Id Trinity | TRINITY_DN52806_c1_g1_i5 |
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Name Transcript | Ll_transcript_491899 |
Sequence | TGCGAAGGCACGGCAAGAGAATGGAGAAGTCGAATTGCCTGATAGAGACCGTGGGGCTGAGGCTACCCCAAGTGGAGAAGAAATACCTTCCTTGGTTAAG CCTGATGCTGTGGGGACTAACAATGTTATTCCTGGTGGAGTTCGCCTGCATCACAGAGCTGTGGTGATTGCTGCAGAGACTGGTGGAGCTTTAGGTGGCA TGGTTAGACAACTTTCAATTGATCAGTTTGAAAATGAAGGCAGGCGGGTTAGTTACGGTACTCTAGAGAATGCAACTGCTGCTAGAAAATTATTTGATCG GCAGATGTCTATCAATAGTGTGCCAAAAAAGGTCGTAGCACACCTCTTAAAGCCTCGTGGGTGGAAACCACCAGTTCGACGTCAGTTTTTCTTAGATTGC AATGAAATTGCTGATCTTTGTGATACTGTTGAGAGGATATTTTCAAGTGAACCAACTGTCTTACAACTTAGGGCTCCAATTAAAATATTTGGTGATTTAC ATGGGCAGTTTGGGGATCTTATGCGCCTCTTTGATGAGTATGGTGCACCATCGACTGCTGGTGACATAGCGTAAGTTCCTTAATTGCCATGGATGATTTT ACAAATGGATAGTTGCTGTTATAACACTAATTGTGGCCATTTTGTGTTTGTTTTCAATTAGCTAAACCCTGGGTTAGTTAGTTATTTATCTTGGTGACTA AGCATGGTGGTCAATGTATTAAGATGTCAAAGCCTGCTTTCTGTAAATAATTTTGCCAGCTGCTTTGCTACAATAGTTTGGTTTGTACATCTTTGGAGTC CCACATGAAAATGAGTGTTACATCATTAGCCTTTGTACACTTGATGTACTGTTGAGATCATATCTTTGAGCACAAGTTCCTGTGATTGATTATCTATCGC TTACATATTATAGATTTCTTACGCTCACTTTCCAATTATAGATTCATGACACTATTTTTTTAATCCAATTAGCCTAACTTGAAATTCCTTTGGTGAGTGT TTCTTGTATCAAGAATGACTTGCTAGCGCCAATGTGAATGATGATACATGTATTCCCTTCCTCAGAATGATATTAGGATGATATAACTCCATTCTTTTTA TTTATTTAATTTTTTTAATATTTGAATTTTACTCGGTATGGGATTTGACCTAACTGTTTGCATTGGATAACATAGCTCACTAGTTAGTTACTAGATTGAA GATTTAGTGAATATAAACAAATGAACTGTTACATTTCATCTAAGTTGATTAATAGTTCCCCCTCACCCACTTCCATAGCTGGTGTGTGGTTGATGTTTTG TTTATTATTACACTACAGTCTACAGACATTCATTTTTATCTTTAGCTAATCTTGTGTAAATGACTGTCAGATATATCGATTATCTATTCCTAGGAGATTA TGTTGATCGGGGCCAACACAGCCTGGAAACAATAAGCCTTCTGCTTGCTCTGAAGGTTGAATATCCAAACAACGTTCATTTAATACGTGGAAACCATGAA GCTGCTGACATTAATGCCCTTTTTGGTTTCCGAATTGAATGCATTGAGAGGATGGGTGAGAGAGATGGAATTTGGGCATGGCACCGGATAAACCGTCTGT TTAATTGGCTTCCTTTGGCAGCTCTAATTGAGAAAAAAATTATTTGCATGCATGGGGGTATTGGTCGTTCTATAAATCATGTGGAACAGATTGAAAATAT TCAGCGTCCGATTACGATGGAAGCAGGATCCATAGTGCTTATGGATCTATTGTGGTCTGATCCTACGGAGAATGACAGTGTGGAAGGATTGCGGCCAAAT GCGAGAGGTCCAGGTTTAGTTACTTTTGGGCCTGATCGTGTCATGGAATTTTGCAACAACAATGATCTTCAGCTGATTGTTCGCGCACATGAATGTGTGA TGGATGGCTTTGAGCGTTTTGCCCAGGGACATTTGATCACTCTTTTCTCAGCTACAAACTATTGTGGTACCGCAAATAATGCTGGGGCAATATTAGTTTT GGGTAGAGATCTTGTTGTTGTTCCTAAACTGATTCATCCATTACCACCTGCAATTTCTTCACCTGAAACGTCACCTGAACGTCATATTGAAGATACATGG ATGCAGGTATTCCTTCAAATATTCTTTCTAAATGGTTGGCACCCTCTTAATGATTTCTCATACGCCTATTAAATATGCAAATATGCATGAACACGTTAAG TAAATGTTGGGCTAATCTATATATTTTGGGATTAAGCTTTCTTTCTGAACTCTGTTATTTGTATGAATATGTTTGTTGGGTTAAAACATGTACAGGAGTT GAACGCTAACAGACCGCCGACACCGACTAGAGGTCGTCCTCAAGTAACAAATGACCGAGGTTCGCTTGCCTGGATATAGTGATAATTAAGAAAGCCCGCA ATATGTATGCCGTAAGGGCTTGTGCTATCGCCTTGTTTTCTGGTGTTTGTGTATATAGCATGGTGCCATCATGGAGTATCCGAGCTTGTGATCTTAATTC CTGCCCAAAACCCGAGGTTTTCTTATAGTCTTTGTTCTCACCACTCAGTCAGCAGGCCTTTTATATGATATAAGTTCTGGAAGCAAGGTCGTTGGCCACT GCTACGTTCGCATTCACAAGGCTAGAAGTTGCTGTTTGTGTTACACCCACCTGTTGTAAATTGAGCCATGGGTACAAAATCAATGTCGTGGTTGTCTCTA TCATGGATCGTCAATACTGGCTAATTTTTTCATTAATGTTTACCCATTTTTAATCATCCTCTAGGTTATTATTGTTCTGTCTTTAATATTTTAAATCAAG AGGACACGAGAGTTTTTTTCCTTGTGATGGTGAGATATATACGTAAAATCTTTCTCGGGGGTCTATGTATCATAGTTCTCATCCATGATCTGTATGATTA AATTTTCTTTCTGTAATTCTTAACCATGATCTGTATGATTAAATTGTGTGAATTAACATTTTCTGGCACAGAAATATGTGAATTTTGATAGTAAACCTTG TTTGTGTTCCAC BLAST |
Tissue | pods |
Gene name | LI_gene_195806; |
Additional information | details; |
PAB | abscising pods |
PNAB | non-abscising pods |
PS1 | seeds stages 1-3 |
PS2 | seeds stages 4-6 |
PS3 | seeds stages 7-8 |
PW1 | pods wall stages 1-3 |
PW2 | pods wall stages 4-6 |
PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_491899
Blastp | Serine/threonine-protein phosphatase BSL3 from Arabidopsis with 88.95% of identity |
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Blastx | Serine/threonine-protein phosphatase BSL3 from Arabidopsis with 97.17% of identity |
Eggnog | serine threonine-protein phosphatase(COG0639) |
Kegg | Link to kegg annotations (AT2G27210) |
CantataDB | - |
Mirbase | hvu-MIR6182 (MI0021496) |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_014493839.1) |
Pfam | - |
Rfam | - |
GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |