Ll_transcript_491767

• Id Trinity: TRINITY_DN52808_c3_g1_i4
• Name Transcript: Ll_transcript_491767
• Sequence: TAACATCTCTATCTACAAGCACTAACTCCAACGTCTCTTGTTTTTCTCCCTTTCTCTTTCCTCTTTCTCCCTCGCGCCCATTTCGCTTTCTCTCTCTAAC TCCGATTCTCTCTCTACTTTCTCTCTCTAACTCCGATTCTCTCTCTACTTTCTCTCTCTACAATCTCTCTCCCGTTTCTCTCTCATTTCCAACGGATCAA CGATCCGAACTCAACGATTCAATCTGAACGGTTCACGAAGCTGGAATCTTCTACAAGCATTCGTTAACTCATTTTATATTGGTGTGTGGATTGAGTTTTC ATAATTTGAATGAATACCTGTTAGTCTCTTCATAAATAACATAATGGAAGATGAGGAAGAATCAAAAGAGCTGAAAATATCTGGTAATGATATAGATACT CCTGAAGTAGTAGATAGTGGTGAAAAACAATTTGTTGAGAGTCCTCATCAGGAAAATGTAAATGGCACAAGCAATATTGGCGCTGAACCTATAGATGAAA GGGTACATTTGCAAGGACTCAGTATTGACTCTGCAACGACATCTATGCATGAGGACCAGTTTGAGCATGTGTCCTTGATAGATCAAGACAAGAATAATAT TAATGAGTATGTAGATTTAAACCGTTCATCAGGTTCTGCTAATATACAACACTCATTTAGTGGAAATGCAGAGGATTCTCAAGGTTCACCTGGATCATAC TTGATAGAACATGATTCTTCACAAGGTTCTGACATGCAACATGATCATCTTTCTTATAGCCCTGGGTCAGAAGGGAGTTTAGGTCACACAAGGAAGCAGT CTGCCTCATCATTTAGTTTTGATTCTGCTGGATACTCTACTGCTGATTCTCTACCAAAGCCTAGGCAAAAGCATGCTAAGCCAAACGTGTCTCCAGAATT ACTGCATTTAGTTGATTCAGCTATTATGGGAAAAGTTGAAGGTATGGATAAGCTGAAGAATATTGCAAGTGGGGCAGAAATTTTTCAGAGTGATGAAGAA ATGGATAGTGTGCCTTTTGTAATAGTAGATTCCCTTCTTGCAACAATGGGTGGTGTTGAAAGTTTTGAAGAGGATGAAGATGATAATCCTCCTAGTGTAA TGCTGAACTCCCGAGCTGCTATTGTGGCAGGTGAACTTATTCCTTGGCTTCCTTATGTAGGTGATACTGACAATGTCATGTCACCAAGGACACAGATGGT TCGTGGACTACTTGCTATATTACGGGCTTGCACTAGAAACAGAGCAATGTGCTCAACGGCTGGTCTGTTAGATATATTGTTGAGAACAGCAGAGAAGATT TTTACAATGGATGTTGACTTAAATGGGCAAATGAGGTGGGATGGAACTCCTTTGTGCCACTGCATACAATACTTAGCTGGCCATTCTCTTAGTGTTAGTG ATCTTCATACATGGTTTCAAGTCATTACAAAAACCCTCACCACAATTTGGTCTCAGCGGTTAATGCTAGCATTGGAGCAAGCAATAAGTGGAAAGGAGTC AAGAGGACCAGCTTGCACCTTTGAGTTTGATGGTGAAAGCTCTGGTTTGCTTGGTCCAGGTGAAAGCCGTTGGCCATTTATCAATGGGTATGCTTTTGCA ACATGGATCTACATTGAGTCATTCGCAGACACATTGAATACAGCTACAGTTGCTGCTGCAATTGCTGCAGCTGCAGCGGCTAGGTCTGGTAAATCATCAG CTATGTCAGCTGCCGCTGCTGCTAGTGCACTTGCTGGTGAAGGTACAGCCCACATGCCACGACTATTTAGTTTTTTATCTGGTGATAATCAGGGTATAGA GGCTTATTTTCATGCTCAATTTTTGGTTCTTGAAACTTCTAGTGGAAAGGGAAAGAAGTCTTCTTTGCATTTTACCTACCCTTTCAAACCACAATGTTGG TACTTCATTGCCCTTGAACATATTAGCAAGCATGGAATTCTTGGGAAATCAGAAAGTGAAGTTAGGTTATATGTAGATGGATCTTTATATGAAAGTCGTC CCTTTGACTTCCCTAGAATTTCGAAATCCCTTGCATTTTGCTGCATAGGAACTAACCCTCCTCCTACTATGGCGGGTTTGCAACGCCGACGTCGTCAGTG CCCTTTGTTTGCTGAGATGGGCCCTGTTTACATCTTCAAGGAACCAATTGGCCCAGAAAGAATGACACGCTTGGCTTTTAGAGGAGGGGATGTAGTTCCT TCTTTTGGTACTGCAGCGGGGCAACCATGGCGATCTACAAATTCTCATGTACAGAGCATGGCAGAGGAAAGTGTTCTTTTGGATGCAGAAATTGGAGGTT