Ll_transcript_491907

• Id Trinity: TRINITY_DN52806_c1_g1_i10
• Name Transcript: Ll_transcript_491907
• Sequence: TGCGAAGGCACGGCAAGAGAATGGAGAAGTCGAATTGCCTGATAGAGACCGTGGGGCTGAGGCTACCCCAAGTGGAGAAGAAATACCTTCCTTGGTTAAG CCTGATGCTGTGGGGACTAACAATGTTATTCCTGGTGGAGTTCGCCTGCATCACAGAGCTGTGGTGATTGCTGCAGAGACTGGTGGAGCTTTAGGTGGCA TGGTTAGACAACTTTCAATTGATCAGTTTGAAAATGAAGGCAGGCGGGTTAGTTACGGTACTCTAGAGAATGCAACTGCTGCTAGAAAATTATTTGATCG GCAGATGTCTATCAATAGTGTGCCAAAAAAGGTCGTAGCACACCTCTTAAAGCCTCGTGGGTGGAAACCACCAGTTCGACGTCAGTTTTTCTTAGATTGC AATGAAATTGCTGATCTTTGTGATACTGTTGAGAGGATATTTTCAAGTGAACCAACTGTCTTACAACTTAGGGCTCCAATTAAAATATTTGGTGATTTAC ATGGGCAGTTTGGGGATCTTATGCGCCTCTTTGATGAGTATGGTGCACCATCGACTGCTGGTGACATAGCGTAAGTTCCTTAATTGCCATGGATGATTTT ACAAATGGATAGTTGCTGTTATAACACTAATTGTGGCCATTTTGTGTTTGTTTTCAATTAGCTAAACCCTGGGTTAGTTAGTTATTTATCTTGGTGACTA AGCATGGTGGTCAATGTATTAAGATGTCAAAGCCTGCTTTCTGTAAATAATTTTGCCAGCTGCTTTGCTACAATAGTTTGGTTTGTACATCTTTGGAGTC CCACATGAAAATGAGTGTTACATCATTAGCCTTTGTACACTTGATGTACTGTTGAGATCATATCTTTGAGCACAAGTTCCTGTGATTGATTATCTATCGC TTACATATTATAGATTTCTTACGCTCACTTTCCAATTATAGATTCATGACACTATTTTTTTAATCCAATTAGCCTAACTTGAAATTCCTTTGGTGAGTGT TTCTTGTATCAAGAATGACTTGCTAGCGCCAATGTGAATGATGATACATGTATTCCCTTCCTCAGAATGATATTAGGATGATATAACTCCATTCTTTTTA TTTATTTAATTTTTTTAATATTTGAATTTTACTCGGTATGGGATTTGACCTAACTGTTTGCATTGGATAACATAGCTCACTAGTTAGTTACTAGATTGAA GATTTAGTGAATATAAACAAATGAACTGTTACATTTCATCTAAGTTGATTAATAGTTCCCCCTCACCCACTTCCATAGCTGGTGTGTGGTTGATGTTTTG TTTATTATTACACTACAGTCTACAGACATTCATTTTTATCTTTAGCTAATCTTGTGTAAATGACTGTCAGATATATCGATTATCTATTCCTAGGAGATTA TGTTGATCGGGGCCAACACAGCCTGGAAACAATAAGCCTTCTGCTTGCTCTGAAGGTTGAATATCCAAACAACGTTCATTTAATACGTGGAAACCATGAA GCTGCTGACATTAATGCCCTTTTTGGTTTCCGAATTGAATGCATTGAGAGGATGGGTGAGAGAGATGGAATTTGGGCATGGCACCGGATAAACCGTCTGT TTAATTGGCTTCCTTTGGCAGCTCTAATTGAGAAAAAAATTATTTGCATGCATGGGGGTATTGGTCGTTCTATAAATCATGTGGAACAGATTGAAAATAT TCAGCGTCCGATTACGATGGAAGCAGGATCCATAGTGCTTATGGATCTATTGTGGTCTGATCCTACGGAGAATGACAGTGTGGAAGGATTGCGGCCAAAT GCGAGAGGTCCAGGTTTAGTTACTTTTGGGCCTGATCGTGTCATGGAATTTTGCAACAACAATGATCTTCAGCTGATTGTTCGCGCACATGAATGTGTGA TGGATGGCTTTGAGCGTTTTGCCCAGGGACATTTGATCACTCTTTTCTCAGCTACAAACTATTGTGGTACCGCAAATAATGCTGGGGCAATATTAGTTTT GGGTAGAGATCTTGTTGTTGTTCCTAAACTGATTCATCCATTACCACCTGCAATTTCTTCACCTGAAACGTCACCTGAACGTCATATTGAAGATACATGG ATGCAGGAGTTGAACGCTAACAGACCGCCGACACCGACTAGAGGTCGTCCTCAAGTAACAAATGACCGAGGTTCGCTTGCCTGGATATAGTGATAATTAA GAAAGCCCGCAATATGTATGCCGTAAGGGCTTGTGCTATCGCCTTGTTTTCTGGTGTTTGTGTATATAGCATGGTGCCATCATGGAGTATCCGAGCTTGT GATCTTAATTCCTGCCCAAAACCCGAGGTTTTCTTATAGTCTTTGTTCTCACCACTCAGTCAGCAGGCCTTTTATATGATATAAGTTCTGGAAGCAAGGT CGTTGGCCACTGCTACGTTCGCATTCACAAGGCTAGAAGTTGCTGTTTGTGTTACACCCACCTGTTGTAAATTGAGCCATGGGTACAAAATCAATGTCGT GGTTGTCTCTATCATGGATCGTCAATACTGGCTAATTTTTTCATTAATGTTTACCCATTTTTAATCATCCTCTAGGTTATTATTGTTCTGTCTTTAATAT TTTAAATCAAGAGGACACGAGAGTTTTTTTCCTTGTGATGGTGAGATATATACGTAAAATCTTTCTCGGGGGTCTATGTATCATAGTTCTCATCCATGAT CTGTATGATTAAATTTTCTTTCTGTAATTCTTAACCATGATCTGTATGATTAAATTGTGTGAATTAACATTTTCTGGCACAGAAATATGTGAATTTTGAT AGTAAACCTTGTTTGTGTTCCAC
• Tissue: pods
• Gene name: LI_gene_195806;
• Additional information: details;

Expression of Ll_transcript_491907

FPKM

• PAB: 5.5
• PNAB: 5
• PS1: 5.6
• PS2: 4.2
• PS3: 5.8
• PW1: 5.8
• PW2: 5.4
• PW3: 5.5

Labels

• PAB: abscising pods
• PNAB: non-abscising pods
• PS1: seeds stages 1-3
• PS2: seeds stages 4-6
• PS3: seeds stages 7-8
• PW1: pods wall stages 1-3
• PW2: pods wall stages 4-6
• PW3: pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_491907

• Blastp: Serine/threonine-protein phosphatase BSL3 from Arabidopsis with 88.95% of identity
• Blastx: Serine/threonine-protein phosphatase BSL3 from Arabidopsis with 96.35% of identity
• Eggnog: serine threonine-protein phosphatase(COG0639)
• Kegg: Link to kegg annotations (AT2G27210)
• CantataDB: -
• Mirbase: hvu-MIR6182 (MI0021496)
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_014493839.1)
• Pfam: -
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;