| Id Trinity | TRINITY_DN52780_c1_g3_i5 |
|---|---|
| Name Transcript | Ll_transcript_478968 |
| Sequence | TATAGTACTAAATTACTAATAAAAAAAGAAACCTTTGAAGAACCAACAAAAAAAGTGAAGAATGAAGAGTCATGGGTTTTGTCTCTTATTATTGTTTTAT TATTTAATATTTGACGAAATAATAATATATATAGTACTAAATTACTAATAAAGAAAGGATATTTCAATTATGTGATTGAATTCAACACTTCACCCCCACC ACCTTCCTTTGCTTTCTCTCTTTCCAATGGCGCCCCTTGTATTTACACTTCACCTCCAACATAGAATCTAGTTCTCTTTTCTTTTCTTCTTGCTCAAGTT TTCTGAGATTTGGTTTGGTTTCTGTGTTCTTTTGACTTTCTGAAGAAAGATGAGCTGGCGCAGGGTTTTGAAATCGGCACAGGCTCTTCTTGCTCACACC TTTCTCCTTTGCTTCACTCTCTTCCTTGTTCTTAAGCTTGATCACTATGTCTTCTGCTCTTGGTGGTTAATATTTTTACCTGTTTGGATGTTTCATGCCG TTGTGGCTCGAGGAAGGTTTTCATTACCGGCACCATCAGCTCCACGTAATCGACATTGGGCACCATGCCACGCTGTCGTTGCAACGCCATTGATTATTGC ATTTGAATCGCTCCTTTGTATATATCTCGAGAGCTTATATGTTGATGGTTATGCAGCAGTCAGTCTGAAGCTTGTGTTCCTTCCCTTACTATTATTTGAA ATCCTTATTCTCATTGACAATTTCAGGTAACTTCTTTAGGATAGTTTCCGTAAACCTTAGTTTCATTTGGTCTGTTCTTGTGTTAGGCAAATCAATGTTT ATATGAGAAACCATATGAATTCTTTGCACCTATCAGACTAGATGCTTTGTAAGTCTCTTTATTTTTCAGTCTTTCTTTTCTTCTTGGAAGTTTTTAAATA TCGATTGTTGATCATACCATCCAGTTTATGTTATGCTTTGCATTTGAAGAATAGAGTGTGAAACCCTTCAACGTAATTCATTGGTGTTAGCTCATATTTC ATCAAATATTTCTCAGCCATTTGTAACCAACAAACCAACTAATGTTTTCCGTGCAGAATGTGCAAGGCTCTCATGCCAGGGGATGAAGGAAACTTGAGTG ATGAGGCAATATGGGAAACTCTTCCTCACTTTTGGGTTGCAATCTCTATGGTCTTCTTCATTGCTGCTACAGTCTTCACACTCTTAAAACTGAGTGGTAA CAGTATTTCTTCTTAAGTTTAATAGATAGATTTTATCATTTATTCTTTATCAGTTCCTTTGTTATTATTTTTTAATGAGAGGGGATCCACTTACTCTAGG AGTAAATTAAAAAACCTACTACACATCTTAACCATCAATTCTAGGAAAATCTAACGATTTGAATTAGTTAGTAGATTTGAACCCTTTTTTAATTGATATT GTATCATGTGGTCCCTTGTGGAATATTTTTACGTACTTCCATTGTAAAGGTGAAACAGTGTATGTTTTATCTATACATTATAATTAATTGTGAACGCCTT TTAATTTACGGAAATATATATGTACGTGTACCTACTACTTTAAACTGGATTTTTACATATTTGATACAAGTACAAGCTCGGAATGATCCTACTCGAGTAT GAATATTTGACCCTTTTGTAATTTTTGATAACATCGAAGTATCGACTGATGCATTATGATTTCTTATGCTTTTTATTATGACGTTATTTTATATTCATAT GTTCATCTTTCTGTAAGCGTGACTTCGTTTTTCTTAGCTTTTACAGGTGACGTTGCTTTGGGATGGTGGGACTTGTTTATTAACTTTGCTATTGCCCAGT GCTTTGCTTTTCTTGTATGTACGAAGTGGTCTAATCCAGTCATTCATAGAAATTCTAGAGTACCCAGTTCATCTTCTACTACGATTAGAAATCTTGAGTG GAACAGTGGTTTAGTGGTTTCTTCCGAGGAAAGTGAACATGAAAACAGAGTGTGCAGCCTGCAAGACATAGGAGGTCATTTCATGAAAGTACCAGTTATT GTATTCCAGATTCTTCTTTGTATGTATCTAGAGGGAACACCTGCTTCTGCTGTATATATACCTCTTCCGGCTCTTTTCTCTCCTATTTTCATACTACAAG