GCATTCATCTGCTGTATCATCCTAGTTTGCTCAGTGGGCGTTTTTGCCCAGATGCTTCACCTTCTGGTGCTGCAGGAATGCTTCGACGCCCGGCTGAGGT TCTTGGGCAAGTCCATGTTGCTACACGAATGCGACCTGTGGATGCTTTGTGGGCATTGGCCTATGGTGGTCCCTTGTCTTTGCTTCCCTTGACAGTAAGC AATGTACTCGAGGATACTTTGGAACCAATTCAAGGGGATTTGCTTCTGTCTTCAGCCACTACATCTCTTGCTGCCCCAATAATTCGAATTATATCCATGG CTATTCAAAATCCAAAGAACAATGAAGAGTTGTCTCGTGGTAGAGGGCCTGAGGTTCTGTCAAAAATTTTGAATTATCTTCTCCAAACCTTATCAGGCTT ATCTTTGCATGATGTTAGAAAGCATGATGGTGGAAGAGACGAGGAACTCATTGCTGCTGTTGTCTCCCTTTGTCAATCTCAGAAGATGAACCATACACTT AATGCACAACTCTTCACCACACTGCTGTTAGATTTAAAAATTTGGAGTTTGTGTAGTTATGGCATACAAAAGAAGCTCATATCATCACTTGCAGACATGG TTTTCACAGCGTCAAGAGTAATGCGAGATGCTAATGCCATTCAGATGCTTCTTGATGGCTGCAGAAGATGTTATTGGACTGTTCCTGAAATTGACTCGTT GAATACTTTTTCTCAAACAAGGGAAGCACGTCCTGTAGGTGAAATCAATGCTTTGGTTGATGAGCTCTTAGTGGTAATTGAACTTCTAATTGTGTCCGGA TCTCCTTCACTGGCCTCAGACGATGTCCGTTGTTTGCTTGGGTTCATAGTTGACTGTCCGCAACTTAATCAGGTTGCTAGGGTGTTGCATCTCTTCTACA GGTTGTTTGTCCAGCCAAATACATCTAGAGCTCAAACATTTGCAGAAGCATTTCTAGCATGTGGTGGGGTAGAAACTCTTCTTGTTTTGCTCCAGAGGGA ATCTAAAGCTGGAGATGGTAGTGTTCTGGATTCATTGTCAAAGAATTCTGAACCAAAAAAAACTGAGATTAACCAGAATGGTGATGAATCAGAGGAGAAA ATCGAATCCATCTTACTTGAAAATGATCAAATGTCTCAATCTGTTGATAGTGACAATTGCCCTGATCCTAGTTTTCCTGATGTTAACAATGACAAGATGA CATTTACCTCTGAAATTCCTTCTATTAAGAATTTGGGTGGCATAAGTCTATCCATTAGTGCTGAAAATGCCCGAAAAAATGTATACAATGCTGATAAAAA CGATGGCGTTGTTGTTGGGATCATAAATCTATTAGGCGCTTTAGTAGCTTCAGGACATCTGAGATTTGGTTCCCATGCTGGTCCTGGTACAACAAGCAAC ATTTTGAGTGTTGGAATCCAAGATGGGGGTAGTTCAATGTTTGAAGACAAGGTTTCTCTTCTGCTTTATGCTTTACAGAAGGCTTTTCAAGCTGCACCCA ACAGGCTAATGACTAACAATGTTTACACAGCTTTGTTGGCTGCCTCGATCAATGCCTCTTCGTCAGAGGATGGGCTAAACTTCTATGATTCTGGTCATCG CTTTGAGCATTCACAACTTTTGTTGGTGCTTTTGCGTTCCCTTCCATTTGCACCTAGGTCTCTTCAGAGCAGAGCACTCCAGGATATTCTATTTTTGGCC TGCAGTCATCATGAAAACAGAAGCAGTCTGATAAACATGGAGGAATGGCCTGAATGGATTTTGGAAGTCCTGATCTCAAACTACGAGAAGGGTCCCAGTA AATTGTCTGATTCAACAAGTGTTGGAGACATTGAAGACCTTATACATAACTTTATTATTATCATGCTAGAGCATTCAATGCGCCAAAAAGATGGATGGAA GGATATTGAAGCGACAATTCATTGTGCAGAATGGCTGTCTATTGTTGGTGGATCTAGCACTGGAGAACAGCGAATAAGGCGTGAAGAAGCATTGCCTATA TTTAAGAGGAGACTATTAGGCGACTTACTGGACTTTGCTGCTAGAGAATTGCAGGTTCAGACTCAAATTATTGCTGCGGCTGCTGCTGGTGTTGCTGCTG ACTGTCTGTCACCAAAAGATGCCAAGGCTGAGGCTGAGAATGCTGCCCAGCTGTCTGTGTCTTTAGTAGAAAATGCGATTGTAATACTTATGCTTGTTGA GGATCATTTACGGTTACAAAGCAAACGATTCTCTTCAAATTCTGCAGATGGTTCTCAATATCCTCTTTCTCATGTGTATCCAATCGATAATCGTTCGAAT TCATTGTCAACAATAGATGAATCAGAAGTTATGGAAAACAACAAATCATTATCCAGTGACTCTGGGGGAGTCCCAATTGATGTCCTTTCTTCATCGGCTG