATGAAGGGAAGCGTGTGGCTGAGACTCTGATGTTTGATTATCATAGGCAGCACGGGCTAGGTTCTTGTCTTCCTTTCCTCATAATTGTG TCTCATTTCATTCATTGTAAGGTACAGCTGGTAGATTTTGTCTCTGAATTTAACTGACTTGTTTAGTTGTCTATTTCTTTCCAATATAGAAATTCGCATT GCAAGAATCTTCAACACATATGGACCACGCATGAATATCGATGATGGCCGTGTTGTCAGCAA
• Tissue: pods
• Gene name: LI_gene_195025;
• Additional information: details;

Expression of Ll_transcript_481193

FPKM

• PAB: 0.3
• PNAB: 2
• PS1: 3.4
• PS2: 2
• PS3: 2.5
• PW1: 1.3
• PW2: 4.7
• PW3: 5.1

Labels

• PAB: abscising pods
• PNAB: non-abscising pods
• PS1: seeds stages 1-3
• PS2: seeds stages 4-6
• PS3: seeds stages 7-8
• PW1: pods wall stages 1-3
• PW2: pods wall stages 4-6
• PW3: pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_481193

• Blastp: UDP-glucuronic acid decarboxylase 3 from Arabidopsis with 97.44% of identity
• Blastx: UDP-glucuronic acid decarboxylase 5 from Arabidopsis with 97.44% of identity
• Eggnog: Nad-dependent epimerase dehydratase(COG0451)
• Kegg: Link to kegg annotations (AT5G59290)
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_004487020.1)
• Pfam: GDP-mannose 4,6 dehydratase (PF16363.4)
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;
  Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;