GCGCTGGTGTATTGTTATCTCTCTCCAAGTTGGTGGAGAAACTTGTACTGCTATTACGTAGTGGAGCTGGTGGAGGAATGTATTTTAGATTTTCTTCAAG AGTTCATGATTGTTTGGGGTTCTTGCGCCATGGTTCTAGGTTATTAGGTTGGTGGTCAATTGATGAAGGAAGTCGGGAAGAACAGGCATGCTTATACCAA GCGGGAGCATCTGGGTATAATACATTCTCTGGTTATCCTCCTGAGATTGTCAAGAAAATGCCTAAAAAGGATCTTGCTGAGGAGGTTTGGAGACTCCAGG CAGCTCTTGGCGAGCAGGCAGAAATTACGAAATACAGTCAACAGCAATATGAAAGGCTTCAAAATGTAAAACTTTTAATACTTACGAGTGCTGTATATTT TCCCAAGTTTCTTATATGATGTGTGAAGAAGCCTATATTTAAAATGTTTGCATGGTAAGCGGTATCATTTTTTATAATGATCTTTATATTTGAAATCTCT GTAAGTGTCATCAATTGCATAAACACTACATTACTGCTGAAGTCATGTTTTACCCATCTTATGCCTCAGACCTTCAGTCTTAATATTGGGAAACAAAGTT TGTCATTAATTTGAAGCTAGTGGAGATATATGACTAGGTTGATGATTGCAATAAAATGAAGTTGCACTGTATACATGAATGTTGTTTACTGCTTTATCAA GTTTCATTTTTCTAACTTTTATGCCCATACCTATTTTGAATGTACCAGGAGAAAGTGTTATGCAGAGTTTGTTTTGAGGGAGAAATTAGTGTTGTATTGC TGCCATGTAGGCATCGCGTCCTTTGCAGTGCTTGCTCAGAAAAGTGTAGTAGGTGCCCAATTTGCCGAGTCTCCATCGCAGAGCGCCTGCTTGTATATGA TGTTTAGTTGTTAACCTGGCCAACTTTGTTTAAATGAAAGTGACTACAGTTGATAGGGAAAAAATACACATCAAAAGATGGAAGAATGGAGCATATGATT TTGACTTTGCTTTTTCACACCCTTTAGATATTTGTATATATAATTTCCTATATTTTTCCATGCTATAAATGGTTGTGACCAGTATAATGAATTGTAGTCA TCACCCTCTCTTTTTTCCACTCTGGGTTTGCAACTATTATTTATAAAGAGCTAACAACTAACAACTTTGCAGCTTAATGGAATTTGAAGTGGATACTCAT GCATGAGGTGGACTCTATTATACTTCCCATTGGTAGTTTCACACTGTTATTTGCAAATCACTTAATCACCTTGCACCATCCATGGTTTAGTAATTATGGG AGATGAAGAAATGATGTGAGATTAACACAAGTCTCAGATGAACTAAATACAACCACTATGAAAATCATTCAAGGTGGGGTAAGGTTAATCCATTATGTAT TCAATACATGTGATTTACACAATGTAAAATAACAGTGCAAAGGGATGTCCTGAAAAGATTCAAAC BLAST |
| Tissue | pods |
| Gene name | LI_gene_195536; |
| Additional information | details; |
| PAB | abscising pods |
| PNAB | non-abscising pods |
| PS1 | seeds stages 1-3 |
| PS2 | seeds stages 4-6 |
| PS3 | seeds stages 7-8 |
| PW1 | pods wall stages 1-3 |
| PW2 | pods wall stages 4-6 |
| PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_478968
| Blastp | - |
|---|---|
| Blastx | Kinesin-like protein KIN-7M, chloroplastic from Arabidopsis with 53.19% of identity |
| Eggnog | - |
| Kegg | - |
| CantataDB | - |
| Mirbase | - |
| Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019463321.1) |
| Pfam | Transmembrane Fragile-X-F protein (PF10269.8) |
| Rfam | - |
| GO | - |