ATAGAAGTGGTCAGATTCCTAATTCAGTGACGGAAAGGCTTGCTACAGCTGCAGCAGCTGAGCCTTATGAATCTGTTTCTTGTGCTTTTGTATCATATGG CTCCTATGCTAAGGATTTGGCTGATGGCTGGAGATATAGGAGCCGTTTGTGGTATGGTGTTGGCCTTCCACCGAATACAACTCCATTTGGCGGTGGAGGT AGTGGATGGGATGTTTGGAAATCTGCTTTAGAGAAAGATGCTGATGGCAACTGGCTTGAGCTTCCTTTGGTGAAGAAGTCTGTGGCAATGCTCCAAGCTT TATTGTTAGATGAATCCGGGCTTGGTGGTGGTCTTGGCATAGGTGGGGGTTCTGGTACTGGAATGGGAGGGATGGCTGCGTTGTACCAGCTATTAGACAG TGATCAACCATTCCTGTGCATGCTTCGAATGGTTCTTCTATCGATGAGAGAAGATGATGATGGGGAAGACCATATGCTGATGAGAAATGCAAGTATTGTT GATGCAGTGTCTGAAGGAAGAAAACCACGCTCAGCACTTTTGTGGAGTGTTCTCTCACCTGTTCTCAACATGCCAATTTCTGATTCTAAGAGACAAAGAG TCTTGGTCACATCTTGTGTTCTTTATTCCGAGGTATACCATACTGTTAGCAGAGACCAAATTCCTCTTCGTAAGCAGTACCTTGAGGCTATTTTACCACC ATTTGTTGCTGTCTTAAGGAGGTGGCGACCCCTTTTGGCTGGAATTCAAGAACTTGCAACTGCTGATGGTTTGAATCCTTTTACTGTGGATGATCCCACA CTGGCTGCTGATGCCCTTCCGCTTGAGGCTGCTCTTGCTATGATAACTCCAGCCTGGGCTGCTGCTTTTGCATCCCCACCTGCTGCAATGGCCTTGGCTA TGATTGCGGCTGGTACGTCAGGTGGTGAAAGCCAAGCTCGTTCAACAAATGCCCATCTTAGGCGTGATACGTCATTACTTGAACGCAAACAAGCTAAGCT TCAAACATTTTCAAGTTTTCAACAACCTCTTGAAGCCCCTAATAAAACACCACCCCTACCCAAGGACAAAGCTGCTGCTTTGGCAGCTGCTCGTGATCTT CAAAGATTTTCTAAGATTGGTTCTGGAAGAGGTCTTAGTGCTGTTGCTATGGCTACATCTGCACAGCGAAGGAATGCTAGTGATATGGAGCGAGTTAAGA GGTGGAATTTTACAGAAGCAATGGGAGTTGCCTGGATGGAATGTTTGCACCCAGTTGATACAAAGTCGGTGTATGAGAAAGATTTTAATGCTTTGTCATA TAAATTTATTGCTGTTCTTGTTGCCAGTTTTGCCCTAGCAAGGAATATGCAACGATCTGAGATTGACAGGCGTGCTCAAGT
• Tissue: pods
• Gene name: LI_gene_195822;
• Additional information: details;

Expression of Ll_transcript_491767

FPKM

• PAB: 0.3
• PNAB: 7.1
• PS1: 5.3
• PS2: 2.7
• PS3: 3.6
• PW1: 5
• PW2: 5.6
• PW3: 2.6

Labels

• PAB: abscising pods
• PNAB: non-abscising pods
• PS1: seeds stages 1-3
• PS2: seeds stages 4-6
• PS3: seeds stages 7-8
• PW1: pods wall stages 1-3
• PW2: pods wall stages 4-6
• PW3: pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_491767

• Blastp: BEACH domain-containing protein C2 from Arabidopsis with 66.38% of identity
• Blastx: BEACH domain-containing protein C2 from Arabidopsis with 66.4% of identity
• Eggnog: beige BEACH domain containing protein(ENOG410XNQC)
• Kegg: Link to kegg annotations (AT2G45540)
• CantataDB: Link to cantataDB annotations (CNT0001256)
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019412872.1)
• Pfam: Domain of unknown function (DUF4704) (PF15787.4)
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;