Ll_transcript_493289

• Id Trinity: TRINITY_DN52852_c2_g1_i2
• Name Transcript: Ll_transcript_493289
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• Tissue: pods
• Gene name: LI_gene_196263;
• Additional information: -

Expression of Ll_transcript_493289

FPKM

• PAB: 0.1
• PNAB: 1
• PS1: 0.6
• PS2: 0.6
• PS3: 0.5
• PW1: 0.4
• PW2: 0.4
• PW3: 0.4

Labels

• PAB: abscising pods
• PNAB: non-abscising pods
• PS1: seeds stages 1-3
• PS2: seeds stages 4-6
• PS3: seeds stages 7-8
• PW1: pods wall stages 1-3
• PW2: pods wall stages 4-6
• PW3: pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_493289

• Blastp: Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon TNT 1-94 from Nicotiana with 44.97% of identity
• Blastx: Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon TNT 1-94 from Nicotiana with 40.71% of identity
• Eggnog: -
• Kegg: -
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_020987654.1)
• Pfam: Reverse transcriptase (RNA-dependent DNA polymerase) (PF07727.13)
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;