| Id Trinity | TRINITY_DN52780_c1_g3_i1 |
|---|---|
| Name Transcript | Ll_transcript_478960 |
| Sequence | TATAGTACTAAATTACTAATAAAAAAAGAAACCTTTGAAGAACCAACAAAAAAAGTGAAGAATGAAGAGTCATGGGTTTTGTCTCTTATTATTGTTTTAT TATTTAATATTTGACGAAATAATAATATATATAGTACTAAATTACTAATAAAGAAAGGATATTTCAATTATGTGATTGAATTCAACACTTCACCCCCACC ACCTTCCTTTGCTTTCTCTCTTTCCAATGGCGCCCCTTGTATTTACACTTCACCTCCAACATAGAATCTAGTTCTCTTTTCTTTTCTTCTTGCTCAAGTT TTCTGAGATTTGGTTTGGTTTCTGTGTTCTTTTGACTTTCTGAAGAAAGATGAGCTGGCGCAGGGTTTTGAAATCGGCACAGGCTCTTCTTGCTCACACC TTTCTCCTTTGCTTCACTCTCTTCCTTGTTCTTAAGCTTGATCACTATGTCTTCTGCTCTTGGTGGTTAATATTTTTACCTGTTTGGATGTTTCATGCCG TTGTGGCTCGAGGAAGGTTTTCATTACCGGCACCATCAGCTCCACGTAATCGACATGTATGTCATTGTCATTCTTACTGAAATTTGAGATAATTTCTTTT GAGTTTCTGTAGTTGTTTTGAATTCTGCATTACTTGGCTACATAACCATGTGCGTGTGAATTGCTCACTGGCTATCATTGGTCTGTAAAATCTTAAAATA ATGACATTGGCTCCTTGGTCTCTCACTTAACTTTTATAAACTATTATTATTATTATTATTATTATTATCAAGTGTAAATTTTAGGCATGTCAATTATTAT GGTGAGGAAATAAGATACTAATTTTCTGTGTTGACAGTGGGCACCATGCCACGCTGTCGTTGCAACGCCATTGATTATTGCATTTGAATCGCTCCTTTGT ATATATCTCGAGAGCTTATATGGTACATCACAATTCTCTACCTTTGCCGTTGTATAATTAGGGACTTCCAAGTATTTTCATCCATTAAATGAATATTCCA GTTGTCTGACATAAAAAACGTATTAGAAGAATTTTATTTCTTTTGTGCAAGTTCTGCAACTATACAGTAATGCACTTGTTATTTGTTACTGCACAGTTGA TGGTTATGCAGCAGTCAGTCTGAAGCTTGTGTTCCTTCCCTTACTATTATTTGAAATCCTTATTCTCATTGACAATTTCAGGTAACTTCTTTAGGATAGT TTCCGTAAACCTTAGTTTCATTTGGTCTGTTCTTGTGTTAGGCAAATCAATGTTTATATGAGAAACCATATGAATTCTTTGCACCTATCAGACTAGATGC TTTGTAAGTCTCTTTATTTTTCAGTCTTTCTTTTCTTCTTGGAAGTTTTTAAATATCGATTGTTGATCATACCATCCAGTTTATGTTATGCTTTGCATTT GAAGAATAGAGTGTGAAACCCTTCAACGTAATTCATTGGTGTTAGCTCATATTTCATCAAATATTTCTCAGCCATTTGTAACCAACAAACCAACTAATGT TTTCCGTGCAGAATGTGCAAGGCTCTCATGCCAGGGGATGAAGGAAACTTGAGTGATGAGGCAATATGGGAAACTCTTCCTCACTTTTGGGTTGCAATCT CTATGGTCTTCTTCATTGCTGCTACAGTCTTCACACTCTTAAAACTGAGTGGTAACAGTATTTCTTCTTAAGTTTAATAGATAGATTTTATCATTTATTC TTTATCAGTTCCTTTGTTATTATTTTTTAATGAGAGGGGATCCACTTACTCTAGGAGTAAATTAAAAAACCTACTACACATCTTAACCATCAATTCTAGG AAAATCTAACGATTTGAATTAGTTAGTAGATTTGAACCCTTTTTTAATTGATATTGTATCATGTGGTCCCTTGTGGAATATTTTTACGTACTTCCATTGT AAAGGTGAAACAGTGTATGTTTTATCTATACATTATAATTAATTGTGAACGCCTTTTAATTTACGGAAATATATATGTACGTGTACCTACTACTTTAAAC TGGATTTTTACATATTTGATACAAGTACAAGCTCGGAATGATCCTACTCGAGTATGAATATTTGACCCTTTTGTAATTTTTGATAACATCGAAGTATCGA CTGATGCATTATGATTTCTTATGCTTTTTATTATGACGTTATTTTATATTCATATGTTCATCTTTCTGTAAGCGTGACTTCGTTTTTCTTAGCTTTTACA GGTGACGTTGCTTTGGGATGGTGGGACTTGTTTATTAACTTTGCTATTGCCCAGTGCTTTGCTTTTCTTGTATGTACGAAGTGGTCTAATCCAGTCATTC ATAGAAATTCTAGAGTACCCAGTTCATCTTCTACTACGATTAGAAATCTTGAGTGGAACAGTGGTTTAGTGGTTTCTTCCGAGGAAAGTGAACATGAAAA CAGAGTGTGCAGCCTGCAAGACATAGGAGGTCATTTCATGAAAGTACCAGTTATTGTATTCCAGATTCTTCTTTGTATGTATCTAGAGGGAACACCTGCT TCTGCTGTATATATACCTCTTCCGGCTCTTTTCTCTCCTATTTTCATACTACAAGGCGCTGGTGTATTGTTATCTCTCTCCAAGTTGGTGGAGAAACTTG TACTGCTATTACGTAGTGGAGCTGGTGGAGGAATGTATTTTAGATTTTCTTCAAGAGTTCATGATTGTTTGGGGTTCTTGCGCCATGGTTCTAGGTTATT AGGTTGGTGGTCAATTGATGAAGGAAGTCGGGAAGAACAGGCATGCTTATACCAAGCGGGAGCATCTGGGTATAATACATTCTCTGGTTATCCTCCTGAG ATTGTCAAGAAAATGCCTAAAAAGGATCTTGCTGAGGAGGTAATGGCAATTCTTATGATGTATGCAGACATAAATTTATGGTGGAGTATATTCATGTACA TGCATATAGATGGATACGGACGTGTATAGTACAGTTGAAATAGTCTGTCCAGGTTTTAGTTTATGCTCATTTGTTCAATGTGCAAAAATTGTCAATACGT CAATAACTCCGATTTCCTTCTTTAAAATTTTACAATGTCAGGTTTGGAGACTCCAGGCAGCTCTTGGCGAGCAGGCAGAAATTACGAAATACAGTCAACA GCAATATGAAAGGCTTCAAAATGTAAAACTTTTAATACTTACGAGTGCTGTATATTTTCCCAAGTTTCTTATATGATGTGTGAAGAAGCCTATATTTAAA ATGTTTGCATGGTAAGCGGTATCATTTTTTATAATGATCTTTATATTTGAAATCTCTGTAAGTGTCATCAATTGCATAAACACTACATTACTGCTGAAGT CATGTTTTACCCATCTTATGCCTCAGACCTTCAGTCTTAATATTGGGAAACAAAGTTTGTCATTAATTTGAAGCTAGTGGAGATATATGACTAGGTTGAT GATTGCAATAAAATGAAGTTGCACTGTATACATGAATGTTGTTTACTGCTTTATCAAGTTTCATTTTTCTAACTTTTATGCCCATACCTATTTTGAATGT ACCAGGAGAAAGTGTTATGCAGAGTTTGTTTTGAGGGAGAAATTAGTGTTGTATTGCTGCCATGTAGGCATCGCGTCCTTTGCAGGTAAAGATCAAATAT GTGATAAAACTTGGGCCTTGGGCCTTGTAGGATGAGGGAGTAATCCCTTTTGGGATACTGCAGCTGCCTCACCCAGGGATTAAACTTCGGCCTTGGGCCT TGTAGGATACCTGGCCCAACCATCAACTCCGCGCCGGTGATGAATGAATCTTGTTTTATGGCATTGTGCGTATAGTTTGGCCTTATGCTTGTTTTGCAAT CAATTGCAGTGCTTGCTCAGAAAAGTGTAGTAGGTGCCCAATTTGCCGAGTCTCCATCGCAGAGCGCCTGCTTGTATATGATGTTTAGTTGTTAACCTGG CCAACTTTGTTTAAATGAAAGTGACTACAGTTGATAGGGAAAAAATACACATCAAAAGATGGAAGAATGGAGCATATGATTTTGACTTTGCTTTTTCACA CCCTTTAGATATTTGTATATATAATTTCCTATATTTTTCCATGCTATAAATGGTTGTGACCAGTATAATGAATTGTAGTCATCACCCTCTCTTTTTTCCA CTCTGGGTTTGCAACTATTATTTATAAAGAGCTAACAACTAACAACTTTGCAGCTTAATGGAATTTGAAGTGGATACTCATGCATGAGGTGGACTCTATT ATACTTCCCATTGGTAGTTTCACACTGTTATTTGCAAATCACTTAATCACCTTGCACCATCCATGGTTTAGTAATTATGGGAGATGAAGAAATGATGTGA GATTAACACAAGTCTCAGATGAACTAAATACAACCACTATGAAAATCATTCAAGGTGGGGTAAGGTTAATCCATTATGTATTCAATACATGTGATTTACA CAATGTAAAATAACAGTGCAAAGGGATGTCCTGAAAAGATTCAAAC BLAST |
| Tissue | pods |
| Gene name | LI_gene_195536; |
| Additional information | details; |
| PAB | abscising pods |
| PNAB | non-abscising pods |
| PS1 | seeds stages 1-3 |
| PS2 | seeds stages 4-6 |
| PS3 | seeds stages 7-8 |
| PW1 | pods wall stages 1-3 |
| PW2 | pods wall stages 4-6 |
| PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_478960
| Blastp | - |
|---|---|
| Blastx | - |
| Eggnog | - |
| Kegg | - |
| CantataDB | - |
| Mirbase | - |
| Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019463321.1) |
| Pfam | Transmembrane Fragile-X-F protein (PF10269.8) |
| Rfam | - |
| GO | - |